有一种基因叫理想读后感
有一种基因叫理想 读后感 _如何查找一个基因的启动子序列 如何查找一个基因的启动子序列如何查找一个基因的启动子序列定义:启动子是参与特定基因转录及其调控的 DNA 序列。 包含核心启动子区域和调控区域。核心启动子区域产生基础 水平的转录,调控区域能够对不同的环境条件作出应答,对 基因的表达水平做出相应的调节。 区域:启动子的范围非常大,可以包含转录起始位点上游 2000bp, 有些特定基因的转录区内部也存在着转录因子的结 合位点,因此也属于启动子范围。南京妇幼保健院乳腺科刘 小丰 这项搜寻要从 UCSC 基因组浏览器开始,网址为 -bin/hgGateway。 以编码 pendrin (PDS)的基因为例来说明上述问题。 PDS 与耳蜗的异常发育、 感觉神经性听力下降以及弥散性甲状腺增大(甲状腺肿)有 关。 进入 UCSC 的主页后, 在 Organism 的下拉菜单中选择 Human,然后点击 Browser。使用者现在到了人类基因组浏 览器入口。本例的搜寻很简单:在 assembly 的下拉菜单中 选择 Dec. 2001,在 position 框中键入 pendrin,然后点击 Submit。 返回的页面结果显示一个已知的基因和两个 mRNA序列。继续点击 mRNA 序列的登录号 AF030880,出现包含 这个 mRNA 区域的图解概要。 为了获得这个区域更清晰的图 像,点击紧靠 zoom out 的 1.5X 按钮。最后点击页面中部的 reset all 按钮,使各个路径的设置恢复默认状态。 然而,对于本例的搜寻目的来说,默认设置不是理想的 设置。按照视图利用页面底部的 Track Controls 按纽,将一 些路径设置为 hide 模式(即不显示) ,其他设置为 dense 模 式(所有资料密集在一条直线上) ;另一些路径设置为 full 模式(每个特征有一个分开的线条,最多达 300) 。在考虑这 些路径内究竟存在那些资料之前,对这些路径的内容和表现 做一个简要的讨论是必要的,许多这些讨论是由外界提供给 UCSC 的。下面是对基因预测方法的更进一步讨论,这些信 息也可以在其他地方找到。 对于 Known Genes(已知基因)和预测的基因路径来 说,一般的惯例是以一个高的垂直线或块状表示每个编码外 显子,以短的垂直线或块状表示 5u2032端和 3u2032端 非翻译区。 起连接作用的内含子以非常细的线条表示。翻译的方向 由沿着细线的箭头指示。 Known Genes 来自 LocusLink 内的 mRNA 参照序列, 已经利用 BLAT 程序将这些序列与基因组序列进行比对排列。 Acembly Gene Predictions With Alt-splicing 路径是利用 Acembly 程序将人类 mRNA 和 EST 序列数据与人类基因 组序列进行比对排列而来的。 Acembly 程序试图找到 mRNA 与基因组序列的最好的比对排列以及判断选择性剪接模型。 假如有多于 1 个的基因模型具有统计学意义,则它们都全部 显示出来。 有关 Acembly 的更多信息可以在 NCBI 的网站找 到(.gov/IEB/Research/Acembly/) 。 Ensembl Gene Predictions 路径由 Ensembl 提供。 Ensembl 基因通过许多方法来预测,包括与已知 mRNA 和 蛋白质进行同源性比较,ab initio 基因预测使用 GENSCAN 和基因预测 HMMs。 .uk/ensembl/ Fgenesh++ Gene Predictions 路径通过寻找基因的结构特 征来预测基因内部的外显子,例如剪接位点的给位和受位的 结构特征,利用一种动态的程序算法推定编码区域和推定外 显子 5u2032端和 3u2032端的内含子区域;这个方法也 考虑到蛋白质相似性的资料。 Genscan Gene Predictions 路径由 GENSCAN 方法衍 生而来,通过这个方法,可以确定内含子、外显子、启动子 区域和 poly(A)信号。 此时, 这个方法并不期望查询的序列只 出现 1 个基因,因此可以对部分基因或被基因之间的 DNA 分隔的多个基因进行准确的预测。 Human mRNAs from Genbank 路径显示基因库的人类 mRNAs 与基因组序列的比对排列。Spliced ESTs 和 Human EST 路径显示来自 GenBank 的 ESTs 序列与基因组的序列对齐比较。由于 ESTs 通常代 表了转录基因的片断, 一个 EST 很有可能对应于某个外显子 区。 最后, Repeating Elements by RepeatMasker 这个路径 显示的是重复元件,例如散在的或长或短的核元素(SINEs 和 LINEs),长末端重复序列(LTRs)和低复杂性区域 (.edu/cgi-bin/Rep eatMasker)。一般来说,在将基因预测方法应用于核苷酸序 列之前,需要去掉或掩饰这些成分。 回到视图显示的例子,可以看到大多数路径返回了几乎 同样的基因预测结果。作为一个规则,通过多种方法预测的 外显子提高了预测的正确率而不会出现“假阳性 ”结果。多数方法显示 3u2032端非翻译区,以左侧 大而短的块状表示。Acembly 路径显示除了全长序列产物 (如这个部分第 3 条线所示)之外还有 3 个可能的选择性剪 接,其它大多数路径显示与此预测结果相符。Genscan 路径 从左、右方向往远处延伸:GENSCAN 可以被用于预测多个 基因。 尽管这些图解概要很有用,然而研究者更需要与这些垂 直线或块状相对应的序列。以此为例,用 Fgenesh++预测作 为获得原始序列数据的基础,但不管选择哪个路径其步骤都是一样的。 点击标有 Fgenesh++ Gene Predictions 的路径, 出现的是一个描述预测的概要页面。 序列的区域与 pendrin 基因相似(从这个例子一开始就 已经知道了) 。给出了序列的大小及序列开始和结束的预测, 并显示预测是以负链为基础的。想要获得序列,点击 Genomic Sequence。使用者将被带到一个标题为 Get Genomic Sequence Near Gene 的查询页面,在这个页面上, 可以获得转录物、 编码区、 启动子或转录物加启动子的序列。 点击 Transcript 返回的页面显示完整的转录子,外显子 以大写字母表示。 点击 Coding Region Only 得到的是编码区,外显子以大 写字母表示。 点击 Transcript + Promoter,返回的页面显示的是在上 述选择 Transcript 所获序列的 5u2032端添加了启动子序 列, 以大写字母表示外显子。 启动子的长度显示在文本框内。 点击 Promoter 返回的页面正好是启动子区2 基因启动子序列的预测分析 真核细胞的基因表达调节虽然是多个水平的调节,但主要是 转录水平的调节. 转录水平的调节基础就是转录因子蛋白与 启动子 DNA 序列之间的结合和激活. 转录因子蛋白的结构 可以分成结合域(BD,binding domain)以及激活域(AD,activation domain). 作为基因启动子 DNA 的序列也具有特 征性的结构. 但是相比较而言,目前基因启动子以及转录因 子蛋白结合的种类,积累的资料还十分有限,数据库容量偏 小,计算技术相对滞后,其预测结果仅供参考,还必须结合 其他的分子生物学技术进行证实. 一般情况下,确定了一种新基因的编码区序列之后,通 过与 htgs 数据库的同源性比对, 可以很方便地确定其相应的 基因组 DNA 序列. 在确定编码基因的起始密码子之后, 指导 基因表达的启动子序列一般位于其上游基因序列 300-3 000 nt 之间,鲜有例外. 可以从翻译起始密码子上有的基因组 DNA 序列,选取 3 000 nt 左右的核苷酸序列进行生物信息 学分析. 例如可以应用在线软件分析技术,或自行研发的启 动子序列分析技术等软件分析,如: .dk/services/promoter/、 -bin/seq_tools/promoter.pl, .gov/molbio/proscan/等. 根据这些软件 分析的结果,首先确定进行缺失突变体构建时应该采用的引 物序列,如果一段序列的缺失导致报告基因表达水平的升高, 那么说明这一段基因序列存在着启动子的静息子(silencer) 的序列,对于基因的表达水平具有负调节作用. 通过逐步缺 失的策略, 最终确定启动子 DNA 的核心序列. 报告基因表达 载体的构建以及细胞转染技术,仍然是目前研究基因启动子序列活性最为基本的方法. 研究转录因子蛋白的结合及其对基因表达水平的调节作 用和性质有许多技术,但是利用生物信息学技术预测的启动 子 DNA 序列的结合的转录因子蛋白结果只有部分参考的意 义. 凝胶迟滞(gel shift)试验、超级迁移实验(super shift)、竞 争性结合实验、酵母单杂交技术(yeast one hybrid)、噬菌体 展示技术(phage display)等在转录因子蛋白与启动子 DNA 序列结合的研究中具有重要应用前景. 干扰素u03b3增强 GH3 细胞中人生长激素基因表达机制 干扰素u03b3,生长激素基因启动子,GH3 细胞,荧光素酶报 告基因 interferon-u03b3,hGH gene promoter,GH3 cell line,luciferase reporter gene 为了研究干扰素u03b3(IFN-r) 对大鼠垂体 GH3 细胞中人生长激素(hGH)基因启动子活性 的影响及其可能的作用机制,采用荧光素酶报告基因方法, 将含 hGH 基因启动子(-484~2bp)和荧光素酶报告基因的表 达质粒 pGL3-484-Luc 单独转染或与垂体特异性核转录因子 Pit-1 蛋白表达质粒(pcDNA-Pit-1-cDNA)或 Pit-1 反义寡核苷 酸(Pit-1 OND)共转染於大鼠垂体 GH3 细胞中,观察加入 IFNu03b3及细胞内信号转导途径的抑制剂後 GH3 细胞中 荧光素酶表达的变化,反映其对 hGH 启动子活性的影响; 将含不同长度 hGH 基因启动子序列的荧光素酶表达质粒 pGL3-380-Luc(-380~2bp)、pGL3-250-Luc(-250~2bp)、pGL3-132-Luc(-132~2bp)和 pGL3-66-Luc(-66~2bp)分别转 染 GH3 细胞,观察它们对 IFN-u03b3的反应,以寻找 IFN-u03b3影响 hGH 基因启动子活性的关键序列。结果表 明,IFN-u03b3(10^5u/L, 10^6u/L)均能促进大鼠垂体 GH3 细胞中荧光素酶的表达,最高达对照组的 131%(P<0.001); 在胞内信号转导抑制剂中, 只有丝裂原活化蛋白激酶(MAPK) 信号转导途径抑制剂 PD98059(40u03bcmol/L),能完全阻 断 IFN-u03b3的促进作用;Pit-1 蛋白过表达和表达被抑制 对 IFNu03b3的促进作用没有影响;含不同长度 hGH 基因 启动子序列质粒中,只有 pGL3-380-Luc 和 pGL3-250-Luc 仍具有对 IFN-u03b3的反应性。这说明 IFN-u03b3能增强 大鼠垂体 GH3 细胞中 hGH 基因的启动子的活性,此作用可 能是通过激活细胞内依赖 MAPK 的途径完成的,并与 hGH 基因上游-250~-132bp 启动子序列密切相关,但与垂体特异 性核转录因子 Pit-1 蛋白关系不大。 The method of luciferase reporter gene was used to investigate the effect of interferon-u03b3 (IFN-u03b3) on the activity of human growth hormone (hGH) gene promoter in rat pituitary GH3 cells, to elucidate the post-receptor signal transduction pathway and the key promoter sequence which mediated the action of IFN-u03b3. The luciferase expression plasmidpGL3-484-Luc containing hGH gene promoter (-484-2bp) and luciferase reporter gene were transfected alone or cotransfected with pituitary-specific transcription factor Pit-1 expression plasmid (PcDNA-Pit-1-cDNA) or Pit-1 antisense oligonucleotide (Pit-1 OND) into rat GH3 cells. The changes of luciferase expression in the GH3 cells were determined, after treatment with IFN-u03b3 or IFN-u03b3 plus inhibitors of intracellular signaling pathways, to observe the effect of IFN-u03b3 and these inhibitors on the activity of hGH gene promoter. The various deletion constructs of Luc-reporter: pGL3-380-Luc, pGL3-250-Luc, pGL3-132-Luc and pGL3-66-Luc, which contained the -380-2bp, -250-2bp, -132-2bp and -66-2bp sequences of hGH gene promoter, respectively, were transfected into GH3 cells, then the changes of luciferase expression in the GH3 cells were assayed, after treatment with IFN-u03b3, to find out the key sequence which mediated the action of IFN-u03b3. Our results showed that IFN-7 (10^5u/L, 10^6u/L) could increase luciferase expression in GH3 cells transfected with pGL3-484-Luc alone, the maximal action being 131% of the control (P<0.001). Among the inhibitors of intracellular signalingtransduction pathways, only mitogen-activated protein kinases (MAPK) inhibitor PD98059 (40u03bcmol/L) could completely blocked the stimulatory effect of IFN-u03b3 on hGH gene promoter activity. Pit- overexpression or inhibited Pit-1 expression, both had no effect on IFN-7-induced hGH gene promoter activity. When various deletion constructs of Luc-reporter were transfected into GH3 cells, only pGL3-380-Luc and pGL3-250-Luc still responded to IFN-u03b3. In conclusion, IFN-u03b3 could increase the activity of hGH gene promoter in rat pituitary GH3 cells. This stimulatory effect of IFN-u03b3 may be associated with the intracellular MAPK signaling pathway and with -252--132bp sequence in hGH gene promoter, but had no relationship with pituitary-specific transcription factor Pit-1. 有一种基因叫理想读后感_如何查找一个基因的启动子序列 如何查找一个基因的启动子序列 关键词: 基因 件 启动子序列 软定义:启动子是参与特定基因转录及其调控的 DNA 序列。包含核心 启动子区域和调控区域。 核心启动子区域产生基础水平的转录,调控区域能够对 不同的环境条件作出应答,对基因的表达水平做出相应的调节。 区域:启动子的范围非常大,可以包含转录起始位点上游 2000bp, 有些特定基因的转录区内部也存在着转录因子的结合位点, 因此也属于启动子范 围。 这项搜寻要从 UCSC 基因组浏览器开始,网址为 。 以编码 pendrin (PDS)的基因为例来说明上述问题。PDS 与耳蜗的异常发育、感 觉神经性听力下降以及弥散性甲状腺增大(甲状腺肿)有关。 进入 UCSC 的主页后,在 Organism 的下拉菜单中选择 Human,然后点击 Browser。使用者现在到了人类基因组浏览器入口。本例的搜寻很简单:在 assembly 的下拉菜单中选择 Dec. 2001,在 position 框中键入 pendrin,然后 点击 Submit。返回的页面结果显示一个已知的基因和两个 mRNA 序列。继续点击 mRNA 序列的登录号 AF030880, 出现包含这个 mRNA 区域的图解概要。为了获得这 个区域更清晰的图像,点击紧靠 zoom out 的 1.5X 按钮。最后点击页面中部的 reset all 按钮,使各个路径的设置恢复默认状态。 然而,对于本例的搜寻目的来说,默认设置不是理想的设置。按照视图 利用页面底部的 Track Controls 按纽, 将一些路径设置为 hide 模式 (即不显示) , 其他设置为 dense 模式 (所有资料密集在一条直线上) ; 另一些路径设置为 full 模式(每个特征有一个分开的线条,最多达 300)。在考虑这些路径内究竟存在 那些资料之前, 对这些路径的内容和表现做一个简要的讨论是必要的,许多这些 讨论是由外界提供给 UCSC 的。下面是对基因预测方法的更进一步讨论,这些信 息也可以在其他地方找到。 对于 Known Genes(已知基因)和预测的基因路径来说,一般的惯例是 以一个高的垂直线或块状表示每个编码外显子,以短的垂直线或块状表示 5′端 和 3′端非翻译区。 起连接作用的内含子以非常细的线条表示。 翻译的方向由沿着细线的箭 头指示。 Known Genes 来自 LocusLink 内的 mRNA 参照序列,已经利用 BLAT 程序 将这些序列与基因组序列进行比对排列。Acembly Gene Predictions With Alt-splicing 路径是利用 Acembly 程序将人类 mRNA 和 EST 序列数据与人类基因组序列进行比对排列而来的。 Acembly 程序试图找到 mRNA 与基因组序列的最好的比对排列以及判断选择性剪 接模型。假如有多于 1 个的基因模型具有统计学意义,则它们都全部显示出来。 有关 Acembly 的更多信息可以在 NCBI 的网站找到 (.gov/IEB/Research/Acembly/)。 Ensembl Gene Predictions 路径由 Ensembl 提供。Ensembl 基因通过许 多方法来预测,包括与已知 mRNA 和蛋白质进行同源性比较,ab initio 基因预 测使用 GENSCAN 和基因预测 HMMs。 .uk/ensembl/ Fgenesh++ Gene Predictions 路径通过寻找基因的结构特征来预测基 因内部的外显子, 例如剪接位点的给位和受位的结构特征,利用一种动态的程序 算法推定编码区域和推定外显子 5′端和 3′端的内含子区域;这个方法也考虑 到蛋白质相似性的资料。 Genscan Gene Predictions 路径由 GENSCAN 方法衍生而来,通过这个 方法,可以确定内含子、外显子、启动子区域和 poly(A)信号。此时,这个方法 并不期望查询的序列只出现 1 个基因,因此可以对部分基因或被基因之间的 DNA 分隔的多个基因进行准确的预测。 Human mRNAs from Genbank 路径显示基因库的人类 mRNAs 与基因组序 列的比对排列。 Spliced ESTs 和 Human EST 路径显示来自 GenBank 的 ESTs 序列与基因 组的序列对齐比较。由于 ESTs 通常代表了转录基因的片断,一个 EST 很有可能 对应于某个外显子区。 最后,Repeating Elements by RepeatMasker 这个路径显示的是重复 元件,例如散在的或长或短的核元素(SINEs 和 LINEs),长末端重复序列(LTRs) 和低复杂性区域 (.edu/cgi-bin/RepeatMasker)。 一般 来说,在将基因预测方法应用于核苷酸序列之前,需要去掉或掩饰这些成分。 回到视图显示的例子, 可以看到大多数路径返回了几乎同样的基因预测 结果。 作为一个规则,通过多种方法预测的外显子提高了预测的正确率而不会出 现“假阳性”结果。多数方法显示 3′端非翻译区,以左侧大而短的块状表示。 Acembly 路径显示除了全长序列产物(如这个部分第 3 条线所示)之外还有 3 个 可能的选择性剪接, 其它大多数路径显示与此预测结果相符。 Genscan 路径从左、 右方向往远处延伸:GENSCAN 可以被用于预测多个基因。 尽管这些图解概要很有用, 然而研究者更需要与这些垂直线或块状相对 应的序列。以此为例,用 Fgenesh++预测作为获得原始序列数据的基础,但不管 选择哪个路径其步骤都是一样的。点击标有 Fgenesh++ Gene Predictions 的路 径,出现的是一个描述预测的概要页面。序列的区域与 pendrin 基因相似(从这个例子一开始就已经知道了)。 给出了序列的大小及序列开始和结束的预测,并显示预测是以负链为基础的。想 要获得序列,点击 Genomic Sequence。使用者将被带到一个标题为 Get Genomic Sequence Near Gene 的查询页面,在这个页面上,可以获得转录物、编码区、 启动子或转录物加启动子的序列。 点击 Transcript 返回的页面显示完整的转录子,外显子以大写字母表 示。 点击 Coding Region Only 得到的是编码区,外显子以大写字母表示。 点击 Transcript + Promoter,返回的页面显示的是在上述选择 Transcript 所获序列的 5′端添加了启动子序列,以大写字母表示外显子。启动 子的长度显示在文本框内。 点击 Promoter 返回的页面正好是启动子区
荧光素酶报告基因的结果在什么范围算是阳性
只能先就标题的问题谈谈我的认识。后面的追问我了解得也不全面。1。两者的结果检测方法不同。gfp绿色荧光蛋白,很直观,能够直接检到荧光,在普通的细胞培养条件下都能够观察到,对细胞的生命活动和其他并行的实验安排影响很小。荧光素酶报告基因使用起来比gfp多一个步骤,因为荧光素酶是个酶,不发荧光,发荧光的是它的底物,荧光素。荧光素在细胞里(要说萤火虫细胞我就不知道了哦)是没有的。所以检测荧光素酶的通常步骤是裂解细胞,释放荧光素酶,与荧光素及其他所需化学物质混合,才得到荧光。现在虽然也有活细胞内检测荧光素酶的手段,但要将荧光素送入活细胞,本身就已要对细胞进行相当的干扰。所以一般来说荧光素酶实验的同一批细胞不适合再做其他并行实验。2。两者的结果含义不同。gfp如果说是定量检测表达蛋白的话,这个定量只能够指,表达的细胞是多少个,不表达的细胞是多少个。gfp对于单个细胞来说,就有阳性和阴性两种结果罢了。gfp不能够定量地告诉你,这个/群细胞里的表达量是多高还是多低。荧光素酶就能够定量地得到表达量/表达水平的数值,但这个数值是相对于一群细胞来说,而不是对于单个细胞。所以荧光素酶常常用来研究启动子的功能与调控,因为启动子对基因表达的调控可以是渐变的,而不是简单的开和关两种状态。
基因表达调控研究中主要实验技术有哪些
基因表达调控主要实验技术有:ChIP、RIP、RNA pull-down、EMSA、Luciferase 1、 ChIP实验 通过与染色质片段共沉淀和PCR技术,在体内检测与特异蛋白质结合的DNA片段。将处于适当生长时期的活细胞用甲醛交联后将细胞裂解, 染色体分离并打碎为一定大小的片段200bp-1000bp;然后用特异性抗体免疫沉淀目标蛋白与 DNA交联的复合物, 对特定靶蛋白与DNA片段进行富集。采用低pH值条件反交联, DNA与蛋白质之间的 Schiff键水解, 释放DNA片段。通过对目标片段的纯化与检测,获得DNA与蛋白质相互作用的序列信息。 2、 RIP实验 RIP技术(RNA BindingProtein Immunoprecipitation,RNA结合蛋白免疫沉淀),是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术。运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,然后经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行分析;即用抗体或表位标记物捕获细胞核内或细胞质中内源性的RNA结合蛋白,防止非特异性的RNA的结合,免疫沉淀把RNA结合蛋白及其结合的RNA一起分离出来,结合的RNA序列通过microarray(RIP-Chip),定量RT-PCR或高通量测序(RIP-Seq)方法来鉴定。是了解转录后调控网络动态过程的有力工具,能帮助我们发现miRNA的调节靶点。 3 、RNA pull-down实验 使用体外转录法标记生物素RNA探针,然后与胞浆蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过western blot实验检测特定的RNA结合蛋白是否与RNA相互作用。 4 、EMSA实验 凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA-electrophoreticmobility shift assay)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用、DNA定性和定量分析。生物素标记的探针依研究的结合蛋白的不同,可是双链或者是单链。 5、 Luciferase实验 荧光素酶(Luciferase)是自然界中能够产生生物发光的酶的统称,不同的能够控制发光的生物体用不同的荧光素酶来催化不同的发光反应。 萤光生成反应通常分为以下两步: 萤光素+ ATP→ 萤光素化腺苷酸(luciferyladenylate)+ PPi 萤光素化腺苷酸+ O2→ 氧萤光素+ AMP +光 荧光素酶的基因可以被合成并插入到生物体中或转染到细胞中,将不同类型的细胞(骨髓干细胞、T细胞等)标记上(即表达)荧光素酶,就可以用高敏感度的CCD相机进行对动物体内进行活体观察而不会伤害到动物本身。在荧光素酶中加入正确的萤光素底物就可以放出荧光,而发出的光子可以被光敏感元件,如萤光探测器或改进后的光学显微镜探测到。这就使得对包括感染在内的多种生命活动进程进行观察成为可能。 荧光素酶分析可应用于启动子研究中分析顺式作用元件和反式作用因子、药物筛选、siRNA和miRNA筛选、分泌途径及蛋白定位报告基因检测、活细胞的实时动态研究、信号转导通路分析、难转染的细胞(包括干细胞和原代细胞)的研究、RNA剪接研究。 双荧光素酶报告基因测试,是结合萤火虫和海洋腔肠荧光素酶先进的共报告基因测试技术。在用萤火虫荧光素酶定量基因表达时,通常采用第二个报告基因来减少实验的变化因素。双荧光素酶报告基因测试系统,结合pRL载体系统,表达第二个报告基因海洋腔肠荧光素酶,在单管中进行双荧光素酶报告基因测试,快速、灵敏、简便。其应用广泛,可同时分析多个调控元件、同时分析多个信号转导通路、单次筛选一个以上的靶点(包括脱靶效应、分析两个或多个通路之间的相互作用)。
有谁做过荧光素酶报告基因
展开全部转录因子是一种具有特殊结构、行使调控基因表达功能的蛋白质分子,也称为反式作用因子。某些转录因子仅与其靶启动子中的特异序列结合,这些特异性的序列被称为顺式作用元件,转录因子的DNA结合域和顺式作用元件实现共价结合,从而对基因的表达起抑制或增强的作用。荧光素酶报告基因实验(luciferaseassay)是检测这类转录因子和其靶启动子中的特异顺序结合的重要手段。其原理简述如下:(1)构建一个将靶启动子的特定片段插入到荧光素酶表达序列前方的报告基因质粒,如pGL3-basic等。(2)将要检测的转录因子表达质粒与报告基因质粒共转染293细胞或其它相关的细胞系。如果此转录因子能够激活靶启动子,则荧光素酶基因就会表达,荧光素酶的表达量与转录因子的作用强度成正比。(3)加入特定的荧光素酶底物,荧光素酶与底物反应,产生荧光,通过检测荧光的强度可以测定荧光素酶的活性,从而判断转录因子是否能与此靶启动子片段有作用。
miRNA靶基因验证时怎么突变靶基因的3‘UTR结合位点
miRNA sponge抑制载体,经特异地优化设计,增强吸附能力的同时增加了更多的结合位点,这样提高了成熟miRNA或siRNA抑制能力,消弱细胞中miRNA或siRNA导致的基因沉默效应,从而进行miRNA或siRNA功能缺失性研究。MiRNA sponge载体与化学修饰的反义寡核苷酸相比,有它无可比拟的优势:a. 由于miRNA sponge是由质粒编码的,可以反复使用;b. 它能够通过包装慢病毒颗粒达到稳定沉默细胞microRNA的细胞系,有利于进行对原代细胞和难转染细胞miRNA的抑制; c. 能够沉默整个家族的microRNA以达到对整个家族microRNA功能的研究; d. 可以利用miRNA sponge实现体内外loss of function研究;e. 可以用来检测luciferase靶基因报告系统分析;f. 可以自由组合串联不同miRNA抑制子序列,达到沉默多种不同miRNA的目的。
什么是ntrk基因融合
作用是什么
融合基因正常值是多少
国际标准是0,融合基因正常值小于0.1%而各个医院的内参值不等,需要换算。融合蛋白有两种不同的含义,一种是通过DNA重组技术得到的两个基因重组后的表达产物。另一种含义就是介导两个细胞质膜融合的一组蛋白,如在仙台病毒脂双层外侧小叶中含有的两种糖蛋白之一,介导病毒被膜与宿主细胞质膜的融合作用。另一种糖蛋白是血细胞凝集素神经酰胺酶。检查不同,数值也不相同,那么意义就存在了差别。扩展资料所谓融合基因,是指将两个或多个基因的编码区首尾相连.置于同一套调控序列(包括启动子、增 强子、核糖体结合序列、终止子等)控制之下,构成的嵌合基因。融合基因的表达产物为融合蛋白。根据构成融合基因的种类,可以将融合基因分为四大类:(1)由报告基因和功能基因构成的融合基因。常用的报告基因有:GFP(绿色荧光蛋白)基因、GUS基因、LacZ基因和Luciferasese(虫荧光素酶)基因等,主要目的是对功能基因进行示踪,研究其功能及特性。(2)由信号肽或单体蛋白的序列与功能基因构成的融合基因。其主要目的是利用信号肽或单体序列携带目的基因高效表达,从而提取纯化目的蛋白,为生产或科研所用。(3)功能基因与功能基因的融合。可分为两类:A相同功能基因的融合,目的是增强基因的功能,扩大基因的应用范围,如杀虫基因之间的融合。B.不同功能基因的融合,为特殊需要而构建,如生产无毒疫苗等。(4)报告基因与抗药性基因的融合用于构建融合载体,以利于插入大片段的cDNA或作为双功能标记。参考资料:百度百科-融合基因
如何画miRNA与靶基因结合位点的图
miRNA sponge抑制载体,经特异地优化设计,增强吸附能力的同时增加了更多的结合位点,这样提高了成熟miRNA或siRNA抑制能力,消弱细胞中miRNA或siRNA导致的基因沉默效应,从而进行miRNA或siRNA功能缺失性研究。MiRNA sponge载体与化学修饰的反义寡核苷酸相比,有它无可比拟的优势:a. 由于miRNA sponge是由质粒编码的,可以反复使用;b. 它能够通过包装慢病毒颗粒达到稳定沉默细胞microRNA的细胞系,有利于进行对原代细胞和难转染细胞miRNA的抑制; c. 能够沉默整个家族的microRNA以达到对整个家族microRNA功能的研究; d. 可以利用miRNA sponge实现体内外loss of function研究;e. 可以用来检测luciferase靶基因报告系统分析;f. 可以自由组合串联不同miRNA抑制子序列,达到沉默多种不同miRNA的目的。
如何证明某个基因受转录因子的直接调控,简述实验设计
如果此转录因子能够激活靶启动子,则荧光素酶基因就会表达,从而对基因的表达起抑制或增强的作用,通过检测荧光的强度可以测定荧光素酶的活性:(1)构建一个将靶启动子的特定片段插入到荧光素酶表达序列前方的报告基因质粒,荧光素酶与底物反应,如pGL3-basic等。(3) 加入特定的荧光素酶底物转录因子是一种具有特殊结构,也称为反式作用因子。荧光素酶报告基因实验(luciferase assay)是检测这类转录因子和其靶启动子中的特异顺序结合的重要手段,这些特异性的序列被称为顺式作用元件、行使调控基因表达功能的蛋白质分子。某些转录因子仅与其靶启动子中的特异序列结合。(2) 将要检测的转录因子表达质粒与报告基因质粒共转染293细胞或其它相关的细胞系,转录因子的DNA结合域和顺式作用元件实现共价结合。其原理简述如下,从而判断转录因子是否能与此靶启动子片段有作用,荧光素酶的表达量与转录因子的作用强度成正比,产生荧光
有谁用过碧云天双荧光素酶报告基因检测试剂盒
报告基因检测被广泛应用于研究基因表达及外部刺激下原核和真核细胞的反应。Luciferase报告基因系统是以荧光素(luciferin)为底物来检测萤火虫荧光素酶(fireflyluciferase)活性的一种报告系统。可以极其灵敏、高效地检测基因的表达。但是报告基因实验中往往会受到各种实验条件的影响,例如培养细胞的数目和活力的差别、细胞转染和裂解的效率、以及加样操作过程中引起的变异。Dual-Luciferase双荧光素酶报告基因检测系统中含有在同一细胞中同时表达的两种荧光素酶。共转染的“对照”报告基因会作为内对照,减小细胞活性和转染效率对实验的影响。因此双报告系统减少了外部干扰,使得实验数据更可信。Promega提供了一种先进的双报告基因技术(Dual-reporter assays),结合了萤火虫荧光素酶测试和海肾荧光素酶测试,该技术同时使用两个独立的报告基因以提高实验的准确性,Biotek synergy 系列微孔板检测仪作为双报告基因的检测分析平台获得了Promega DLR 认证。在双报告基因系统中,通常一个报告基因用于检测特定实验条件下待测物的反应,即“实验”reporter,另一个报告基因用来检测实验条件,类似于内部对照,用于校准“实验”reporter的数据。通过这种方法,可减少内在的变化因素所削弱的实验准确性,例如:转染效率、细胞活性、细胞裂解差异以及加样操作过程中引起的差异。Promega公司的Dual-Luciferase系统利用萤火虫和海肾荧光素酶的活性分别检测实验组和对照组。萤火虫荧光素酶是一种分子量为61KD的单体酶,分两步催化虫荧光素的氧化反应,产生560nm的光,海肾荧光素酶是一种分子量为36KD的单体酶,催化海肾荧光素的氧化反应,产生中心波长为480nm的蓝光。萤火虫荧光素酶和海肾荧光素酶没有种源同源性,对应不同的反应底物,反应中没有任何的交叉干扰。
双荧光素酶报告基因一定要在工具细胞上做吗
报告基因检测被广泛应用于研究基因表达及外部刺激下原核和真核细胞的反应。Luciferase报告基因系统是以荧光素(luciferin)为底物来检测萤火虫荧光素酶(fireflyluciferase)活性的一种报告系统。可以极其灵敏、高效地检测基因的表达。但是报告基因实验中往往会受到各种实验条件的影响,例如培养细胞的数目和活力的差别、细胞转染和裂解的效率、以及加样操作过程中引起的变异。Dual-Luciferase双荧光素酶报告基因检测系统中含有在同一细胞中同时表达的两种荧光素酶。共转染的“对照”报告基因会作为内对照,减小细胞活性和转染效率对实验的影响。因此双报告系统减少了外部干扰,使得实验数据更可信。Promega提供了一种先进的双报告基因技术(Dual-reporter assays),结合了萤火虫荧光素酶测试和海肾荧光素酶测试,该技术同时使用两个独立的报告基因以提高实验的准确性,Biotek synergy 系列微孔板检测仪作为双报告基因的检测分析平台获得了Promega DLR 认证。在双报告基因系统中,通常一个报告基因用于检测特定实验条件下待测物的反应,即“实验”reporter,另一个报告基因用来检测实验条件,类似于内部对照,用于校准“实验”reporter的数据。通过这种方法,可减少内在的变化因素所削弱的实验准确性,例如:转染效率、细胞活性、细胞裂解差异以及加样操作过程中引起的差异。Promega公司的Dual-Luciferase系统利用萤火虫和海肾荧光素酶的活性分别检测实验组和对照组。萤火虫荧光素酶是一种分子量为61KD的单体酶,分两步催化虫荧光素的氧化反应,产生560nm的光,海肾荧光素酶是一种分子量为36KD的单体酶,催化海肾荧光素的氧化反应,产生中心波长为480nm的蓝光。萤火虫荧光素酶和海肾荧光素酶没有种源同源性,对应不同的反应底物,反应中没有任何的交叉干扰。
如何确定双荧光素酶报告基因的转染效率
转录因子是一种具有特殊结构、行使调控基因表达功能的蛋白质分子,也称为反式作用因子。某些转录因子仅与其靶启动子中的特异序列结合,这些特异性的序列被称为顺式作用元件,转录因子的DNA结合域和顺式作用元件实现共价结合,从而对基因的表达起抑制或增强的作用。荧光素酶报告基因实验(luciferaseassay)是检测这类转录因子和其靶启动子中的特异顺序结合的重要手段。其原理简述如下:(1)构建一个将靶启动子的特定片段插入到荧光素酶表达序列前方的报告基因质粒,如pGL3-basic等。(2)将要检测的转录因子表达质粒与报告基因质粒共转染293细胞或其它相关的细胞系。如果此转录因子能够激活靶启动子,则荧光素酶基因就会表达,荧光素酶的表达量与转录因子的作用强度成正比。(3)加入特定的荧光素酶底物,荧光素酶与底物反应,产生荧光,通过检测荧光的强度可以测定荧光素酶的活性,从而判断转录因子是否能与此靶启动子片段有作用。
求助双荧光素酶报告基因载体
双荧光素酶报告基因载体报告基因检测被广泛应用于研究基因表达及外部刺激下原核和真核细胞的反应。Luciferase报告基因系统是以荧光素(luciferin)为底物来检测萤火虫荧光素酶(fireflyluciferase)活性的一种报告系统。可以极其灵敏、高效地检测基因的表达。但是报告基因实验中往往会受到各种实验条件的影响,例如培养细胞的数目和活力的差别、细胞转染和裂解的效率、以及加样操作过程中引起的变异。Dual-Luciferase双荧光素酶报告基因检测系统中含有在同一细胞中同时表达的两种荧光素酶。共转染的“对照”报告基因会作为内对照,减小细胞活性和转染效率对实验的影响。因此双报告系统减少了外部干扰,使得实验数据更可信。Promega提供了一种先进的双报告基因技术(Dual-reporter assays),结合了萤火虫荧光素酶测试和海肾荧光素酶测试,该技术同时使用两个独立的报告基因以提高实验的准确性,Biotek synergy 系列微孔板检测仪作为双报告基因的检测分析平台获得了Promega DLR 认证。在双报告基因系统中,通常一个报告基因用于检测特定实验条件下待测物的反应,即“实验”reporter,另一个报告基因用来检测实验条件,类似于内部对照,用于校准“实验”reporter的数据。通过这种方法,可减少内在的变化因素所削弱的实验准确性,例如:转染效率、细胞活性、细胞裂解差异以及加样操作过程中引起的差异。Promega公司的Dual-Luciferase系统利用萤火虫和海肾荧光素酶的活性分别检测实验组和对照组。萤火虫荧光素酶是一种分子量为61KD的单体酶,分两步催化虫荧光素的氧化反应,产生560nm的光,海肾荧光素酶是一种分子量为36KD的单体酶,催化海肾荧光素的氧化反应,产生中心波长为480nm的蓝光。萤火虫荧光素酶和海肾荧光素酶没有种源同源性,对应不同的反应底物,反应中没有任何的交叉干扰。
什么是LUC基因
荧光酶基因(luc)是1985年从北美荧火虫和叩头虫cDNA文库中克隆出来的,该酶在有ATP、Mg2+、O2和荧光素存在下发出荧光,这样就可用转基因植物整株或部分直接用X-光片或专门仪器进行检测。
荧光素酶报告基因的应用原理
荧光素酶报告基因是指以荧光素(luciferin)为底物来检测萤火虫荧光素酶(fireflyluciferase)活性的一种报告系统。荧光素酶可以催化luciferin氧化成oxyluciferin,在luciferin氧化的过程中,会发出生物荧光(bioluminescence)。普洛麦格(北京)生物技术有限公司在为生命科学领域提供创新性解决方案和技术支持方面处于全球领先地位。公司生产的2,000多种产品使全球科学工作者们能加快对细胞分析、蛋白组学和基因组学研究的认知,以及在药物筛选、分子诊断和遗传鉴定领域的应用。
荧光素酶报告基因的应用原理
应用原理转录因子是一种具有特殊结构、行使调控基因表达功能的蛋白质分子,也称为反式作用因子。某些转录因子仅与其靶启动子中的特异序列结合,这些特异性的序列被称为顺式作用元件,转录因子的DNA结合域和顺式作用元件实现共价结合,从而对基因的表达起抑制或增强的作用。荧光素酶报告基因实验(luciferase assay)是检测这类转录因子和其靶启动子中的特异顺序结合的重要手段。其原理简述如下:(1)构建一个将靶启动子的特定片段插入到荧光素酶表达序列前方的报告基因质粒,如pGL3-basic等。(2) 将要检测的转录因子表达质粒与报告基因质粒共转染293细胞或其它相关的细胞系。如果此转录因子能够激活靶启动子,则荧光素酶基因就会表达,荧光素酶的表达量与转录因子的作用强度成正比。(3) 加入特定的荧光素酶底物,荧光素酶与底物反应,产生荧光,通过检测荧光的强度可以测定荧光素酶的活性,从而判断转录因子是否能与此靶启动子片段有作用。扩展资料应用植物基因工程在植物基因工程研究领域,已使用的报告基因有以下几种:胭脂碱合成酶基因(nos)、章鱼碱合成酶基因(ocs)、新霉素磷酸转移酶基因(nptⅡ)、氯霉素乙酰转移酶基因(cat)、庆大霉素转移酶基因、葡萄糖苷酶基因、荧光酶基因等。nos、ocs这两个基因是致瘤土壤农杆菌(Agrobacterium tumfaciens)的Ti质粒特有的,对Ti质粒进行改造,用相应的致瘤农杆菌转化植物体时,如果外源基因转入植物体中,则这两种报告基因在植物根茎叶中均能表达,不受发育调控,检测时直接用转化体提取液进行纸电泳,染色后在紫外光下观察荧光即可。nptⅡ、cat及庆大霉素转移酶基因,均为抗生素筛选基因,相关的酶可以对底物进行修饰(磷酸化、乙酰化等),从而使这些抗生素失去对植物生长的抑制作用,使得含有这些抗性基因的转化体能在含这些抗生素的筛选培养基上正常生长,也可以用转化体提取液体,外用同位素标记,放射自显影筛选转化体。常用的一种报告基因是β-D-葡萄糖苷酶基因,该酶催化底物形成β-D-葡萄糖苷酸,它在植物体中几乎无背景,组织化学检测很稳定,可用分光光谱、荧光等进行检测。荧光酶基因(luc)是1985年从北美荧火虫和叩头虫cDNA文库中克隆出来的,该酶在有ATP、Mg2+、O2和荧光素存在下发出荧光,这样就可用转基因植物整株或部分直接用X-光片或专门仪器进行检测。动物基因工程在动物基因表达调控的研究中,报告基因也被广泛应用。常用的有氯霉素乙酰转移酶基因(cat)、β-半乳糖苷酶基因(LacZ)、二氢叶酸还原酶基因、荧光酶基因等。cat基因作为报告基因,检测时可通过放射自显影观察。荧光酶基因作为报告基因,具有检测速度快、灵敏度比cat基因高30~1000倍、费用低、不需使用放射性同位素等优点,得到了广泛的采用。检测因子作用可通过报告基因的表达,研究蛋白质与蛋白质之间的相互作用。双杂交体系是由报告基因转录调控区、报告基因及一对可以相互作用的杂合反式作用因子组成。来从上述杂交体系中发展出的单一杂交体系技术,也是根据报告基因表达量的检测筛选出与已知顺式作用元件相结合的未知因子的DNA,该项技术正广泛应用于克隆细胞中含量微弱且用生化手段难以纯化的反式作用因子。由此可知,报告基因在基因表达调控和基因工程研究中处于非常重要的地位,它是作为外源目的基因能否转化植物体的探路先锋而首先被研究的,在研究植物的基因表达调控方面起着重要的作用,现已推广到真核生物的基因调控领域中。随着基因工程技术日新月异的发展,报告基因这一探路者的作用会更明显。参考资料来源:百度百科-荧光素酶报告基因参考资料来源:百度百科-报告基因
什么是LUC基因
Luciferase报告基因系统是以荧光素(luciferin)为底物来检测萤火虫荧光素酶(fireflyluciferase)活性的一种报告系统。荧光素酶可以催化luciferin氧化成oxyluciferin,在luciferin氧化的过程中,会发出生物荧光(bioluminescence)。然后可以通过荧光测定仪也称化学发光仪(luminometer)或液闪测定仪测定luciferin氧化过程中释放的生物荧光。荧光素和荧光素酶这一生物发光体系,可以极其灵敏、高效地检测基因的表达。是检测转录因子与目的基因启动子区DNA相互作用的一种检测方法。转录因子是一种具有特殊结构、行使调控基因表达功能的蛋白质分子,也称为反式作用因子。某些转录因子仅与其靶启动子中的特异序列结合,这些特异性的序列被称为顺式作用元件,转录因子的DNA结合域和顺式作用元件实现共价结合,从而对基因的表达起抑制或增强的作用。荧光素酶报告基因实验(luciferase assay)是检测这类转录因子和其靶启动子中的特异顺序结合的重要手段。其原理简述如下:(1)构建一个将靶启动子的特定片段插入到荧光素酶表达序列前方的报告基因质粒,如pGL3-basic等。(2) 将要检测的转录因子表达质粒与报告基因质粒共转染293细胞或其它相关的细胞系。如果此转录因子能够激活靶启动子,则荧光素酶基因就会表达,荧光素酶的表达量与转录因子的作用强度成正比。(3) 加入特定的荧光素酶底物,荧光素酶与底物反应,产生荧光,通过检测荧光的强度可以测定荧光素酶的活性,从而判断转录因子是否能与此靶启动子片段有作用。
什么是Luciferase报告基因系统?
Luciferase报告基因系统是以荧光素(luciferin)为底物来检测萤火虫荧光素酶(fireflyluciferase)活性的一种报告系统。荧光素酶可以催化luciferin氧化成oxyluciferin,在luciferin氧化的过程中,会发出生物荧光(bioluminescence)。然后可以通过荧光测定仪也称化学发光仪(luminometer)或液闪测定仪测定luciferin氧化过程中释放的生物荧光。荧光素和荧光素酶这一生物发光体系,可以极其灵敏、高效地检测基因的表达。是检测转录因子与目的基因启动子区DNA相互作用的一种检测方法。 转录因子是一种具有特殊结构、行使调控基因表达功能的蛋白质分子,也称为反式作用因子。某些转录因子仅与其靶启动子中的特异序列结合,这些特异性的序列被称为顺式作用元件,转录因子的DNA结合域和顺式作用元件实现共价结合,从而对基因的表达起抑制或增强的作用。荧光素酶报告基因实验(luciferase assay)是检测这类转录因子和其靶启动子中的特异顺序结合的重要手段。 其原理简述如下: (1)构建一个将靶启动子的特定片段插入到荧光素酶表达序列前方的报告基因质粒,如pGL3-basic等。 (2) 将要检测的转录因子表达质粒与报告基因质粒共转染293细胞或其它相关的细胞系。如果此转录因子能够激活靶启动子,则荧光素酶基因就会表达,荧光素酶的表达量与转录因子的作用强度成正比。 (3) 加入特定的荧光素酶底物,荧光素酶与底物反应,产生荧光,通过检测荧光的强度可以测定荧光素酶的活性,从而判断转录因子是否能与此靶启动子片段有作用。
什么是luciferase报告基因系统?
Luciferase报告基因系统是以荧光素(luciferin)为底物来检测萤火虫荧光素酶(fireflyluciferase)活性的一种报告系统。荧光素酶可以催化luciferin氧化成oxyluciferin,在luciferin氧化的过程中,会发出生物荧光(bioluminescence)。然后可以通过荧光测定仪也称化学发光仪(luminometer)或液闪测定仪测定luciferin氧化过程中释放的生物荧光。荧光素和荧光素酶这一生物发光体系,可以极其灵敏、高效地检测基因的表达。是检测转录因子与目的基因启动子区DNA相互作用的一种检测方法。 转录因子是一种具有特殊结构、行使调控基因表达功能的蛋白质分子,也称为反式作用因子。某些转录因子仅与其靶启动子中的特异序列结合,这些特异性的序列被称为顺式作用元件,转录因子的DNA结合域和顺式作用元件实现共价结合,从而对基因的表达起抑制或增强的作用。荧光素酶报告基因实验(luciferase assay)是检测这类转录因子和其靶启动子中的特异顺序结合的重要手段。 其原理简述如下: (1)构建一个将靶启动子的特定片段插入到荧光素酶表达序列前方的报告基因质粒,如pGL3-basic等。 (2) 将要检测的转录因子表达质粒与报告基因质粒共转染293细胞或其它相关的细胞系。如果此转录因子能够激活靶启动子,则荧光素酶基因就会表达,荧光素酶的表达量与转录因子的作用强度成正比。 (3) 加入特定的荧光素酶底物,荧光素酶与底物反应,产生荧光,通过检测荧光的强度可以测定荧光素酶的活性,从而判断转录因子是否能与此靶启动子片段有作用。
什么是ntrk基因融合
ntrk基因融合即融合型基因,是指将两个或多个基因的编码区首尾相连.置于同一套调控序列(包括启动子、增 强子、核糖体结合序列、终止子等)控制之下,构成的嵌合基因。融合型基因的表达产物为融合蛋白。根据构成融合型基因的种类,可以将融合型基因分为四大类。常用的报告基因有:GFP(绿色荧光蛋白)基因、GUS基因、LacZ基因和Luciferasese(虫荧光素酶)基因等,主要目的是对功能基因进行示踪,研究其功能及特性。由信号肽或单体蛋白的序列与功能基因构成的融合型基因。其主要目的是利用信号肽或单体序列携带目的基因高效表达,从而提取纯化目的蛋白,为生产或科研所用。扩展资料:每条染色体的两份拷贝在有些位置可能具有不同的等位基因,通过互换染色体间相应的部分,可产生于亲本不同的重组染色体。重组来源于染色体物质的物理交换,减数分裂前期,每条染色体有4份拷贝,所有的4份拷贝紧密相连,发生联会。这个结构称为二阶体,二阶体的每条染色体单元称为染色单体,染色体物质的两两交换就发生在不一样的染色单体(非姐妹染色单体)之间。发生重组的必须条件是两条DNA链的互补性。每条染色单体包含一条长的双链DNA,发生重组的断裂位点依赖于位点附近碱基的互补配对。当双链中的一条链与另一条双链的一条链发生交叉时,将形成一条杂合DNA。每个重组包括左侧亲本双链体DNA通过一段杂合DNA与右侧的另一条亲本双链体相连。参考资料来源:百度百科-融合型基因参考资料来源:百度百科-基因重组
如何预测一个新基因是否是miRNA的靶
如何预测和鉴定miRNA的靶基因 miRNA sponge抑制载体,经特异地优化设计,增强吸附能力的同时增加了更多的结合位点,这样提高了成熟miRNA或siRNA抑制能力,消弱细胞中miRNA或siRNA导致的基因沉默效应,从而进行miRNA或siRNA功能缺失性研究。 MiRNA sponge载体与化学修饰的反义寡核苷酸相比,有它无可比拟的优势:a. 由于miRNA sponge是由质粒编码的,可以反复使用;b. 它能够通过包装慢病毒颗粒达到稳定沉默细胞microRNA的细胞系,有利于进行对原代细胞和难转染细胞miRNA的抑制; c. 能够沉默整个家族的microRNA以达到对整个家族microRNA功能的研究; d. 可以利用miRNA sponge实现体内外loss of function研究;e. 可以用来检测luciferase靶基因报告系统分析;f. 可以自由组合串联不同miRNA抑制子序列,达到沉默多种不同miRNA的目的。
如何证明基因需要转录调控元件调控表达
如何证明基因需要转录调控元件调控表达如果此转录因子能够激活靶启动子,则荧光素酶基因就会表达,从而对基因的表达起抑制或增强的作用,通过检测荧光的强度可以测定荧光素酶的活性:(1)构建一个将靶启动子的特定片段插入到荧光素酶表达序列前方的报告基因质粒,荧光素酶与底物反应,如pGL3-basic等。(3) 加入特定的荧光素酶底物转录因子是一种具有特殊结构,也称为反式作用因子。荧光素酶报告基因实验(luciferase assay)是检测这类转录因子和其靶启动子中的特异顺序结合的重要手段,这些特异性的序列被称为顺式作用元件、行使调控基因表达功能的蛋白质分子。某些转录因子仅与其靶启动子中的特异序列结合。(2) 将要检测的转录因子表达质粒与报告基因质粒共转染293细胞或其它相关的细胞系,转录因子的DNA结合域和顺式作用元件实现共价结合。其原理简述如下,从而判断转录因子是否能与此靶启动子片段有作用,荧光素酶的表达量与转录因子的作用强度成正比,产生荧光
设计一个检测某一基因是否转录的检测方法的实验,简述其过程与原理。
原理:转录是以一条DNA链为模板,合成出一条mRNA的过程。所以,检测某一基因在特定条件下是否转录,可以提取样品的mRNA,反转录成cDNA,然后用扩增该基因的PCR引物扩增,如果有条带就是说明转录,没有条带就是不转录。过程:1.提取样品mRNA;2.反转录合成cDNA;3.设计该基因特异的PCR引物;4.进行PCR扩增,电泳,检测结果。
luciferase knockdown 基因转染是什么意思
luciferase knockdown 荧光素酶基因敲除
蛋白质抑制基因表达,luciferase结果是什么样
蛋白质抑制基因表达,luciferase结果是什么样RNA干扰的分子抑制机制的三种方式及原理转录抑制 与RNAi有关的dsRNA及蛋白质可参与染色质的修饰作用,使其中的组蛋白和DNA发生甲基化作用,使相应基因不能被转录,从而导致受阻基因不能表达。这种在转录水平上阻断基因功能,使基因沉默的RNAi方式被称为转录基因沉默(Transcriptional gene silencing,TGS)。这种现象先在植物中得到证实,但是在哺乳动物中是否存在仍有争议。2004年Svoboda等研究表明,在小鼠卵母细胞中,通过RNAi引起靶基因表达沉默的长dsRNA不能引起相应DNA区域从头合成DNA的甲基化。Morris等也于同年得出实验结论,针对内源基因启动子的siRNA能够引起其区域内CG岛以及组蛋白H3K9的甲基化,从而在转录水平抑制基因的表达。转录后抑制不同来源的dsRNA通过各种转基因技术转入植物、线虫或哺乳动物细胞内,、被切割产生siRNA片断,再由合成的RISC切割靶mRNA从而阻断基因表达。这种基因能正常转录成mRNA,但mRNA因被降解使基因功能被阻断,这种RNAi方式叫做转录后沉默(Post transcriptional gene silencing,PTGS)。siRNA对靶mRNA降解具有序列特异性,只能引起同源mRNA降解,如果siRNA与mRNA有一个bp不配对,RNAi作用就极大降低,如果两者有4个bp不配对,就不能产生RNAi。翻译抑制 Grishok等在研究RNAi时,发现在细胞中在细胞中存在内源性小片段单链RNA(ssRNA),其长度也在21~25 nt之间,这种ssRNA可与mRNA的3′非翻译区(3′UTR)特异性地结合,从而抑制mRNA的翻译和相应的功能蛋白质合成。这种小片段的ssRNA叫做stRNA(small temporal RNA)。ssRNA的形成是因为当RNA的大小为70~80 nt时,容易形成双链的茎环状结构,其双链茎的长度正好在21~25 nt之间,这样的双链结构易被Dicer酶识别并切割成stRNA,由stRNA抑制翻译。这种方式的RNAi也作用于转录后形成的mRNA,它在调节生物细胞内基因的表达、自身的发育方面起着重要的作用。
间隙基因(gap gene)成对基因(pair-rule gene)节段极性基因(segment polarity gen) 请解释一下
都是和昆虫体节发育有关的基因。具体见下面:A gap gene is a type of gene involved in the development of the segmented embryos of some arthropods. Gap genes are defined by the effect of a mutation in that gene, which causes the loss of contiguous body segments, resembling a gap in the normal body plan.A pair-rule gene is a type of gene involved in the development of the segmented embryos of insects. Pair-rule genes are defined by the effect of a mutation in that gene, which causes the loss of the normal developmental pattern in alternating segments.A segmentation gene is a generic term for a gene whose function is to specify tissue pattern in each repeated unit of a segmented organism. In the fruit fly Drosophila melanogaster, segment polarity genes help to define the anterior and posterior polarities within each embryonic parasegment by regulating the transmission of signals via the Wnt signaling pathway and Hedgehog signaling pathway.
RNA病毒基因组分节段原因
目前认为这个是进化的结果,至于后面的分子原因目前还不清楚Genome segmentation, the splitting of a linear genome into two or more segments, is a major evolutionary transition from independent towards complementing transmission of genetic information. Many viruses with RNA as genetic material have segmented genomes, but the molecular forces behind genome segmentation are unknown. We have used foot-and-mouth disease virus to address this question, because this non-segmented RNA virus became segmented into two RNAs when it was extensively propagated in cell culture. This made possible a comparison of the segmented form (with two shorter RNAs enclosed into separate viral particles) with its exactly matching non-segmented counterpart. The results show that the advantage of the segmented form lies in the higher stability of the particles that enclose the shorter RNA, and not in any difference in the rate of RNA synthesis or expression of the genetic material. Genome segmentation may have arisen as a molecular mechanism to overcome the trade-off between genomic content and particle stability. It allows optimizing the amount of genetic information while relaxing packaging density.http://www.plosgenetics.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pgen.1001344
豪华纯电SUV应该如何?从奥迪e-tron的品质基因说起
伴随着汽车市场步入新消费时代,消费者对于汽车的需求和偏好也出现了明显的变化,其中纯电动汽车的飞速发展,在一定程度上也反映出当下市场对于能耗以及舒适性的新追求。虽然市面上纯电动SUV产品百花争艳,但对于对品质有着极高要求的豪华品牌消费者而言,似乎理想中的产品需要提供更强的"品质基因",在豪华性方面赋予产品更多的附加值。奥迪e-tron的出现,填补了这一领域的需求空白,用对高品质的不断追求和拓展,聚焦电动化时代的用户出行体验,提供了超越同级的豪华品质,为用户提供堪比旗舰级别的电动豪华出行享受。品质基因1:享受驾乘,豪华感源自旗舰级舒适配置虽然动力系统有了本质上的不同,但奥迪e-tron依然延续了奥迪品牌对于豪华感和品质感的高标准。作为一款豪华纯电C级先锋SUV,奥迪e-tron提供了超越同级的豪华品质,为用户提供堪比旗舰级别的电动豪华出行享受。作为"灯厂"的一员,奥迪e-tron很好的传承了品牌在灯光技术上的优势,将矩阵LED大灯和贯穿式尾灯巧妙的融入进家族化的外观造型中,同时大灯兼具高度自适应的光线分布功能,实现超远的照射范围。不仅大灯够亮够炫,在车内氛围灯光的营造上也是颇有造诣,提供7种可选氛围灯风格,支持自定义30色内饰氛围灯,在车内可以营造出一种悬浮式效果,再配合e-tron专属标识的背光图案,带来满满仪式感。为了进一步提升品质感,奥迪e-tron在同级中提供了独有的前排座椅按摩功能,按摩和通风功能的加入,可以大幅提高乘车舒适性并改善了乘员的乘坐感受,大大减轻长途旅行中的疲劳感,实现了其他纯电动SUV难以提供的驾乘舒适感。作为豪华纯电SUV,奥迪e-tron很在意车内乘客的静谧性,通过高水准的NVH优化,几乎无噪音的电动机与特殊的主减速器隔音装置的结合,确保了几乎无噪音的驾驶体验。同时,车辆前轮经过空气动力学优化,有效减少了风噪和胎噪,这也让同级独有的16扬声器B&O音响更好的发挥了"实力",给会欣赏、有品位的用户开启非比寻常的音效世界,打造专属听觉盛宴。此外,标志性的12.3英寸高清奥迪虚拟驾驶舱搭配MMI升级版导航系统,可以通过最新的导航数据实现迅速且精确的目的地指引,而MMI触控显示屏提供了多种个性化设置,让用户可以根据个人喜好对布局进行灵活调整,带来如智能手机般的人机交互体验。品质基因2:三电品质超越旗舰水准,性能续航表现出众相比传统燃油版的奥迪产品,奥迪e-tron最大的改变和亮点就是其搭载的超旗舰水准的三电系统。搭载的前后双异步电动机,峰值输出功率高达230kW,峰值扭矩540N·m,配合总容量为96.7kWh的高压蓄电池,最大综合续航里程可达500公里。奥迪e-tron这套三电系统的另一大亮点,在于强大的动能回收利用系统。支持手动能量回收、自动能量回收以及制动能量回收三种模式,可以充分利用驱动电机在运行过程中所产生的热量为车内空间供暖,行驶时充分的利用滑行和制动时的动能,高效回收能量至电池中,大大提升续航里程,最高可达30%。除了续航里程表现出色,奥迪e-tron另一大优势是充电快捷方便。具备"过夜充电"、"快速充电"、"泊车充电"三种充电模式,满足不同驾驶情况需求。在"快速充电"模式下使用蓄电池直流快速充电40分钟,电池电量即可从5%达到总容量的80%。"过夜充电"模式使用最大充电电流为40A的车载充电器,可实现行业领先的11kw交流充电功率,6.1小时即可从5%充到80%。奥迪e-tron经历了北极圈实验室零下38度极寒场景的检验,通过搭载高效的热管理系统,保持电池始终恒温在25-35度的最佳工作温度区间,提升驾驶性能,延长电池寿命,最高提高续航里程达15%。品质基因3:双重考验确保最佳状态,锻造出色行驶质感既然是奥迪家族的豪华纯电SUV,奥迪e-tron在驾驶性能和行驶质感方面,自然也有着不俗的品质表现。奥迪e-tron在纯电SUV中提供了卓越的行驶质感,而这种出众的驾驶体验,源自于超长途旅程及极端行驶环境的双重考验,让奥迪e-tron在不同驾驶环境中都呈现出最佳的性能状态。奥迪e-tron经历了全球超500万公里的路试,并为更好的适应中国本土的环境,在中国也进行了等效60万公里300天路试,历经黑河、重庆、敦煌等城市的实际测试,保证整车的适应性强、性能稳定。为了模拟用户实际用车过程中的场景,奥迪e-tron同样经历了高强度的洗车、淋雨、冷冻试验,以保证整车的密封性和功能的完整性。通过模拟户外暴晒,保证整车所有非金属零件的抗老化性能。利用振动试验,模拟客户日常使用时可能出现的受力及负载情况,对车身进行液压伺服的台架振动疲劳试验。通过一系列国内外严格、全方位的测试,让奥迪e-tron可靠性得到了检验和证明,让安全行驶更有保障。总结:奥迪e-tron的出现,让青睐豪华纯电动SUV的消费者有了更好的选择。奥迪e-tron能够给消费者带来的不仅仅是电动SUV传统意义上的优点,更将奥迪品牌的豪华气质以及超越同级的豪华品质融入产品力中,精准聚焦电动化时代的用户出行体验,展现了生而强悍的产品性格以及天性不服输的产品调性,成为市场中豪华电动的先锋车型。【本文来自易车号作者新车部落,版权归作者所有,任何形式转载请联系作者。内容仅代表作者观点,与易车无关】
人有多少个基因对
23对46条,其中22对市场染色体,还有一对性染色体,女性是X、X,男性是X、Y。
外国研究员发现:人类大脑基因促使猴子长出更大的大脑
外国科学家发现HTLV-1病毒诱导炎症和癌症的新机制平滑肌细胞中Nrk之表现具有减缓发炎与血管内膜增生之功能Nature:中风引起的脑血管异常与肠道细菌有关据国外统计,新冠病毒的感染可能受到自身血型而有所影响 人类大脑在进化过程中的扩张,特别是新大脑皮层的扩张,与诸如推理和语言等认知能力有关。有一种叫做ARHGAP11B的基因,只在人类身上表达,它能触发大脑干细胞形成更多的干细胞,这是大脑更大的先决条件。过去的研究表明,当ARHGAP11B在小鼠和雪貂体内表达到非生理上的高水平时,会导致新大脑皮层的扩张,但它与灵长类进化的相关性尚不清楚。 马克斯普朗克研究所分子细胞生物学和遗传学研究所(MPI-CBG)的研究员与日本川崎中央研究所实验动物(CIEA)和庆应义塾大学的同事合作发现,当狨猴体内的这个基因表达到人体生理水平时,会引起大脑皮层肿大。这表明ARHGAP11B基因可能在人类进化过程中导致了大脑皮层的扩张。 人类新皮层是大脑皮层中进化最年轻的部分,比最亲密的人类黑猩猩大三倍,在进化过程中,它折叠成皱纹的程度增加了,以适应头骨的受限空间。科学家面临的一个关键问题是人类新皮层如何变得如此之大。 在2015年的一项研究中,MPI-CBG的创始负责人Wieland Huttner研究小组发现,在人类特异性基因ARHGAP11B的影响下,小鼠胚胎产生了更多的神经祖细胞,甚至可以正常折叠 展开的新皮层。结果显示,ARHGAP11B基因在人类新皮层的进化扩展中起关键作用。 穿过101天大的ARHGAP11B转基因mar猴胎儿的一个脑半球的切片的显微图像。(图源:Heide et al. / MPI-CBG) 人类特异性基因的崛起 人类特异性基因ARHGAP11B产生于大约五百万年前,是遍及普遍存在的基因ARHGAP11A的部分复制。沿着导致尼安德特人、丹尼索瓦人和现在的人类的进化谱系进化而来,在这个谱系与黑猩猩分离后,形成了黑猩猩。研究小组在2016年的一项后续研究中,发现了令人惊讶的原因,为什么ARHGAP11B蛋白包含47种氨基酸序列,这些序列是人类特异性的,在ARHGAP11A蛋白中未发现,并且是ARHGAP11B增加能力所必需的脑干细胞。 具体而言,在ARHGAP11B基因中发现的单个C到G碱基取代会导致ARHGAP11B信使RNA丢失55个核苷酸,这会导致阅读框发生移位,从而导致人类特异性,功能关键的47个氨基酸序列。这种碱基取代发生的时间可能晚于大约500万年前出现的时间。这种点突变并不罕见,但是在ARHGAP11B的情况下,其形成更大大脑的优势似乎立即影响了人类的进化。 基因存在猴子身上的影响 但是,到目前为止,尚不清楚人类特异性基因ARHGAP11B是否还会在非人类灵长类动物中引起新皮层增大。为了对此进行研究,Wieland Huttner小组的研究人员与位于日本川崎市的中央实验动物研究所(CIEA)的Erika Sasaki和位于东京的庆应大学的冈野秀幸(Hideyuki Okano)合作,他们都是日本的先驱。 产生转基因非人类灵长类动物的技术。该研究的第一作者,博士后迈克尔·海德(Michael Heide)前往日本,与他们的同事直接进行现场合作。 他们产生了转基因的普通mar猴,即新世界猴,在发育中的新皮层中表达了人类特异性基因ARHGAP11B,而通常他们没有这种基因。日本在动物研究和动物福利方面的道德标准和法规与德国类似。在日本获得了101天大的mar猴胎儿(正常出生日期前50天)的大脑,并出口到德累斯顿的MPI-CBG进行详细分析。 Michael Heide表示,我们确实发现,普通绒猴的大脑皮层被扩大,大脑表面被折叠。它的皮质板也比正常的厚。此外,我们可以看到心室外下区基底桡神经胶质祖细胞的数量增加,以及上层神经元的数量增加,这种神经元类型在灵长类动物进化过程中增加。”研究人员现在有功能证据表明,ARHGAP11B导致了灵长类动物新大脑皮层的扩张。 野生型(正常)和ARHGAP11B转基因胎儿(101天)是mo猴的大脑。(图源:Heide et al. / MPI-CBG) 道德考量 负责这项研究的Wieland Huttner表示:「我们的分析仅限于mar猴胎儿,因为我们预期该人类特异性基因的表达会影响natal猴新皮层的发育。鉴于对产后的潜在不可预见的后果脑功能方面,我们认为从道德的角度出发,首先确定ARHGAP11B对胎儿mar猴新皮层发育的影响是先决条件,也是必需的。」 研究人员得出的结论是,这些结果表明,人类特异性ARHGAP11B基因可能在人类进化过程中引起了新皮层扩张。
SEA基因携带者是什么意思?
意思就是遗传信息中含有地中海贫血致病基因
地贫检查结果显示,---a3.7、--SEA基因缺失是什么意思?是地贫吗?严重吗?
问题分析:你好 地中海贫血是一组溶血性贫血病,可分为α﹣地中海贫血和β-地中海贫血两类,分别由α-珠蛋白基因或β-珠蛋白基因缺失、突变等缺陷,引起的意见建议:检出SEA缺失, 说明其四个α珠蛋白基因有两个失去,另两个正常(因为是杂合子)。 为轻度地贫。地中海贫血又称海洋性贫血。是一组遗传性溶血性贫血。其共同特点是由于珠蛋白基因的缺陷使血红蛋白中的珠蛋白肽链有一种或几种合成减少或不能合成。导致血红蛋白的组成成分改变,本组疾病的临床症状轻重不一,大多表现为慢性进行性溶血性贫血。生活调理地中海贫血患者往往体虚,卫外不固,要慎起居,适寒温,注意预防外感;多进行户外活动;呼吸新鲜空气;进行适宜的体育锻炼,气功锻炼,打太极拳等有助于增强体质和抗病能力。 2.饮食调理注意饮食调养,宜进食营养丰富的食物,凡辛辣厚味,过于滋腻,生冷不洁之物,当禁食或少食。由于小儿脾肾常不足的生理特点,喂养要合理,以免饥饱无常,偏食,饮食不洁损伤小儿脾胃。
地中海贫血报告上写a--珠蛋白基因缺失类型aa/--^SEA是什么意思
杂合子=一半受影响,一半正常。人有四个α珠蛋白基因,一对染色体上每条两个。sea缺失使患者失去其中的两个,另两个正常。为轻度地贫患者。可能出现轻度贫血,也可能不贫血。患者现在或将来的配偶应在女方孕前或孕初彻底检查是否患地贫。
地贫基因查验结果为- -SEA/aa型,这是什么意思?
这是轻度α地贫的基因型. SEA(东南亚)缺失是一种很常见的地贫致病突变, 其后果是删除一条染色体上的两个α珠蛋白基因(所以是--), 但另一条染色体上的两个基因不受影响(所以是αα), 仍为轻度。
a一地中海贫血基因检测结果aa/一SEA是什么意思
轻度地贫。 四个α珠蛋白基因两个正常, 两个缺失。 SEA=东南亚, 是最常见的缺失型α地贫致病突变之一。 患者的父母中起码也有一人是α地贫。 如尚未生育, 配偶应在生育前彻底检查是否患地贫。 如已生育, 孩子应检查是否遗传到地贫。
地贫基因缺失SEA,SEA是什么意思
SEA是基因人有四个α珠蛋白基因,SEA缺失使患者失去了其中两个,但另两个正常,患者可能有轻度贫血,地贫就是地中海贫血,但一般不会有其他问题。主要是生育小孩,建议进行血常规检查。如没异常,即无影响;如有轻微异常,再查地贫基因检测,做好优生优育的准备;如有明显异常,明确诊断为轻/中间型地贫,一定在产科医师指导下怀孕
a-地贫基因分型检测范围包括SEA型,3.7型,4.2型是什么意思
地中海贫血是一组溶血性贫血病,呈现常染色体隐性遗传规律。可分为α﹣地中海贫血和β-地中海贫血两类,分别由α-珠蛋白基因或β-珠蛋白基因缺失、突变等缺陷,引起相应珠蛋白链的合成受到抑制或其功能丧失所致。该病在东南亚各国及我国南方的广西、广东、海南、四川及贵州等省较为常见。 α-地中海贫血主要由α-珠蛋白基因大片段缺失引起,这类α-地中海贫血称为缺失型α-地中海贫血,同时少部分是由于α-珠蛋白基因点突变而引起,这类α-地中海贫血称为非缺失型α-地中海贫血。我国已报道缺失型α-地中海贫血基因突变类型不少于10种,其中最常见的是东南亚型缺失(--SEA/,缺失1个α1基因及1个α2基因)、左侧缺失(-α4.2/,缺失1个α2基因)和右侧缺失(-α3.7/,缺失1个α1基因),东南亚型缺失是中国人最常见的α0-地中海贫血,左侧缺失和右侧缺失是中国人最常见的α+-地中海贫血,三种缺失所占比例在95%以上。 正常情况下人类带有四个α-基因,分别为2个α2基因和2个α1基因。α-地中海贫血的表型与受累α-珠蛋白基因的个数密切相关。1个α-基因发生缺陷,其基因型为-α/αα,通常无血液学异常表现;2个α-基因发生缺陷,其基因型为-α/-α、--/αα,则表现出小细胞低色素性贫血;3个α-基因发生缺陷,其基因型为-- /-α,则表现为中度贫血的Hb H病,可检测到Hb H带。4个α-基因发生缺陷,其基因型为--/--,表现为Hb Bart"s胎儿水肿综合征,胎儿在孕晚期或出生后不久死亡。 本例样本检测结果为东南亚型杂合子,血红蛋白含量(Hb)基本正常,因此不能说受检者为地中海贫血患者,只能说是地中海贫血基因携带者。受检者不需要任何治疗,需要注意的是,若受检者准备要小孩,则应对其配偶进行α-地中海贫血基因检测,配偶也是α-地中海贫血基因携带者的话,则应对胎儿进行基因检测,以防止中、重型地贫患儿的出生。
通常用大写字母表示显性基因,小写字母表示隐性基因.下列表现出隐性性状的基因组成是( )A.DDB.Dd
生物体的某些性状是由一对基因控制的,而成对的基因往往有显性和隐性之分,当控制生物性状的一对基因都是显性基因时,显示显性性状;当控制生物性状的基因一个是显性一个是隐性时,显示显性基因控制的显性性状;当控制生物性状的一对基因都是隐性基因,显示隐性性状.通常用大写字母表示显性基因,小写字母表示隐性基因.若用D和d分别代表显、隐性基因,则显性性状的基因组成是DD或Dd;隐性性状的基因组成是dd.因此表现出隐性性状的基因组成是dd.故选D
美国基因泰克公司的公司合作
在2003年,基因泰克还上市了与Tanox公司开发的哮喘治疗药抗IgE抗体柯耐尔(Xolair,omalizumab)和与Xoma公司开发的银屑病治疗药Raptiva(efalizumab),两种药物都取得了不俗的成绩。目前基因泰克正在与合作伙伴OSIP公司进行非小细胞肺癌治疗药他西卫(Tarceva,erlotinib HCL)的上市准备。 由于具备了技术优势,解决了资金的后顾之忧,基因泰克又研发出用于治疗晚期乳腺癌的贺喜汀(Herceptin,群司珠单抗),并于1998年获得FDA批准。贺喜汀可以阻止生长因子为乳腺癌细胞提供养分。在2001年基因泰克22亿美元的销售额中,贺喜汀占了3.47亿美元。今年6月,欧盟批准了贺喜汀与泰索帝(Taxotere,docetaxel,多西他赛)联用,作为人类表皮生长因子受体2(HER2)呈阳性的转移性乳腺癌的一线治疗。预计该药9月底将在英国与德国上市,随后再在其他国家进一步投放市场。基因泰克研发的抗癌新药Avastin(bevacizumab)是一种单克隆抗体,主要通过抑制能够刺激新血管形成的血管内皮生长因子令癌细胞无法获得养分而被“饿死”。该药是基因泰克的骄傲,自今年2月26日在美国上市以来,在药物市场和资本市场刮起了一阵旋风。该药二季度的销售额高达1.33亿美元,远远超出诸多分析家估计的8500万美元,使基因泰克二季度总收入出现41%的暴涨,公司季度销售额冲破了10亿美元的历史大关,总收入达11亿美元。预计Avastin2004年的销售额将达4亿~5亿美元,2005年可望进入重磅炸弹药物之列。 基因泰克有600名科学家研究人员,包括60个博士后。该公司的科学家每年发表的论文多达200多篇,研究人员至少把一部分时间花在自己的兴趣上,公司对此给予了极大支持,这实际上增强了公司的创新能力。基因泰克将研发重点放在内分泌和代谢疾病上,放弃了基因治疗、心脏病、动植物激素和疫苗的研发工作,更有利于产生突破性的发现。公司的研发战略瞄准创造真正的新产品,这些产品可用于治疗威胁人类生命的疾病。由于是独创产品,竞争对手少,上市价格可以很高(Avastin疗法每年需要花费4万美元以上),而且销售压力不大。
样本未检测到egfr基因突变说明什么
说明表皮生长因子受体(egfr)基因没有发生突变,是正常的,仅此而已~
为什么要做RAS基因检测
靶向药物的研发一般都是靶点为基础来进行研发的,不同的靶点突变,选择的治疗方案也是不一样的。RAS基因突变存在于不少的癌症之中,像胰腺癌存在90%左右的突变,肺癌存在5%-30%突变的概率。由于很多的患者对于基因检测和靶向治疗不是特别的清楚,小编就来为患者深入的解读:? 根据研究表明约30%的人类恶性肿瘤与Ras基因突变有关。在细胞的讯息传递路径上,Ras主要为活化控制基因转录的激酶,从而调节细胞的增生与分化,其与肿瘤细胞的生存,增值,迁移,扩散,血管生成均有关系。根据近些年来的权威调查显示: 2009年《NCCN非小细胞肺癌临床实践指南》明确指出:当Ras基因如果发生了突变,则不建议病人使用Tarceva(Tarceva)进行分子靶向治疗。 欧洲药监局和美国FDA明确规定了在使用靶向药物爱必妥和维克替比治疗转移性大肠癌前必须检测Ras基因。 2011年,NCCN提出肿瘤患者接受EGFR靶向药物治疗之前,必须进行Ras基因突变检测,根据检测结果决定是否使用EGFR靶向药物作为临床治疗措施。新的指南规定,只有肿瘤有野生型(正常)Ras基因的患者,才能接受表皮生长因子受体(EGFR)抑制剂治疗。 ASCO中最新的临床数据表明,如果Ras基因突变,患者无法从多吉美(索拉非尼)靶向治疗中受益。 所以对于RAS基因突变的检测是何等的重要,所以一旦查出RAS基因突变,就要选择RAS抑制剂来进行治疗。
基因zw型,有哪几种,指的是动物
我记得有果蝇
性别的基因型是以XY为主还是以ZW为主
XY型性别决定是所有哺乳类动物、多数雌雄异株植物、昆虫、某些鱼类和两栖类动物的性别决定方式,ZW型普遍存在于鳞翅目昆虫、两栖类、爬行类和鸟类之中,这与物种种类有关。XY型:xy为雄性,xx为雌性ZW型:zz为雄性,zw为雌性
zw型基因的遗传规律
与xy型的相似,只不过zz是雄性,zw是雌性。
简单的转录组差异基因表达分析 -- DESeq2
经典的转录组差异分析通常会使用到三个工具 limma/voom , edgeR 和 DESeq2 。今天我们就通过一个小规模的转录组测序数据来演示 DESeq2 的简单流程。 对于 DESeq2 的分析流程而言,我们需要输入的数据包括: u200b 下面就以 mobData 中的数据为例简单介绍 DESeq2 的分析流程 u200b 由于 mobData 中的行名没有提供基因的ID,我们也不是为了探究生物学问题,就以 mobData 的行数作为其ID DESeqDataSet 是 DESeq2 流程中储存read counts和中间统计分析数据的对象,之后的分析都建立在该对象之上进行。 u200b 在进行差异分析之前,需要对样本数据的表达矩阵进行预处理,包括: u200b 通过PCA结果来看各组样本分组情况还是不错的,但hclust的聚类结果反映的分组就略微有点混杂了,可能要聚类计算的距离函数选用不当有关。 使用 DESeq() 函数进行差异分析时,该函数干了以下三件事: u200b counts() 可以提取 DESeq object 中的表达矩阵,而 results() 可以提取差异分析的结果,其中包括了: 样本间的均值, log2 fold changes, standard errors, test statistics, p-values and adjusted p-values. u200b 使用 results() 函数时需要指明进行比较的样本,这里用 contrast=c("group_list","MM","WW") 提取 MM 组和 WW 组进行差异分析的结果。如果想要比较 WM 组和 WW 组,只要改变 contrast=c("group_list","WM","WW") 即可。 u200b 检查结果中是否包含 NA 值 u200b 这里 padj 中有1142个 NA 值是因为使用 results() 提取差异分析结果时,大于 alpha 值(这里是0.1)的矫正后p-value都会被当做是 NA 。因此,我们将这些 padj 值都设为 1 排序后以 log2FoldChange 绝对值大于1, padj 小于0.05为条件筛选显著的差异表达基因 u200b 至此,便筛选出了 217个 在 MM 组和 WW 组之间的显著差异表达基因。至于后续的可视化分析则是因课题而异了,等以后有空了再补坑吧! u200b 有同学可能注意到,虽然我们的样本有多个组,但在差异分析时进行的还是pairwise的分析,为什么我们不可以三个组一起分析呢?学过ANOVA的同学应该都知道,ANOVA就是可以应对这种多组差异分析的情况。但要注意的是,ANOVA只可以告诉我们对于某个基因在这三组中是否存在差异,想要找出是哪一组有其他组别有差异还是需要进行pairwise t-test之类的分析。所以,在这里我们两组两组地进行分析正是出于这个考虑,并且有更方便我们解释差异分析的结果,说明在A组基因的表达量相对于B组的是上调还是下调。另外,本文的差异分析还是处于单因子水平(只有一个变量),至于多因子的差异分析以后研究透了再和大家进行分享。 完。
c-kit基因的介绍
c-kit基因位于人染色体4q12-13,属于原癌基因,其产物是Ⅲ型酪氨酸激酶。C-KIT是酪氨酸激酶受体蛋白家族的重要成员之一,其作为干细胞因子的受体,可以通过一系列信号通路参与造血干细胞增殖分化的调控。近年来研究发现,c-kit基因存在突变,特别是激活性突变与急性白血病中的发病、治疗和预后等密切相关。
请问什么是 Kit基因?
这是一种基因序列的名称,属于酪氨酸激酶家族Ⅲ类成员,被研究的原因在于在它多种癌症中发挥了一定的作用
到底是不是缤越“换壳”?脱离了沃尔沃的基因,领克06备受争议
高价收购沃尔沃,吉利的最终目的到自创领克才显现出来——突破很大程度上被海外车企垄断的燃油技术壁垒,从而形成属于自己的自主技术,这一“师夷长技以制夷”的方式也确实成就了几款领克新车。但走到领克06,吉利已然形成了沃尔沃技术自主化后的体系。原本这是一喜大普奔的事,可国内用户似乎并不买账,领克06“换壳”缤越这事始终热度不减。既然是“换壳”,那么在外观上就要最大化区别于原型车,领克06也确实和缤越没有太多相似之处。同时对于领克家族车型的外观,一向都是见仁见智,领克06依旧采用了对立美学设计语言,个性化分体式大灯设计让它并没有太显怪异,更符合国人审美;机械燕尾能量晶体尾灯辨识度十足,堪称过目不忘;同时在轮毂部分、车顶侧面、格栅内部都融入了橘色饰条,增添了几分灵动气息。要说外观算见仁见智,领克06的内饰可能就是多数人“欣赏不来”了。它没有采用整体环抱式座舱设计或主驾导向设计,而是以中控台中部为分割线,主副驾驶位采用了相对对称的设计,加入“一对吵架冷战的情侣”似乎更应景。好在内饰做工颇显档次,这一点国产车从来都不输合资车。悬浮式中控屏搭载了全新的Co Lynk智能互联系统,还支持云导航和三指飞屏,很符合年轻一代用户的胃口。“换壳”的由来很大一部分是源于领克06和缤越同属BMA架构,对此吉利并没有刻意回避。其车身尺寸为4340/1820/1625mm,轴距为2640mm。同时配置方面很是“花里胡哨”,就L2.5 级自动驾驶而言,包括了 RPA 一键遥控泊车、PA 智能领航系统,以及上帝之眼 540° 全景影像、“记忆黑匣”行车记录可提供车辆前、后、左、右 360°的行车影像等,而且领了06还是首个搭载“Rollover Protection”翻滚保护系统的车型。新车脱离沃尔沃自立门户的一个标志性行为就是并没有采用沃尔沃的2.0T发动机,而是搭载了1.5T三缸发动机——正是这款三缸发动机让它和缤越割舍不开。承担177匹马力输出的是一款七速双离合变速箱,同样和三缸版缤越无二。都说当一款车占了三缸发动机和双离合变速箱其中任意一样销量都不会太好,缤越也确实用血泪史证明了这点,所以才有了后来四缸车型的回归。回过头来看领克06——我们暂且把它看成是缤越的换壳车,换了的地方除了外观和内饰,好像也只有配置方面说的过去,但又因定位高端其售价必然也会更高,那么多少人会为这样一款车买单?
基因组重复序列的特点
1.高度重复序列 重复几百万次,一般是少于10个核苷酸残基组成的短片段。如异染色质上的卫星DNA。它们是不翻译的片段。在小鼠中约占基因组的10%。(重复序列是为了大量合成蛋白质和核酸)2.中度重复序列 重复次数为几十次到几千次。在小鼠中约占20%。如rRNA基因、tRNA基因和某些蛋白质(如组蛋白、肌动蛋白、角蛋白等)的基因。
什么是ARMS技术,与其他检测基因的方法有什么优势?
现在除了简便易行以外,并没有什么优势了。ARMS与NGS相比,灵敏度低(ARMS最多1%,NGS可低至0.1%),无法检测未知突变,对样本DNA含量要求高(因为ARMS很难一次检测多个突变,要检测多个位点就必须做好几个反应,自然DNA用得多)就算你只想检测某个特定位点,也完全可以用ddPCR,灵敏度甚至高于NGS。
全基因组检测和一般基因检测的区别有哪些?
简单的讲全基因组检测和一般基因检测就是全部分析基因信息和部分分析基因信息的区别。一般基因检测只是对某一个或几个基因或者某一个基因上特定片段或者特定位点的碱基对测序。全基因测序是指一个生物体携带的所有基因信息测序,包括所有染色体上所有基因和非基因的碱基对测序,线粒体核糖体上的碱基对测序。全基因组检测的话则覆盖的整个基因序列,如在美国很出名的Veritas奕真生物全基因组检测就是业内以低价提供了千余种与遗传疾病相关的解析,通过疾病筛查、用药安全监测,让您了解更了解自己的健康问题,提前预防,不像体检是生了病才知道,至少提前知道得病风险可以有针对性的调整饮食,调整生活方式和体检的方案,减少疾病发生。
请问对于EEe这个基因型是如何产生配子的?求详细的解答,谢谢各位。
EEe 先复制EEEEee 联会紊乱 EEEE 和ee 在产生配子就是EE 和e如果是EEEEee 和一个空的 那配子就是一个空的和EEe 如果是EEee和EE 配子就是Ee和E 懂了吗?我把次级细胞省略没写了 直接写的配子
基因组控制鸡模型中腹部脂肪沉积的多个因素
文章:Genomic Insights Into the Multiple Factors Controlling Abdominal Fat Deposition in a Chicken Model 肉鸡过快的生长速度伴随着过多的腹部脂肪沉积,这些对肉质特性和饲料成本产生不利的影响,基因组学技术确定了与腹部脂肪沉积相关的多种遗传因素。这篇综述的目的是总结当前对与腹部脂肪沉积相关的遗传/表观遗传因素的理解,或者与它与鸡前脂肪细胞的增殖和分化有关。因此,有必要进一步深入研究多种遗传因素,开发新的分子标记或潜在靶标,以减少鸡中脂肪的积累,或者可以作为人类肥胖症的新治疗靶标。 脂肪组织是产生激素和其他物质的重要内分泌器官,这些物质会深刻影响我们的健康,此外,腹部脂肪沉积是各种健康问题的关键因素。 鸡腹部脂肪沉积受遗传,内分泌激素,环境因素和多种行为的调节。鸡腹部脂肪的遗传率(0.82)高于活体重(0.55)和身体部位的遗传率。选择年龄的大腿(0.31),鸡腿(0.51)和胸肌(0.55)。家禽中的高脂肪含量(浪费饲料)可能对人类健康构成威胁。 鸡已被用作研究脂肪形成,胚胎发育,免疫功能,营养,内分泌功能和癌症的基本机制的良好动物模型。鸡和人类基因组之间存在根本的相似性,大约60%的鸡基因与人类基因几乎相同。作为禽类模型,它可以为未来的复杂人类疾病研究提供与小鼠和大鼠相同的许多优势。 WAT、BAT、米色脂肪组织 WAT在能量稳态中起着关键作用,以甘油三酸酯的形式存储多余的能量,在白色脂肪细胞仅包含一个大的脂滴。 BAT存在于瘦和肥胖成年人的颈部,胸部和腹部的后部区域,并且可能调节能量代谢,寒冷敏感性和体重增加。 数量性状基因座(QTL)是影响数量性状的基因的DNA片段(基因座)。大量控制腹部脂肪沉积的QTL位于1号染色体上,但是QTL表现出一定的局限性,因此识别出的QTL位点通常较大,需要随后的精细定位才能区分与靶标性状密切相关的基因或变异体。 主要是通过品种间或同一品种不同饲养,鉴定差异表达的基因。 脂肪细胞脂肪酸结合蛋白( FABP4 )是脂肪酸结合蛋白(FABPs)的一个亚家族,FABP4蛋白仅在腹部脂肪中表达。mRNA水平肉鸡低于瘦鸡。另外两种类型的脂肪酸结合蛋白亚家族, L-FABP和L-BABP ,mRNA水平肉鸡高于瘦鸡。 HMGA1 基因在肉鸡肝脏中高腹部脂肪组和低腹部脂肪组之间表现出明显的表达差异,在高腹部脂肪组中表达高。 肥胖基因 FTO ,在鸡上报道较少。 PPARγ 是调节腹部脂肪沉积的关键因素,也是体外鸡腹部脂肪细胞发育的主要调控因子。 GNPDA2 可以调节人和鸡中的脂肪沉积。 上位性是两个或多个基因或其mRNA或蛋白质产物之间的相互作用,以影响单个性状。或者一个基因的产物可能抑制另一个基因的表达。 CNV是基因组结构变异的一种形式,其中大的DNA片段被复制或缺失,腹部脂肪性状的选择性育种可能导致CNV修饰。 SNP在非编码区的发生频率要高于基因组的编码区。通常,核苷酸水平的遗传变异会影响从基因到蛋白质表达的转录和翻译,进而影响脂肪组织的发育。 GWAS是一种能够使用致密的基因组标记物筛选大多数或整个基因组的技术,可以识别基因组DNA中与特定性状相关的SNP和其他变体。 在鸡中,研究表明 FABP4,IGF1,TGFB3 和THRSPα 中的DNA多态性与腹部脂肪性状显着相关, L-FABP 也可能参与脂质代谢。 PUM1,SNRNP40,ZNF521,ASB6**与腹部脂肪有关,但不清楚在脂肪沉积中的作用。 使用GWAS发现腹部脂肪含量最高的鸡与腹部最低脂肪的鸡相比, RET,NPPB 和SREBF1 的 表达明显上调, COL12A1,VPS4B,BRSK2和FOXC1 的表达明显下调。 RET,NPPB和SREBF1 在人的脂质代谢中起作用, SREBF1 参与北京油鸡的脂肪代谢。 这项全基因组特征分析确定了10个候选基因[ 视网膜母细胞瘤1(RB1),Bardet-Biedl综合征7(BBS7),单胺氧化酶A(MAOA),单胺氧化酶B(MAOB),EH结构域结合蛋白1(EHBP1),LRP2结合蛋白(LRP2BP),低密度脂蛋白受体相关蛋白1B(LRP1B),肌球蛋白VIIA(MYO7A),肌球蛋白IXA(MYO9A)和磷酸核糖焦磷酸合成酶相关蛋白1(PRPSAP1) 可能在鸡腹中起作用脂肪堆积 与微阵列相比,RNA-Seq具有更宽的动态范围和更高的灵敏度,具有新颖的转录本和长非编码RNA检测功能 前脂肪细胞是未分化的成纤维细胞,可以通过不同的方式刺激以形成脂肪细胞。 脂肪形成是一个过程,其中未分化的间充质前体分化为 前脂肪细胞 ,然后经历二次分化阶段,成为成熟的脂肪细胞。 脂肪形成可以通过各个阶段完成,包括间充质前体(增殖;能够分化),定型前脂肪细胞(增殖,分化),生长停滞的前脂肪细胞(增殖丧失),有丝分裂克隆扩张(细胞分裂),终末分化(细胞周期停止; PPARγ和C/EBPα诱导 )和成熟的脂肪细胞(脂质填充的脂肪细胞;脂肪细胞基因转录激活;脂肪细胞基因表达升高) 在鸡肉中, FATP1、KLF 2以及PPARγ、C/EBPα 在体外控制脂肪沉积(需要阐述机制)。在哺乳动物中, GATA 2和3 对脂肪生成有负调控。在鸡中, KLF2 上调 GATA2 表达,因此鸡中的 GATA2 和 GATA3 可能具有与哺乳动物类似。 与鸡脂肪形成有关的信号通路:Wnt,MAPK、TGF-b、甘油脂代谢、mTOR信号传导、PPAR信号传导、丙酸酯代谢、脂肪酸代谢、氧化磷酸化。 miRNA调节广泛的生物学过程,包括脂肪形成,脂质代谢,细胞增殖与分化,生长,凋亡,癌变和疾病。 lncRNA可能顺式作用于邻近的蛋白质编码基因上,以控制腹部前脂肪细胞的分化 在脂肪组织发育过程中,表观遗传调节剂能够促进一组选择性基因的转录并参与脂肪形成。脂肪形成过程中的基因表达也可以通过表观遗传修饰(例如DNA甲基化)来调节。
胆固醇合成调节基因
SREBF1 :固醇调节元件结合转录因子1 This gene encodes a basic helix-loop-helix-leucine zipper (bHLH-Zip) transcription factor that binds to the sterol regulatory element-1 (SRE1), which is a motif that is found in the promoter of the low density lipoprotein receptor gene and other genes involved in sterol biosynthesis. 该基因编码一个碱性螺旋-环-螺旋-亮氨酸拉链(bHLH-Zip)转录因子,与LDLR基因启动子和固醇生物合成的其他基因启动子中的基序-固醇调节元件1(SRE1)结合。 The encoded protein is synthesized as a precursor that is initially attached to the nuclear membrane and endoplasmic reticulum. 编码的蛋白质合成前体后,该前体最初附着于核膜和内质网。 Following cleavage, the mature protein translocates to the nucleus and activates transcription. This cleaveage is inhibited by sterols. 切割后,成熟蛋白易位至细胞核并激活转录。这种切割被固醇抑制。 SREBF2 :固醇调节元件结合转录因子2 This gene encodes a member of the a ubiquitously expressed transcription factor that controls cholesterol homeostasis by regulating transcription of sterol-regulated genes. 该基因编码一种广泛表达的转录因子的成员,该转录因子通过调节固醇调节基因的转录来控制胆固醇稳态。 The encoded protein contains a basic helix-loop-helix-leucine zipper (bHLH-Zip) domain and binds the sterol regulatory element 1 motif. 编码的蛋白质包含一个基本的螺旋环-螺旋-亮氨酸拉链(bHLH-Zip)域,并结合甾醇调控元件1基序。 SCAP : This gene encodes a protein with a sterol sensing domain (SSD) and seven WD domains. 该基因编码的蛋白质具有一个甾醇感应结构域(SSD)和七个WD结构域。 In the presence of cholesterol, this protein binds to sterol regulatory element binding proteins (SREBPs) and mediates their transport from the ER to the Golgi. The SREBPs are then proteolytically cleaved and regulate sterol biosynthesis. 在胆固醇存在的情况下,与甾醇调节元件结合蛋白(SREBPs)结合,并介导其从ER到高尔基体的转运。然后SREBPs被蛋白切割并调节甾醇的生物合成。
人们都说黑色玫瑰是罕见的,黑玫瑰与红玫瑰的基因差别在哪?
它们里边的色素不同,还有就是人们在培育它的时候使用的肥料以及照顾方面也有很大的不同。
怎么用encode来查找转录因子下游基因
转录因子一半都结合在被调控基因的promoter区域,可以做一个chip-seq实验,然后在基因组数据库中定位这些与该转录因子结合的DNA区域.那么这些区域的下游附近的基因就很可能是受该转录因子调控的基因。然后在针对这些疑似基因做转录因子KO之后的该基因mRNA水平检测(realtimePCR)确定是否受其调控。
如何能证明基因突变的自发性和不对应性
基因突变自发性和不对应性实验证明,三个经典实验:变量实验,涂布实验,影印实验突变的性状与引起突变的原因间无直接对应关系!变量实验(fluctuation test)Salvador Luria and Max Delbruck(1943)Newcombe的涂布实验(1949)影印法影印实验(replica plating )Joshua Lederberg and Esther Lederberg(1952)诱变剂与致癌物质——Ames试验 "生物化学统一性"法则:所有生物 的DNA在结构及特性上具有一致性人和细菌在DNA的结构及特性方面是一致的,能使 微生物发生突变的诱变剂必然也会作用于人的DNA, 使其发生突变,最后造成癌变或其他不良的后果.
红皮核桃是不是转基因
不是吧
肺癌晚期靶向治疗的基因检测作用大不大?
晚期肺癌患者还是很有必要做基因检测的,并且在医院看病时医生也会推荐患者进行基因检测,我爷爷当时就是在和瑞基因做了基因检测,后来吃的药,往往稍微了解一下就知道,通过基因检测,可以找到适合的靶向药物,从而达到更好的治疗效果。
肺癌容易脑转移 基因检测+标靶成灭癌利器
根据卫生福利部104年国人死因统计,十多年来,肺癌一直是癌症死亡榜首。台北荣民总医院胸腔部主治医师蔡俊明表示,肺癌患者很容易出现脑转移,由于大脑有血脑屏障,因此一般药物很难进入大脑,大脑常成为肺癌细胞的「避难所」。 找出关键基因 选择适合药物 肺癌依病理特征主要分为小细胞肺癌与非小细胞肺癌,约九成患者为非小细胞肺癌。肺癌治疗目标是要抑制肿瘤生长,目前已知有许多关键基因可作为治疗标的,除较为人熟知的EGFR(表皮生长因子接受器),2007年新发现的ALK(间变性淋巴瘤激酶)也有对应标靶治疗药物,医师建议,患者应先进行基因检测,找出关键致病基因,再搭配合适的药物,以增进治疗效果、减少副作用发生。 以EGFR阴性的肺癌病友来说,约10-15%的患者有ALK基因易位突变现象,研究也发现,ALK基因易位、突变的肺癌患者,以没有抽菸或只有轻度抽菸史的族群与较年轻、平均年龄52岁族群、女性族群为主。 新一代ALK肺癌标靶药物 有助增加存活期 蔡俊明医师表示,目前针对ALK肺癌已研发出新一代标靶用药,可专一抑制ALK活性,直接锁定、消灭癌细胞,在今年(2016年)6月ASCO发表的一项日本大型临床试验显示,新一代标靶药物的反率高达94%,中位数无恶化存活期已超过29个月,且持续延长中。若做为第二线标靶治疗,反应率仍高达52%,中位数无恶化存活期亦达8.2个月。 蔡俊明医师进一步说明,多项国内外临床试验显示,新一代ALK标靶治疗安全性很高,服用后腹泻、反胃、便秘、呕吐、疲累等副作用发生比率较低,不过长时间用药,也可能产生抗药性。 新型药物可进入大脑 歼灭癌细胞 另外,目前市面上的抗癌药物不易进入脑部,尽管对肺部肿瘤有效,但治疗后仍有四成患者出现脑转移,医师指出,新一代ALK标靶药物也可穿过血脑障蔽,进入大脑组织,有效对付癌细胞,甚至可预防、延缓脑转移。 定期接受健康检查 才能及早发现病灶 蔡俊明医师呼吁,在日常生活中应多注意肺癌危险因子;最好定期进行健康检查,及早发现、积极治疗。而肺癌患者也应正向积极,接受EGFR、ALK等基因筛检,并配合医师选择适合治疗策略。 订阅【健康爱乐活】影音频道,阅读健康知识更轻松 加入【】,天天关注您健康!LINE@ ID:@ : /cancer/article/30705/肺癌容易脑转移 基因检测标靶成灭癌利器 关键字:肺癌, ALK, 标靶药物, 蔡俊明, 台北荣总, 血脑屏障
正常人检测eml-4alk融合基因能有癌细胞吗
不一定,有些癌细胞基因未必会表达出来,建议多次检查TK1
EML4-ALK融合基因检测为什么用RNA逆转录
肿瘤不用RNA逆转录用什么?
Cell:吃不胖是天生的,科学家发现“瘦基因”
英研究发现:有过妊娠糖尿病,将来2型糖尿病风险高10倍!研究员开发出治疗鼻咽癌的新型抗病毒靶向药物疗法!Nature:IgE的唾液酸化是导致过敏致病性的决定因素美科学家:抑制天花的牛痘病毒可用于制造COVID-19疫苗! 在你我身边应该有那么一些人,他们想吃什么就吃什么、几乎也不运动,但就是永远不会变胖。到底是他天生就这么幸运吗?现在,发表于《Cell》杂志上的一项研究中科学家发现了一种基因,就是使这些天生幸运的人可以永保纤瘦的原因。该基因在代谢健康的瘦弱人群中可抵抗体重增加且结果显示删除该基因可导致苍蝇和小鼠变瘦,并发现其在大脑中的表达可能与调节能量消耗有关。 癌症标靶基因竟与苗条有关? ALK其实是一个众所周知与癌症相关的基因,ALK基因编码的蛋白质在细胞通讯以及神经系统的发育和功能中起关键作用,而ALK基因的突变与非小细胞肺癌和神经母细胞瘤有关。 在一项健康研究数据库的分析之后,由英属哥伦比亚大学生命科学研究所所长、医学遗传学系教授Josef Penninger所领导的国际科学家团队发表于《Cell》期刊中的一项研究指出,ALK基因的某些变异与自然瘦弱的人体重增加的敏感性低有关。缺乏ALK基因的转基因小鼠也显示出明显的肥胖抵抗力。 迄今为止,大多数研究都集中在肥胖上,很少研究是针对人类或动物模型中的纤瘦。Penninger指出:「每个人都研究肥胖症和肥胖症的遗传。但我们认为,‘让我们扭转局面,开始一个新的研究领域。"我们来研究纤瘦。」所以Penninger团队并没有关注肥胖个体的危险因素,而是从研究苗条的人开始。 研究人员对数据库进行了搜索以寻找与瘦弱有关的遗传线索,该数据库包含来自爱沙尼亚47,102名20-44岁的健康人数据。研究人员进行了全基因组关联研究(genome-wide association study, GWAS),以比较健康瘦弱人群的DNA样本和临床数据(该人群处于6%的最低水平)与体重正常的个体进行比较,以寻找与瘦弱有关的遗传变异。他们针对体重指数低于 18公斤/平方公分的人的遗传特征进行分析,研究结果显示了ALK基因的遗传变异,这些变异是针对瘦人的。 剔除ALK的小鼠消耗更多的热量 他们在ALK基因中发现了两个特定的变体,它们与已知的癌症驱动突变不同,并且与纤瘦度相关。然后他们试图剔除果蝇中的同等基因。研究小组发现,这大大降低了血液中的脂肪含量。他们接着研究了ALK在小鼠中的作用,与将ALK基因耗尽的动物对照组进行了比较。两组的食物摄入量,每日活动量和肠道脂质吸收量相同,但剔除ALK的小鼠体重减轻且葡萄糖耐受度提高。 此外,以高脂饮食挑战这些囓齿动物的结果显示,剔除ALK的小鼠逃过了体重的增加,然而正常小鼠却因此变得肥胖。研究小组报告说,没有ALK的小鼠似乎会消耗更高的卡路里。即使ALK基因剔除的小鼠的饮食和活动量与正常小鼠相同,它们从幼年起仍表现出较低的体重和体脂,并一直持续到成年。进一步的分析表明,在大脑中高度表达的ALK可能在指示脂肪组织燃烧更多能量方面起作用。 From: Cell ALK抑制剂未来可能用于肥胖症的治疗策略 ALK已经是公认的抗癌靶标,研究人员建议以该基因为靶标可能可以做为未来针对肥胖症的治疗策略。 研究第一作者、维也纳分子生物学研究所的博士后研究员Michael Orthofer在新闻稿中说,该基因在消化系统外起作用。 Orthofer解释说:「我们的研究表明,ALK在大脑中起作用,它通过整合和控制能量消耗来调节新陈代谢。」 资深作者、英属哥伦比亚大学的生命科学研究所所长、医学遗传学系教授Josef Penninger指出了可能的未来研究,确定ALK如何调节人的新陈代谢以促进瘦身。Penninger在一份声明中说:「仔细想一想,我们可以透过关闭ALK并降低ALK功能来确立我们是否仍保持纤瘦。目前ALK抑制剂已经使用于癌症治疗,我们可以透过它来抑制ALK,且实际上我们也会来尝试这样做。」
ALK基因检测阳性靶向药物有哪些常见不良反应?
ALK基因靶向药物常见的不良反应:ALK-TKI治疗最常见的不良反应(≥25%)为视觉异常、恶心、呕吐、腹泻、便秘、水肿、转氨酶升高及疲乏。但通常这些反应的级别较低,主要为1或2级2。
哪些肺癌需要接受ALK融合基因检测?
对于晚期非小细胞肺癌,推荐所有腺癌或含腺癌成分的非小细胞肺癌患者,在诊断时常规进行ALK融合基因或ALK融合蛋白检测。 对于小活检标本或者不吸烟的鳞状细胞癌患者也建议进行ALK检测。 ALK融合基因在不吸烟或少吸烟的肺腺癌患者中发生比率较高,且通常与EGFR基因突变不同时存在于同一患者。
为什么肺癌要做ALK基因检测?
说了实话可能会有人来反对。这个检测不是真正的基因检测,是查的生理指标。如果是阳性,可以采用所谓的定向药物,延续一点生命而已。效果十分有限。
肺腺癌基因突变ALK能活多久
肺腺癌基因突变ALK,黄金突变会像慢性病一样长期生存。对于不同情况的基因突变,自己也可以用不同的药物进行治疗。不少年轻人都有吸烟的习惯,这也是对自己的身体不负责任。自己不要去大量吸烟,一定要减少自己吸烟的次数。身体里已经有了基因突变,而且也会像慢性病一样长期的存在。自己也要去查一查看一看还有没有其他疾病的存在,不能够让肺部疾病变得越来越多。许多人都不明白肺腺癌基因突变ALK 是一种什么样的疾病,其实是有不同含义的。在这种疾病当中,如果黄金突变的话也可能会缩小自己的肺癌。有这种疾病一定要早发现早治疗,这样的效果才会比较好一点千万不能够一拖再拖。不同种类的疾病自己治疗的感觉是不一样的,而且要吃一定的要进行克制。发现自己身体一日不如一日的时候,就得及时的去医院做手术。不能够不把黄金突变当回事儿,这个时候自己也会很严重。年轻人一定要让自己有一个好习惯,不能够去时常糟蹋自己的身体。身体里如果有融合基因的话,自己也要防止染色体的变化。在发生突变的时候是谁也往往想不到的事情,但自己一定要坚持治疗。保持一个良好的心态,这样自己才能够战胜疾病才不会让自己越来越糟。不管什么时候,一定要及时的去体检有疾病才能够及时的发现。总的来说肺部出现疾病的就是因为自己没有克制住自己,总是去吸很多的烟。年轻时不把自己的身体当回事,等到老了之后自己就会非常的后悔。有疾病之后再想着去改掉一切的东西就已经晚了,要时时刻刻的叮嘱自己。
肺腺癌基因突变ALK是什么意思
肺腺癌基因突变ALK,黄金突变会像慢性病一样长期生存。对于不同情况的基因突变,自己也可以用不同的药物进行治疗。不少年轻人都有吸烟的习惯,这也是对自己的身体不负责任。自己不要去大量吸烟,一定要减少自己吸烟的次数。身体里已经有了基因突变,而且也会像慢性病一样长期的存在。自己也要去查一查看一看还有没有其他疾病的存在,不能够让肺部疾病变得越来越多。许多人都不明白肺腺癌基因突变ALK 是一种什么样的疾病,其实是有不同含义的。在这种疾病当中,如果黄金突变的话也可能会缩小自己的肺癌。有这种疾病一定要早发现早治疗,这样的效果才会比较好一点千万不能够一拖再拖。不同种类的疾病自己治疗的感觉是不一样的,而且要吃一定的要进行克制。发现自己身体一日不如一日的时候,就得及时的去医院做手术。不能够不把黄金突变当回事儿,这个时候自己也会很严重。年轻人一定要让自己有一个好习惯,不能够去时常糟蹋自己的身体。身体里如果有融合基因的话,自己也要防止染色体的变化。在发生突变的时候是谁也往往想不到的事情,但自己一定要坚持治疗。保持一个良好的心态,这样自己才能够战胜疾病才不会让自己越来越糟。不管什么时候,一定要及时的去体检有疾病才能够及时的发现。总的来说肺部出现疾病的就是因为自己没有克制住自己,总是去吸很多的烟。年轻时不把自己的身体当回事,等到老了之后自己就会非常的后悔。有疾病之后再想着去改掉一切的东西就已经晚了,要时时刻刻的叮嘱自己。
肺基因突变ALK会怎样?
肺腺癌基因突变ALK,黄金突变会像慢性病一样长期生存。对于不同情况的基因突变,自己也可以用不同的药物进行治疗。不少年轻人都有吸烟的习惯,这也是对自己的身体不负责任。自己不要去大量吸烟,一定要减少自己吸烟的次数。身体里已经有了基因突变,而且也会像慢性病一样长期的存在。自己也要去查一查看一看还有没有其他疾病的存在,不能够让肺部疾病变得越来越多。许多人都不明白肺腺癌基因突变ALK 是一种什么样的疾病,其实是有不同含义的。在这种疾病当中,如果黄金突变的话也可能会缩小自己的肺癌。有这种疾病一定要早发现早治疗,这样的效果才会比较好一点千万不能够一拖再拖。不同种类的疾病自己治疗的感觉是不一样的,而且要吃一定的要进行克制。发现自己身体一日不如一日的时候,就得及时的去医院做手术。不能够不把黄金突变当回事儿,这个时候自己也会很严重。年轻人一定要让自己有一个好习惯,不能够去时常糟蹋自己的身体。身体里如果有融合基因的话,自己也要防止染色体的变化。在发生突变的时候是谁也往往想不到的事情,但自己一定要坚持治疗。保持一个良好的心态,这样自己才能够战胜疾病才不会让自己越来越糟。不管什么时候,一定要及时的去体检有疾病才能够及时的发现。总的来说肺部出现疾病的就是因为自己没有克制住自己,总是去吸很多的烟。年轻时不把自己的身体当回事,等到老了之后自己就会非常的后悔。有疾病之后再想着去改掉一切的东西就已经晚了,要时时刻刻的叮嘱自己。
肿瘤个体化治疗的致癌驱动基因ALK的发现
EML4-ALK融合出现在大约3-5%的非小细胞肺癌中,具体因研究的人群和使用的ALK检测方法的不同而有所差别[1]。EML4-ALK是非小细胞肺癌唯一驱动突变2007年两个独立研究小组在非小细胞肺癌中分别鉴定出ALK基因重排。其中一组研究人员开发了逆转录病毒cDNA表达库用于筛选新癌基因。他们转染了提取自一位预先筛选显示KRAS和EGFR突变阴性的62岁日本男性吸烟者肺腺癌的cDNA文库,并设计生成了转基因小鼠,在肺泡细胞中特异性表达EML4-ALK,由此生成了许多肺腺癌结节。使用ALK抑制剂治疗这些转基因小鼠导致肿瘤负荷相比于未治疗的小鼠减小。大部分小鼠很快在1个月内死亡。使用相同ALK抑制剂治疗导致肺脏无EML4-ALK/3T3细胞浸润且生存期延长。此研究有力证实了EML4-ALK是非小细胞肺癌中唯一的驱动突变,并且在体内抑制EML4-ALK活性会导致肺癌负荷减少 。ALK融合基因的产物是分子量为80 kD的融合肿瘤蛋白,其转化细胞的能力已得到公认。P80NPM-ALK通过使大鼠纤维母细胞发生锚非依赖性(anchorageindependent)生长,增殖率明显增高;此外,它还可使Ba/F3细胞转变为ILue0113非依赖性。通过逆转录病毒将NPM-ALK转染小鼠骨髓细胞,这些小鼠随之发生了T细胞和B细胞性大细胞淋巴瘤。尽管因npm的独特功能P80NPM-ALK在细胞核内有集聚现象,但NPM对于ALK的转化作用并不是必需的,因为研究发现:其他基因与ALK基因发生融合,也可激活ALK,虽然这些肿瘤蛋白未在核内集聚,仍可使细胞发生恶性转化。这一发现与临床上一些现象完全吻合:多种涉及ALK基因的染色体易位,均可引起ALK的结构性活化而引起ALCL。故这一组疾病又被称为ALK阳性淋巴瘤或ALKoma鉴定非小细胞肺癌中的“驱动激酶”同时,另一组研究人员采用磷酸化蛋白质组学方法,确定了191个非小细胞肺癌细胞系,和肿瘤样本中磷酸化酪氨酸的特点,从而鉴定出ALK是非小细胞肺癌中的“驱动激酶”。因此,两组研究分别采用两种不同方法确定了ALK易位,这在常见恶性实体瘤中尚属首次。
基因检查结果alk融合基因和ROS]融合基因为野生型什么意思?
野生型意思就是这两个基因和正常情况一样,没有发生基因融合,直白地说就是这个检查项目结果是阴性的。ALK融合基因和ROS1 融合基因一般是在肺癌中会进行检测:ALK融合基因在非小细胞肺癌中的比例较低,国外文献报道阳性率为2%~7%;国内研究结果显示阳性率为3.4%;ROS1 融合基因在非小细胞肺癌中阳性率约为3%。做这两项检查有什么意义呢?文献上报道,如果发生ALK融合基因或ROS1 融合基因,条件允许的话是可以应用相应的靶向药物-克唑替尼进行治疗的,不过最终还是需要专业的临床医生最后给出治疗方案。
alk基因存在融合是阴性还是阳性
alk基因存在融合是阴性还是阳性1关键是要看融合基因,融合基因转阴提示预后好,但是如果在以后的路上融合基因转为阳性(排除假阳性),即使骨髓仍为CR,也预示复发可能性! 2骨髓CR后做流式细胞,没有什么意义! 3在白血病完全缓解期,感觉和正常人一样的,没有社么特殊要求,该病治愈的可能性是很大的!但是到什么时候具体治愈,这个不好说,如果一辈子没事,那就叫治愈。 4现在主流的治疗就是完全缓解后3-4次化疗,根据融合基因的情况决定是否上中剂量-Ara-c化疗。以后以维甲酸,亚砷酸,及口服化疗维持治疗大概3年左右。 5你的腰穿次数有些少,一般6次。因为以前本病死亡率高,根本看不到脑白的发生,现在治疗的效果好,病人生存期长,发生脑白的情况相对可见到,因此需要注意一下。
ALK基因融合检测到阳性?是什么意思?
ALK是一种间变性淋巴瘤激酶,最早是在间变性大细胞淋巴瘤的一个亚型中被发现。但近年在有些肺癌中发现ALK阳性,ALK阳性为ALK基因重排,ALK阳性的肺癌是最近发现的肺癌的一种分子亚型,主要发生于非小细胞肺癌,约占肺癌的3%-5%,如果能够准确的鉴定出ALK重排阳性的非小细胞肺癌,则可以给予相应的治疗,比如口服克唑替尼。
最全梳理ALK基因突变和对应的靶向药物
间变性淋巴瘤激酶(ALK)突变的形式有过量表达、与其他基因形成融合基因,发生点突变等等。ALK基因融合突变是非小细胞肺癌(NSCLC)常见的一种驱动基因,中国非小细胞肺腺癌中ALK融合突变阳性的比例为5.3%,在非小细胞肺腺癌、年轻患者(小于60岁)以及不吸烟的人群中发生率较高,ALK阳性的非小细胞肺癌被认为是一种分子亚型,相对应的靶向药物与EGFR分子亚型完全不同。ALK融合基因突变主要在肺腺癌里常见,一般肺鳞癌患者ALK融合基因突变概率很低,有报道说1400个肺鳞癌患者里ALK融合基因的发生率为1.3%。考虑到ALK总体突变频率仅有5%,所以对于鳞癌患者也是可以做一下ALK检测的。由于非小细胞肺癌里的驱动基因突变一般是互相排斥的,或者说一山不容二虎,癌细胞也没有必要搞两个驱动突变。有研究说亚裔的EGFR、KRAS野生型的腺癌患者,ALK阳性比例高达30%-42%,因此如果发现EGFR和KRAS是野生型,是更有必要测下ALK基因的。一、ALK融合突变的检测图1:非小细胞肺癌中ALK的重排形式据报道,目前已发现21种EML4-ALK的融合形式,另外ALK还可能与TFG、KIF5B、KLC1、PTPN3、STRN等基因发生融合,因此ALK融合突变的诊断是存在一定难度的。下表是关于ALK融合突变的诊断方法,及其相应的特点。表1:ALK基因检测的方法需要注意,临床常用的三种方法是FISH、Ventana IHC及RT-PCR,三种方法FISH的灵敏度最低。因此,如果是胸腔积液、细针穿刺取到的细胞学样本做成的蜡块,不建议使用FISH,避免假阴性。另外通过抽血检测循环肿瘤DNA(ctDNA),循环肿瘤细胞(CTC)也正在发展起来。总之在面对ALK检测结果模棱两可的时候,一定要换一个检测方法去验证,也没有哪一种方法灵敏度和特异性都是100%。二、ALK的靶向药物ALK融合突变阳性的患者使用克唑替尼可以获益,克唑替尼具有ALK、c-MET、ROS1三个靶点。克唑替尼治疗ALK阳性的非小细胞肺癌客观缓解率达60%,无进展生存期为8-10个月,显著改善并延长的总生存期。需要注意的是,克唑替尼的赠药政策与其他靶向药物不同,第一年买四个月赠八个月,第二年仍需要买四个月,才能终身获赠,合计下来得几十万,价格相对较高,所以使用之前一定明确是ALK突变才行。图2:相比多西他赛、陪美曲塞,ALK阳性的肺癌患者使用克唑替尼获益明显。不管如何,靶向药物都有一个短板就是耐药,使用克唑替尼的患者往往在1-2年内出现对克唑替尼的耐药,以中枢神经系统的复发进展较为常见。表2:ALK耐药的原因和应对策略克唑替尼耐药后,后续还有二代,三代的ALK抑制剂,最近的发现三代ALK抑制剂劳拉替尼(3922)耐药后,患者如果是存在L1198F导致的耐药,可以可以重新用回克唑替尼。几种二代、三代ALK靶向药物的简介如下;1、艾乐替尼(Alectinib,代号CH5424802),效率比克唑替尼强10倍,可对抗大多数的ALK激酶区突变,且对脑病灶控制较好。日本的一项临床研究使用的计量为每次300mg、每日两次,46名患者的43名获得客观缓解(客观缓解率达93.5%),日本已经批准了该药使用,美国FDA也已经批准该药用于克唑替尼治疗后耐药的患者。2016年ASCO会议上报道了一项研究,艾乐替尼一线治疗ALK阳性非小细胞肺癌中的无进展(PFS)显著优于克唑替尼。克唑替尼的中位PFS为10.2个月,而艾乐替尼的中位PFS要大于20.3个月。相比克唑替尼,艾乐替尼使得疾病恶化或死亡风险显著降低66%。该药2、色瑞替尼(Ceritinib,LDK378),对C1156Y具有良好的活性,该药的最大耐受计量为每天750mg,亚裔人的耐受计量可能到不了那么高,又说600mg的。79例克唑替尼耐药的ALK阳性非小细胞肺癌使用该药后,ORR为57%。一项涵盖114名患者的临床表明色瑞替尼的中位PFS为8.6个月。最常见的副作用是恶心、腹泻、呕吐和乏力。有患者反映色瑞替尼的副作用非常大,很少有人耐受,但是如果撑过去了则可能获益期较长。3、Brigatinib(AP26113),一种新型的ALK和EGFR双重抑制剂,可强效抑制ALK的L1196M突变和EGFR的T790M突变。2016年ASCO会议上公布的一项研究结果,即将患者1:1随机分为两组,A组患者每天口服Brigatinib药物90mg,B组患者前7天每天口服Brigatinib药物90mg,后面加量到180mg,两组人群的ORR分别为46%/54%,A组有一例证实的完全缓解,B组有五例证实的完全缓解,中位PFS分别为8.8个月/11.1个月。证明了该药良好获益。4、劳拉替尼(Lorlatinib,PF06463922),该药应该算是第三代ALK抑制剂,可抑制克唑替尼耐药的9种突变,具有较强的血脑屏障透过能力,入脑效果较强,特别适合对其他ALK耐药的晚期NSCLC患者。2016年6月5日,辉瑞在ASCO会议上公布了该药的I/II期临床研究数据,入组的54例患者有41例为ALK阳性,12例为ROS阳性,其中39例有脑转移。该临床试验最终确定的给药方案为每日1次100mg,患者的总应答率为46%,3例实现完全应答,16例实现部分应答,中位PFS为11.4个月,另外还显示出缩小转移性的脑部肿瘤体积的效果。另外还有几个药物如X-396,ASP3026等,其相应的靶点和相关数据见下图,如有兴趣的可以追溯相关参考文献进行延伸阅读。图3:ALK新一代抑制剂的特点,最后两列为可以克服的克唑替尼耐药位点,以及无能为力的位点。三、HSP90抑制剂与ALK耐药联合热休克蛋白(HSP90)是一类称为“分子伴侣”的蛋白质,可帮助新合成的蛋白质形成发挥他们特定生物学功能的正确形状。体外细胞系研究发现HSP90抑制剂Ganetespib对ALK阳性的细胞系有活性,且不管是否经过克唑替尼处理都是如此(见下图)。我们可以看到突变的EML4-ALK和HSP90是需要相互结合的。目前有关HSP90抑制剂Ganetespib的临床试验正在进行中。另一种HSP90抑制剂是AUY922,目前正在进行ALK阳性的NSCLC的II期临床试验,每周计量70mg/平米。疾病控制率为59%(未经克唑替尼治疗的控制率为100%,克唑替尼耐药组的为36%)。图4:ALK阳性NSCLC的靶向治疗机制四、EGFR和ALK双突变患者普遍认为,ALK和EGFR基因是互斥的,因为肿瘤其实没有必要制造两个驱动基因。但是对于后期经过多种治疗后,反复耐药的患者。EGFR和ALK共存的概率也不容忽视。对于这一部分患者,联合使用EGFR和ALK的抑制剂较好,比单独使用一种起到更好的控制作用,但是联合治疗副作用会较大,也需要看患者的耐受情况。目前关于两类靶向药物联用效果、副作用等还缺乏数据。当然这部分患者可以考虑下Brigatinib(AP26113),该药是ALK和EGFR双靶点的抑制剂,可以考虑参加入组试验等。但问题是该药可以抑制EGFR和ALK守门员突变(T790M,L1196M),如最开始就使用Brigatinib,这可能是把最后一张牌给打了。笔者曾见过一个原发性双突变的患者,同时具有EGFR和ALK阳性,该患者的治疗情况也将及时追踪,后续再和大家呈报。五、什么时候停药即便是出现局部进展,也不是立刻停止克唑替尼等靶向药物的理由,因为可能还有很多癌细胞被药物所抑制。立即停止靶向药物,会导致肿瘤的爆发性进展。一项关于使用克唑替尼抑制ALK阳性非小细胞肺癌的研究发现,克唑替尼治疗进展后,继续使用克唑替尼相比停止克唑替尼的患者获益更好。6个月总生存率为76.3% vs 31.2%,1年总生存率为64.7% vs 32.9%,OS为16.4个月 vs 3.9个月。也有部分患者使用克唑替尼后,肿瘤病灶快速消失掉了,于是患者把药给停止了,后来导致报复性的复发,有些患者再用克唑替尼也控制不了,即是一种脱靶效应,虽然这其中的机理不知道,但是确实是存在的。这些现象是某些患者的血泪教训,虽然没有临床数据,但值得警惕。因为CT看不到肿瘤了,不代表肿瘤细胞完全被杀灭干净了。停药是一个非常谨慎的事情,望广大患者和家属慎之再慎。六、完美的闭环?劳拉替尼(Lorlatinib,PF06463922)被作为ALK靶点的最后一张王牌,因为克唑替尼耐药的所有位点该药似乎都能克服。直到出现了L1198F。新英格兰医学杂志报道了一名患者治疗经过(见下图)。该患者首先使用克唑替尼,耐药后检测发现了C1156Y,但是这个患者对二代ALK抑制剂没有应答,不得已使用劳拉替尼,但是后面新出现的L1198F导致对劳拉替尼耐药,看似山穷水尽,却不曾想L1198F突变导致了与克唑替尼结合更好,逆转了C1156Y的作用,患者对克唑替尼重新复敏。 图5:L1198F导致的劳拉替尼耐药对克唑替尼重新复敏这是一个非常有意思的发现,即劳拉替尼这个药物也不是最后的一张牌,这个药物耐药了,也许之前被放弃的药物仍可以有效。所以也有说法ALK是一种钻石突变。但需要谨慎的是不是每一个劳拉替尼耐药的患者都这样。我们从图示看出患者同时存在C1156Y和L1198F突变,才造成了这种逆转。也许其他的突变位点如L1196M等和L1198F就没有这种协同效果。或者还有可能劳拉替尼耐药的原因是其他的旁路激活,如KRAS或EGFR等,具体的还是可以根据基因检测结果来谨慎分析和对待,不过现在的测序技术抽血测ctDNA检测ALK的这些激酶突变总可能会有阴性,ArmsPCR等检测方法也还没有相应的产品,暂时只能尽量地取耐药后的新发组织样本,进行二代测序检测。编者:翱宇参考文献:1、冯勤杨欣林冬梅,ALK阳性非小细胞肺癌的诊断,中国肺癌杂志2 0 1 5年2月第1 8卷第2期。2、蒋涛周彩存,中国肺癌杂志2015年2月第1 8卷第2期3、Alice T, J Clin Oncol.2013 Mar 10; 31(8): 1105–11114、Clin Cancer Res. 2014March 1; 20(5): 1204–12115、Ou SH , et al. Ann Oncol,2014, 25(2): 415-422.6、Zhang I,Lancet Oncol. 2015Oct;16(13): e510-217、Ther Adv Med Oncol. 2016Jan;8(1):32-478、Shaw AT et al, N Engl J Med. 2016 Jan7;374(1):54-61
ALK基因检测有哪些方法?
ALK基因的检测方法有很多种。包括检测DNA层面的FISH(荧光原位杂交),RNA层面的RT-PCR,以及检测蛋白的免疫组化方法。这几种方法都已通过许多临床试验验证。另外,近些年还有高通量基因测序的方法可以对包括EGFR,ALK,KRAS,ROS1等在内的一组基因同时检测的方法,这类方法目前还没有获得相应临床试验认证,仍旧处于研发阶段,对于结果需要谨慎解读。
ALK阳性非小细胞肺癌基因检测?
根据肺癌组织的癌细胞病理特征分:非小细胞肺癌(NSCLC)约占85%,小细胞肺癌(SCLC):约占15%。对于晚期非小细胞肺癌,推荐所有腺癌或含腺癌成分的非小细胞肺癌患者,在诊断时常规进行ALK融合基因或ALK融合蛋白检测。对于小活检标本或者不吸烟的鳞状细胞癌患者也建议进行ALK基因检测。2009年Shaw等将ALK基因重排阳性的肺癌列为非小细胞肺癌的一个特定分子亚型。ALK融合型非小细胞肺癌不仅是基因序列层面的改变,ALK融合蛋白也是该类疾病中重要变异,因此将此类疾病统称为“ALK阳性非小细胞肺癌”。ALK阳性非小细胞肺癌,是一类驱动基因明确的肺癌类型。这一类型的非小细胞肺癌,对于新型靶向药物--ALK抑制剂高度敏感。中国非小细胞肺癌中ALK阳性率为3-11%,每年新发病例数约35000例。对于基因突变阳性的ALK阳性非小细胞肺癌,靶向治疗无疑成为他们更好的治疗选择。
ALK基因检测是什么?
ALK基因变异是非小细胞肺癌的一种分子亚型,该亚型的人群特征多发于年轻,肺腺癌,非吸烟人群。ALK基因检测是一种对ALK基因是否正常的一种诊断方法。ALK是一种间变性淋巴瘤激酶,最早是在间变性大细胞淋巴瘤的一个亚型中被发现。随后,在发现非小细胞肺癌中有ALK基因重排之前,在弥漫性大B细胞淋巴瘤和炎症性肌纤维母细胞瘤(IMT)中分别发现了有多种类型的ALK基因重排,至此证明ALK是强力致癌驱动基因。ALK基因重排非小细胞肺癌的发生约占非小细胞肺癌的3%-5%,不同种族的发生率无明显差异。ALK基因重排非小细胞肺癌患者往往是年轻人(确诊时大约50岁),和从不吸烟者(约70%-75%),或少量吸烟者。绝大多数表现为腺癌,且无性别倾向。与有EGFR突变的患者相比,ALK阳性患者确诊时中位年龄较为年轻(分别为61和57岁),从未吸烟者或少量吸烟者所占比例较高(一生<100支香烟;48%对比67%)。如果能够准确的鉴定出ALK重排阳性则可以给予相应的治疗。想要了解更多有关基因检测的相关信息,推荐咨询海普洛斯。海普洛斯在基因测序领域具有独创技术和核心优势。其自主研发的专利试剂,可以精准捕获不同癌症的DNA片断。且成功率在99%以上,捕获深度具有高度的均一性。在完成捕获之后,利用海普洛斯的超微量DNA建库和扩增方法,可以获得信息丰富,完整的DNA文库,然后进行高通量测序,为进一步的癌症分析提供强力支持。【● 没病有必要做基因检测吗?过来人有话说......】
什么是clk基因?推荐几个可以阅读的文献也行
clk 是Cyclin-dependent kinase-like kinases的缩写。建议你先看几篇综述,有个了解在看其他的文献.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25188378http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23809146http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24564546http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23671101
为什么需要reporter 系统,为什么不直接把所需要基因导进去
游离的DNA进入细胞体,一般会直接被分解,就算可以进行转录——翻译成蛋白,游离DNA也无法跟着细胞分裂进行复制,导致子代细胞中不再含有目的基因,也就是说,你费力将基因导入受体细胞,结果只有一个细胞被改变了,整个群体细胞菌落不会有可观察的任何变化.而将基因接入载体,由于载体可以在细胞内复制,随着细胞分裂,载体会带着目的基因存在于每个子代细胞中,最终整个菌落发生可以观察到的变化,基因工程才有意义.基因工程是一个宏观提取——微观改造——宏观检验的过程,就是依靠各种载体实现的
基因很强大,孩子这些行为和表现都是父母遗传的
作为父母,你也许从未意识到孩子从你那里那里继承了一些看不见的东西。 说到遗传,我们通常想到或是理解的都是些看得到或表象的东西,比如外在的,像容貌(单眼皮双眼皮、鼻梁等等)、身高、甚至胖瘦等等,还有生理 健康 方面的,如一些家族疾病的遗传等等。 但是,科学家研究发现,遗传还会影响到一个人的 情感 、情绪、行为习惯。所以,很多时候当我们责备孩子的时候,我们没有意识到,孩子的行为根源竟然来自我们自身。 下面这十个方面我们通常认为是与后天环境有关的,实际是与遗传有关的(尽管不是百分之百)。了解这些,可以帮助我们更好地了解孩子的表现,也能更好地帮助、更有的放矢地培养他们。 一,拖延症 对一些人来说,拖延症就像吃饭、呼吸和睡觉一样自然——这可能是他们从父母那里学来的。根据2014年发表在《心理科学》(Psychological Science)上的一项研究,近一半的拖延倾向可以归因于基因。 二,乐观和同理心 根据《美国国家科学院院刊》(Proceedings of the National Academy Sciences) 2011年发表的一项研究,乐观的人生观可能是一种遗传特征。帮助确定一个人的乐观情绪的催产素受体,也有助于确定另一种积极的人格特征:同理心。这些人有三种特定基因的变异,这是利他主义、亲 社会 行为和更强的应对压力能力的良好预测因子。好消息是,超过一半的人(51.5%)拥有这种遗传。 三,信任他人的能力 对他人的不信任通常是因为环境因素,如果你过去受过伤害、被欺骗,你就不太可能再敞开心扉。然而,信任的倾向可能与生物学有更强的联系。亚利桑那大学2017年的一项研究显示,同卵双胞胎与异卵双胞胎的信任度相似,这意味着人们信任能力的差异可能是遗传造成的。 四,冒险程度 举个例子,滑雪是很危险的运动,一个错误的动作可能会导致脑震荡、骨折,甚至更糟。但那些喜欢这种有风险运动的人可能有基因上的风险倾向。 2012年发表在《斯堪的纳维亚医学与科学杂志》(Scandinavian Journal of Medicine & Science)上的一项针对500名滑雪者和单板滑雪者的研究中,科学家们认为这些人处理多巴胺的效率可能不如其他人,这意味着他们需要冒更大的风险才能感受到同样程度的快乐。 五,运动能力 当谈到运动能力时,很难将基因和环境的影响分开。真正的问题不在于运动能力是否是遗传的,而在于究竟有多少是遗传的,有多少是环境的产物。根据美国国家医学图书馆的研究,研究人员认为30%到80%的运动能力是由基因因素造成的。 六, 音乐能力 音乐能力有很强的遗传影响。根据2014年发表在《心理学前沿》(Frontiers in Psychology)上的一项研究,完美音高和音调失聪多来自家庭遗传,有些人天生比其他人更快地学会分辨音高、节奏和声音模式。 除了音乐能力,你的基因也可能决定你喜欢什么样的音乐。2009年, 科技 公司诺基亚与伦敦国王学院合作进行的一项研究表明,基因影响约占音乐品味的50%。这种关系在流行音乐、古典音乐和嘻哈音乐中最强,但在乡村和民间音乐中几乎不存在。换句话说,爱莫扎特的人从父母那里继承了莫扎特的音乐。 七,智力 智力是一个棘手的课题,几个世纪以来,科学家们一直在争论测量智力的最佳方法。 然而,据伦敦国王学院医学研究理事会 社会 、遗传和发展精神病学中心副主任罗伯特·普洛明说,我们所知道的是,遗传学在智力方面起着重要作用。根据他2016年发表在《科学美国人》(Scientific American)上的文章,对同卵双胞胎的研究表明,大约50%的智力差异可以归因于基因,其余的遗传是在环境意义上,如聪明的父母更多地培养他们的孩子提高认知能力的习惯和技能。 八,驾驶技能 2009年,加州大学欧文分校(University of California, Irvine)的一个研究小组发现,大约每10个人中就有3个人的基因会让他们在开车时表现得更糟。而带有不良驾驶基因的人不仅一开始的驾驶水平较低,而且他们很难纠正错误和学习新的运动技能。 九,对疼痛的容忍程度 个体之间的疼痛难以测量和比较。在2014年美国神经病学协会(American Association of Neurology)年会上发表的一项研究显示,在程度相似的疼痛上,一个人痛得流泪,而另一个人可能觉得无所谓,这种差异至少部分是遗传的。所以,如果孩子在打针时大哭大叫,家长不要马上责备孩子不够勇敢。 十, 面部表情 你可能知道眼睛颜色、头发颜色和耳垂形状等特征是遗传的。然而,根据美国心理学协会的研究,一个人的面部表情也是由基因决定的。正如《科学美国人》2006年报道的那样,一些天生失明的人,或者是出生时就被分开的兄弟姐妹中的一员——尽管从来没有亲眼见过他们,但他们的面部表情却与他们的父母和其他亲戚相似。 所以,如果孩子有撇嘴、皱眉、对眼、翻白眼这样的习惯,家长不能只是申斥孩子,先审查自己是不是就有这些“毛病”。对孩子,就是要从小常常提醒,纠正这些习惯。