genetics

阅读 / 问答 / 标签

Our understanding of human genetics has______considerably. A advanced B cultivated C promoted 填空

同上,答案A。句子意思:我们所理解的人类遗传学已经取得了很大进展。我想补充下, B和C均为及物动词,从语法上讲,用在这个位置一般要用被动语态即在前面加个BE动词。从该句子的意义来讲,A更恰当。

VeritasGenetics是做什么的?

VeritasGenetics是一家基因检测公司,研究产品目前分为三类:.靶向基因检测、myGenome全基因组测试、新产品动态基因组检测,现在正在进行关于α-地中海贫血相关基因的研究。更多同行分析,上企知道了解

frontiers in genetics三个审稿人必须全过吗

是的。梅斯医学MedSci-临床医生发展平台梅斯医学是面向医生的综合互联网平台,应用大数据和人工智能技术链接医生、患者、药械企业等,提供精准数字化医学传播解决方案,优化医疗生态,改善医疗质量。

American-College-of-Medical-Genetics-and-Genomics是什么意思

美国医学遗传学与基因组学

请教PLOS Genetics 投稿经验

朋友你好,直接往要投的报刊、网站或者其他媒体的电子邮箱投稿即可。根据我多年从事文字工作的经验,我认为:如果投稿更有针对性,命中率会更高一些。这就关系到,你是哪里的?干什么的?写的稿件是什么体裁?什么内容?如果说投稿的话,最好投当地的报刊、网络或者是你从事的职业报刊发表,要投哪个媒体首先要研究哪个媒体,看它需要什么内容、什么体裁、什么格式的稿件,“对症下药”,这样会更轻松一些、方便一些,命中率会更高一些。如果你能够告诉我你的具体情况(干什么工作,哪里的,写的小说的大致内容等),我可以给你一些建议。我1993年开始在部队时开始发表各类文章,包括:报告文学、新闻、诗歌、散文、小说、评论等体裁的,到目前,先后在《人民日报》《法制日报》《农民日报》《中国文化报》《法制文萃》《半月谈》《解放军报》《中国国防报》《中国绿色时报》《中国日报》《中国教育报》《人民公安报》《中国交通报》《中国安全生产报》《中国转业军官》《中国人事》《道路交通管理》等报刊发表的大约5000篇左右吧,有40多篇获奖。另外:投稿时,第一要有信心,第二要投对报刊媒体,这两点非常重要。祝你成功!

plos genetics 审稿给审稿人多久

时间都不一样的。标准时间时一个星期左右但因为各种原因有快有慢。plos genetics中外审一般会有3-4位审稿专家,需要所有外审专家对文章达成一致意见才算是通过了外审,如果意见不统一,杂志社会另找其他外审专家来审稿,直至意见统一,所以遇到意见不统一的情况审稿时间无疑被拉长了,这些情况我们都要考虑到。

frontiersingenetics校稿后多久正式发表

平均需要90天。Frontiers in Genetics 官网表明从提交到接受平均需要90天,通过对近期已发表文章审稿速度的抽样统计,大部分文章的审稿周期都是在3个月左右便可接受,相对符合官网给出的周期,快的竟然有3天便可接收的,慢的也仅需要4个多月的,审稿差异有点大,不过整体算是比较快的了。

advancedgenetics影响因子

您好,您是想问advancedgenetics影响因子是什么吗?advancedgenetics影响因子是一部期刊。《AdvancesinGenetics》影响因子是AcademicPressInc.出版的期刊,刊期为Irregular,刊载方向为生物-遗传学。据2021年2月LetPub显示,《AdvancesinGenetics》h-index为62,CiteScore为9.50,SJR为1.293,SNIP为1.611,在Genetics类期刊(324种)中排第34名。

从香豌豆中发现性状连锁,并创造"genetics"一字的学者是谁

摩尔根

请教PLOS Genetics 投稿经验

第一次投plos one,遇到两个问题,急需各位有经验者给予帮助,1、通讯作者问题.用自己的登陆plos one投稿系统,填写作者的时候要选一个通讯作者,投稿说明中提到“选择一个通讯作者是用来接受,不一定是文章的通讯作者”,这一步我可以选自己吗?因为没有老板邮箱密码,接受不方便.大家都是怎么选的?2、表格问题.表格原本是用三线表的,plos one投稿要求中的表格用虚线表示的,还说不要边框不要线条不要底纹,那表格是“裸”的吗?到底应该用哪种形势?请各位有经验的朋友给予知道,各位师兄师姐:

plos genetics是几区

是1区,Q1区。《PLoS Genetics》发布于爱科学网,并永久归类相关SCI期刊导航类别中,本站只是硬性分析 "《PLOS GENET》" 杂志的可信度。学术期刊真正的价值在于它是否能为科技进步及社会发展带来积极促进作用。"《PLOS GENET》" 的价值还取决于各种因素的综合分析。PLOS Genetics由国际编辑委员会负责,由总编辑Greg Barsh (HudsonAlpha生物技术研究所,和斯坦福大学医学院) 和Greg Copenhaver (北卡罗来纳大学教堂山分校)。PLOS Genetics上发表的文章在PubMed Central存档,并在PubMed中引用。SCI:查询中文期刊的影响因子,可使用中国学术期刊(光盘版)电子杂志社和中国科学文献计量评价中心联合推出的《中国学术期刊综合引证报告》(万锦堃主编,科学出版社)。SCI的影响因子一般于每年的6月份公布,由汤森路透统计发布,此为最准确的官方版本,其他网站均以此为版本,只作为参考意义,并非100%准确。PubMed中文网旗下的SCI期刊数据库也可以查询期刊近十年的影响因子及变化曲线,期刊覆盖领域。

PLOS Genetics:子宫内膜异位症的遗传学机制

经痛很正常,错错错! 她治疗「子宫内膜异位症」解脱轻忽经血过多 柜姐血崩昏倒险丧命!剖腹产伤口长瘤 竟是子宫内膜异位症 *** 心悸、失眠、暴躁易怒? 当心自律神经失控的5警讯 近期,一项由美国国立卫生研究院(National Institutes of Health)资助并且发表于期刊《PLOS GENETICS》的研究指出,未患子宫内膜异位症的女性与患有子宫内膜异位症的女性的子宫DNA具有不同的化学修饰。这些变化涉及可以改变基因活性的DNA甲基化。甲基化的DNA区域根据子宫内膜异位的阶段或严重程度而不同,并且对参与月经周期的激素有不同的反应。子宫对激素的反应会影响怀孕和子宫组织的其他功能。 甲基化模式的差异,未来有望应用于诊断子宫内膜异位症 类固醇激素调节包括子宫内膜在内的特定组织中的基因。如果子宫内膜的激素反应异常,则可能导致不孕和不良妊娠结果。研究人员研究了来自正常女性和子宫内膜异位症患者细胞,对雌激素(E2),黄体酮(P4)以及子宫内膜间质成纤维细胞(eSF)的组合的反应。激素调节的全基因组DNA甲基化以及每种激素和正常疾病中的基因表达模式和特征是不同的,晚期疾病的反应最迟钝。出乎意料的是,发现了患有子宫内膜异位症的妇女在eSF中有观察到预先存在的异常DNA甲基化标记,并揭示出不同的疾病亚型。 国家儿童健康与人类发展研究所(National Institute of Child Health and Human Development, NICHD)生育与不育分会的Stuart B. Moss博士说:「这一发现增加了DNA甲基化模式的差异,也许未来有一天可以被应用于诊断子宫内膜异位症和制定针对患者的定制治疗方案。」 何谓子宫内膜异位症 子宫内膜异位症是指一种与子宫内膜相似的组织在体内其他部位(例如卵巢、输卵管或肠和膀胱)生长的疾病,是一种雌激素依赖型的发炎性疾病。简单的说,就是「原该长在子宫腔内的子宫内膜组织,跑到子宫腔以外的地方生长,并随着每个月经血来潮,在不正常生长的地方引发一连串的慢性发炎反应」。最常发生子宫内膜异位的部位是卵巢、骨盆腔等接近子宫的地方。 据统计,子宫内膜异位症的人口约占全女性人口的10﹪,亦即全台湾应有20万的女性因子宫内膜异位症而受苦,其中的五分之一会产生明显且严重的症状:经痛、不孕、与卵巢囊肿。子宫内膜异位症分为四个阶段,范围从最小(I期)到严重(IV期)。唯一可诊断子宫内膜异位症的方法是采用称为腹腔镜的手术方法。 子宫内膜异位症的症状有经痛、骨盆疼痛、 *** 疼痛、不孕、及滤泡期头三天的基础体温增高等。就疼痛来说,轻度的子宫内膜异位症患者中,70% 有经痛,25%有慢性骨盆腔疼痛或深入性的 *** 疼痛。其他的症状与病灶发生的部位有关,如影响膀胱可造成频尿或经期之血尿、若影响直肠则可能有便意感或经期之便血等。临床上的出血或疼痛,若与经期有关都要怀疑罹患子宫内膜异位症的可能。 激素与甲基化的相互作用影响子宫内膜异位症的发展 研究人员分析了子宫内膜间质成纤维细胞(endometrial stromal fibroblasts, eSFs),该细胞可调节子宫内膜中的细胞活性。研究人员比较了没有子宫内膜异位症或任何其他妇科疾病的女性、患有I期子宫内膜异位症的女性和患有IV期子宫内膜异位症的女性的DNA区域之间的甲基化以及细胞中基因功能的差异。他们以细胞单独暴露于雌二醇E2(雌激素的一种形式)、单独暴露于黄体酮P4和暴露于两种激素的组合来模拟月经周期中这些激素含量的变化,然后观察其甲基化的模式和基因功能。 在三种情况下(暴露于激素之前、暴露于每种单独的激素、以及同时暴露于两者的组合),所有细胞组中的DNA甲基化模式和基因功能都不同。Giudice博士补充说明,I期和IV期子宫内膜细胞之间甲基化和基因功能的差异可能意味着两者可能是子宫内膜异位症的不同亚型,而不是状况的不同程度。 这项研究的主要作者、加州大学旧金山分校的Sahar Houshdaran博士说:「研究数据显示激素和DNA甲基化的正确相互作用对于维持正常的子宫功能至关重要。且我们已经看到这些相互作用的变化可能导致子宫内膜异位症伴随着不孕症。」

化学基因学(chemical genetics)的定义

化学基因组学是一种用来开发靶位结构相似的药物的研究学科,它是一种非线性平行技术,可以在测定药物靶位功能的同时,对相对应的小分子先导药物进行识别。

Plos Genetics:揭示新烟碱类和多杀菌素类等重要杀虫剂的分子靶标

烟碱型乙酰胆碱受体(Nicotinic acetylcholine receptors, nAChRs)是一种主要表达于昆虫中枢神经系统的五聚体配体门控阳离子通道,也是新烟碱类(neonicotinoids)和多杀菌素类(spinosyns)等重要杀虫剂的靶标。但是近年来,害虫抗性和对蜜蜂的毒性问题限制了其发展并促使了砜亚胺类(sulfoximines),丁烯羟酸内酯类(butenolides)和介离子类(mesoionics)等新一代杀虫剂的研发。但是,这些作用于nAChR的杀虫剂在昆虫体内的分子靶标目前尚不清楚;昆虫nAChR有几种亚型(subtype)以及这些亚型分别又由哪些亚基(subunit)组成也不明确。1月19日,生物学知名期刊Plos Genetics在线发表了浙江大学昆虫所黄佳教授团队题为“Nicotinic acetylcholine receptor modulator insecticides act on perse receptor subtypes with distinct subunit compositions”的研究论文,从而解决了这一长期悬而未决的难题。 自第一个新烟碱类杀虫剂吡虫啉1991年正式上市以来,由于其能高效地防治害虫、并对鸟类和哺乳动物低毒,到2018年这类杀虫剂的全球市场份额占有率已高达24%。新烟碱类杀虫剂经过研究人员不断进行结构优化,仍保持着强大的生命力。近年来,市场上又出现了如氟啶虫胺腈,氟吡呋喃酮和三氟苯嘧啶等同样作用于nAChR且结构新颖的杀虫剂。在昆虫体内,nAChR仅存在于中枢神经系统中,不同的亚基组成决定了受体功能和药理学的多样性。由于脊椎动物的nAChR能够在异源系统中表达,目前已经基本弄清楚其不同受体亚型的亚基组合方式。但长期以来昆虫的nAChR无法在体外实现功能性表达,这极大地阻碍了对杀虫剂分子靶标的研究。一直到2020年,才分别有日本和挪威的科学家发现在体外表达时加入3种辅助因子能够在非洲爪蟾卵母细胞中表达功能性的nAChR。 本论文系统地测定了10种果蝇nAChR亚基突变体对11种nAChR调节型杀虫剂的敏感性,同时结合了热遗传学和行为学的实验。结果表明昆虫体内至少存在5种以上的受体亚型,分别由不同的亚基构成,是不同类型杀虫剂的主要分子靶标。该发现为害虫的抗性管理和基于靶标的杀虫剂分子设计和开发提供了理论基础,也为深入研究这些nAChR调节型杀虫剂的生态毒理学和风险评估提供了依据。

Forward Genetics and Reverse Genetics是什么?

正向遗传学 forward genetics反向遗传学reverse genetics 正向遗传学是指,通过生物个体或细胞的基因组的自发突变或人工诱变,寻找相关的表型或性状改变,然后从这些特定性状变化的个体或细胞中找到对应的突变基因,并揭示其功能。例如遗传病基因的克隆。反向遗传学的原理正好相反,人们首先是改变某个特定的基因或蛋白质,然后再去寻找有关的表型变化。例如基因剔除技术或转基因研究。简单地说,正向遗传学是从表型变化研究基因变化,反向遗传学则是从基因变化研究表型变化。

professor of medical genetics at uc san diego是什么成分

  这是一个名词短语,中心词是professor,可以作主语宾语表语等  满意请采纳,谢谢

基因组文章 | 黑麦《Nature Genetics》 2021

黑麦( Secale cereale , 2n = 2x = 14, RR)属于禾本科小麦族黑麦属,虽然与普通小麦( Triticum aestivum ,Ta;2n=6x=42;AABBDD)和大麦( Hordeum vulgare ,Hv)有亲缘关系, 但黑麦具有独特的农艺性状和基因组特性。黑麦1RS染色体臂携带的抗病基因通过远缘杂交转入小麦基因组,为小麦生产中白粉病和条锈病的防治做出了巨大贡献。此外,黑麦也可以与普通小麦远缘杂交,染色体加倍后,人工合成八倍体小黑麦,具有比黑麦更高的生物量和产量。因此,黑麦是许多国家重要的粮食和饲料作物,也是全球小麦和小黑麦改良的重要遗传资源。 威宁黑麦是我国的 栽培黑麦早抽穗优良品种,具有抗白粉病和条锈病的能力 。为了解析黑麦优良性状的遗传和分子基础,促进黑麦及相关作物的基因组和育种研究,作者对威宁黑麦进行了基因组测序和分析。 基因组: 基因注释转录组测序: 正常或胁迫(冷或干旱)条件下栽培的植物中的叶、茎、根和穗样品,以及在开花10、20、30、40天后收获的发育中的样品, 采用Illumina及Pacbio平台进行RNA-seq及Iso-Seq; 遗传图谱QTL : 295份威宁黑麦×荆州黑麦杂交的F2代样品,采用SLAF-seq进行标记开发; 抽穗基因表达 : 威宁黑麦和荆州黑麦样品,播种后4、7和10天采集叶片样品,每个时间点使用3个生物重复,使用Illumina平台进行测序; 选择进化分析 : 已发表的101份家养黑麦和野生黑麦品种材料的公共数据,包括81份 S. cereala 、5份 S. vavilovii 、11份 S. strictum 和4份 S. sylvestre 。 流式预估黑麦基因组大小约为7.86 Gb,结合PacBio、Illumina、Hi-C、遗传图谱、BioNano光学图谱等技术进行基因组组装。最终组装 7.74 Gb 基因组(为预估基因组大小的98.47%),scaffold N50 为1.04 Gb,并将93.67%的序列挂载至 7条 染色体上(图1)。黑麦中每条染色体基因组大小均在 1G左右 (2R、3R、4R、6R、7R(~1Gb);1R(0.94097 Gb)、5R(0.99891 Gb) ),比乌拉尔图小麦( T. urartu ;Tu;AA型)、节节麦( Aegilops tauschii ;Aet;DD型)、野生二粒小麦( T. turgidum ssp. dicoccoides ;WEW;AABB型)、普通小麦(Ta)和大麦(Hv)等复杂的麦类中的 单条染色体基因组均要大 。超大的基因组及染色体,对黑麦基因组组装,特别是染色体挂载带来了巨大的挑战。 将组装结果与两个冬季黑麦品种(Lo7和Lo225)构建的染色体连锁图相比,威宁黑麦1R至7R物理图具有较高的一致性。在先前报道的Lo7的pyro-sequencing reads中97.45%可以定位到威宁基因组,平均序列同源性为97.71%,平均序列覆盖率为97.27%。 LAI值为 18.42 ,远高于先前发表的小麦和大麦基因组的LAI值。BUSCO评估结果为 96.74% 。并注释了 86,991 个蛋白编码基因。尽管黑麦基因组非常复杂,通过以上评估结果说明,本次研究构建了一个高质量的威宁黑麦基因组。 威宁黑麦基因组中 90.31% 被注释为转座子(TE),共包含537个家族的2,671,941个成员,这些TE的含量明显比普通小麦 (84.70%), 乌拉尔图小麦 (81.42%), 节节麦 (84.40%), 野生二粒小麦 (82.20%)以及大麦 (80.80%)更高。其中长末端重复反转录转座子( LTR-RTs )是主要的转座子,在注释的TEs中占 84.49% 。 与乌拉尔图小麦、节节麦及大麦的LTR-RTs进行比较发现 : (1) Gypsy 是威宁黑麦基因组扩张的主要原因之一(Fig. 2a),并且有3个LTR-RT家族( Daniela , Sumaya , Sumana )在威宁黑麦中特异扩张,其中 Daniela 的占比最高 (Fig. 2b)。 (2)威宁黑麦中完整的LTR-RTs插入时间存在独特的 双峰 分布(Fig. 2c),最近一个扩增峰出现在50万年前,另一个出现在1.7 百万年(MYA)左右(与大麦相同) (Fig. 2c)。 (3)这种双峰分布模式由 Gypsy RTs 的扩增主导 (Fig. 2d)。 通过比较威宁黑麦、乌拉尔图小麦、节节麦、普通小麦(亚基因组TaA、TaB和TaD)、大麦、水稻Os( Oryza sativa ssp. japonica)、二穗短柄草Bd( Brachypodium distachyon )、玉米Zm( Zea mays )、高粱Sb( Sorghum bicolor )、谷子Si( Setaria italica )基因组,共找到2517个单拷贝同源基因。 通过对单拷贝基因组构建进化树和计算分化时间发现,在大麦和小麦分化后(15MYA)黑麦和二倍体小麦发生了分化(9.6 MYA) (Fig. 3a)。 作者以水稻为祖先参考基因组,研究了威宁黑麦的染色体进化 。威宁黑麦与水稻共鉴定出23个大的共线性区,包含10949对同源基因,可推断出祖先染色体片段在1R到7R之间的排列(图3b): (1)3R来源于一条古老的染色体AGK1/Os1,该染色体的一段易位到6RL; (2)1R和2R分别由两条祖先染色体组成,1R与AGK10/Os10嵌套插入AGK5/Os5有关,2R与AGK7/Os7嵌套插入AGK4/Os4有关; (3)4R, 5R, 6R,7R是通过复杂易位从至少三条祖先染色体上获得的(图3b)。 在威宁黑麦基因组与普通小麦3个亚基因组的比较中,1R、2R和3R分别与小麦1、2和3组染色体完全共线。在4R中发现与4A/4B/4D、7A/7B/7D或6A/6B/6D部分共线性的三个区域。5R与5A完全共线,与5B、5D部分共线是由于易位的4B或4D片段在5BL或5DL的长臂融合(图3c)。在6R中,观察到3个区域与6A/6B/6D、3A/3B/3D或7A/7B/7D部分共线。这些数据将有助于黑麦在禾本科比较基因组学研究以及黑麦与普通小麦杂交研究中的应用。 作者在威宁黑麦中检测到4217个单拷贝基因、23753个 分散重复基因 (DDGs) 、6659个 近端重复基因 (PDGs) 、7077个 串联重复基因(TDGs) 和1866个 片段重复基因 。转座重复基因(TrDGs)由TE活性诱导的,它们是DDGs的主要组成部分。作者以大麦为参考,在威宁黑麦中鉴定出10357个TrDG,远远大于以相同方式计算的乌拉尔图小麦(7145)和节节麦(7351)中TrDG的数量(图4b)。威宁黑麦所特有的TrDG(5926)也比乌拉尔图小麦(3513)和节节麦(3327)所特有的TrDG更多(图4b)。 接下来作者研究了黑麦淀粉生物合成相关基因(SBRGs)中的基因复制。研究发现 这些重复类型在黑麦淀粉生物合成相关基因(SBRGs)中普遍存在,并且不同的 SBRG 的复制基因之间往往表现出表达差异,说明不同类型的基因复制可以丰富黑麦基因在重要生物过程中的遗传多样性 (图4c),这些黑麦 SBRGs 的新变化可能为调控植物淀粉生物合成和性质提供新的酶活性,因此解析全套黑麦 SBRGs 有利于提高黑麦的产量潜力和营养品质。 与小麦和大麦相似,黑麦在胚乳组织中积累了丰富的储存蛋白SSPs。作者利用威宁基因组组装技术对黑麦SSP基因座进行了分析。 在威宁黑麦中未发现小麦低分子量麦谷蛋白亚基(LMW-GSs)或大麦B-hordein的同源序列(图5b), 表明在黑麦进化过程中携带这些基因的染色体片段缺失 ,这可能是1BL1RS易位系小麦品种中,品质受影响的主要原因。 并且在威宁黑麦基因组中未发现α-醇溶蛋白基因, 这说明小麦及其近缘种的α-醇溶蛋白(α-gliadin)基因可能在小麦和黑麦分化之后进化产生的。 这些SSP分析结果阐明了黑麦碱基因座的结构和组成,这将有助于进一步研究黑麦、小黑麦和小麦的加工和营养品质。 作者利用iTAK预测了威宁黑麦和其他8种禾本科植物的TF基因 ,在注释的65个转录因子基因家族中,威宁黑麦有28个家族成员增加,其中AP2/ERF TF基因家族成员增加幅度较大。威宁黑麦的 抗病相关基因(DRA )数量(1989)比乌拉尔图小麦(1621)、节节麦(1758)、大麦(1508)、二穗短柄草(1178)、水稻(1575)以及普通小麦的A(1836)、B(1728)和D(1888)亚基因组多。 鉴于AP2/ERF TFs和DRA基因在植物对非生物逆境和生物逆境的反应中的重要作用,上述发现可能有助于黑麦和相关作物的有效遗传研究和分子改良。 在长日照条件下,威宁黑麦比荆州黑麦提前抽穗10-12天(图6a),这与威宁黑麦茎尖分生组织发育更快有关(图6b)。在威宁黑麦基因组中,注释到在长日照条件下高表达的两个开花位点(FT)基因 ScFT1 (ScWN4R01G446100)和 ScFT2 (ScWN3R01G192500)。播种后7天和10天, ScFT1 和 ScFT2 在威宁黑麦中的表达水平显著高于荆州黑麦(图6c),且ScFT蛋白在黑麦中积累到相对较高水平,而荆州黑麦中几乎没有(图6d)。检测到的ScFT蛋白的大小(~29 kDa)比预测出的ScFT1和ScFT2的分子量大(~19 kDa)(图6d),表明ScFT蛋白具有潜在的翻译后修饰。用高效检测磷蛋白的磷酸标记SDS-PAGE分析表明,威宁黑麦中ScFT确实发生了翻译后磷酸化修饰。 作者突变了ScFT2磷酸化相关的两个残基(S76和T132),并为ScFT2构建了一系列去磷模拟位点(S76A、T132A和S76A/T132A)和磷模拟位点(S76D、T132D和S76D/T132D)。当使用马铃薯X病毒载体在烟草中进行外源表达时,ScFT2和去磷双突变体ScFT2 S76A/T132A 相对于游离GFP(对照)和其他ScFT2突变体,表现出持续促进烟草生长(图6e)。与GFP相比,ScFT2和三个去磷突变体(ScFT2 S76A 、ScFT2 T132A 及ScFT2 S76A/T132A )的异位表达提高了开花植株的百分比,ScFT2 S76A/T132A 尤其明显,但在表达三个拟磷突变体(ScFT2 S76D , ScFT2 T132D , or ScFT2 S76D/T132D )中没有观察到这种促进作用(图6f)。免疫印迹分析表明,ScFT2、ScFT2 S76A 、ScFT2 T132A 和ScFT2 S76A/T132A 在烟草植株中的积累量相当高,但ScFT2 S76D 、ScFT2 T132D 和ScFT2 S76D/T132D 在烟草植株中的积累量却很低(图6g)。因此,保守的S76和T132残基的改变影响了ScFT2控制植物开花的功能,这与ScFT2蛋白稳定性的改变有关。本研究首次发现FT磷酸化对开花时间控制的影响,为更全面地探索FT蛋白控制植物开花的分子和生化机制提供了新的途径。 作者进一步研究了光周期 Photoperiod ( Ppd )基因的表达,该基因在长日照条件下正调控FT的表达。在威宁和荆州黑麦的转录组分析中发现了一个表达 Ppd 的基因 ScPpd1 (ScWN2R01G043000)。该基因在威宁黑麦内的表达非常早,在播种2 天后达到表达高峰;而荆州黑麦在播种4天后才达到高峰(图6h)。根据 ScPpd1 对黑麦抽穗期的调控作用,研究者利用威宁×荆州F2代群体,检测到与前期研究一致的三个主效抽穗期QTL( Hd2R、Hd5R 和 Hd6R )。 对驯化基因的分析可以促进对作物性状的理解和改良,但在黑麦中这类基因的分子分析方面进展甚微。作者通过全基因组选择清除分析,利用在栽培黑麦和瓦维洛夫黑麦( S. vavilovii )之间鉴定的123647个SNPs,挖掘黑麦驯化相关染色体区域和基因座。DRI、 F ST 、XP-CLR分析中,共同识别到11个选择信号(图7a-c)。通过与水稻和大麦的共线性比较,发现了一些可能的选择清除位点,包括已在水稻或大麦中已被功能分析的 ScBC1 、 ScBtr 、 ScGW2 、 ScMOC1 、 ScID1 和 ScWx 的同源基因(图7a-c)。 检测到的 ScID1 基因座包含一对具有相同编码序列的 ScID1 同源序列(ScWN6R01G057200和ScWN6R01G057300,下称 ScID1.1 和 ScID1.2 )(图7d)。ScID1.1和ScID1.2蛋白与玉米ID1(63.19%)和水稻RID1(65.34%)具有很强的同源性,这两个蛋白在玉米和水稻中都被发现调控着从营养体向花发育的转换。 ScID1.1 和 ScID1.2 在威宁黑麦幼叶中的表达水平高于荆州黑麦(图7e)。在威宁×荆州分离的F2群体中, ScID1 JZ/JZ 纯合植株的平均抽穗期显著晚于 ScID1 JZ/WN 或 ScID1 WN/WN 个体(图7f),这与荆州黑麦相对于威宁黑麦的晚花表型相一致(图6a)。以上结果表明 ScID1 可能参与了抽穗期的调控,并可能通过黑麦驯化进行选择,使作物成熟度得到适当的调整,以更好地适应生长环境。 总结 本研究对我国栽培的优良品种威宁黑麦进行了基因组测序,基因组组装大小为7.74 Gb,其中93.67%被挂载到7条染色体上,重复序列占总基因组的90.31%。并基于高质量基因组揭示了全基因组基因复制及其对淀粉生物合成基因的影响,解析了复杂储存蛋白基因座位点、早抽穗性状的基因表达特征以及黑麦中与驯化相关的染色体区域和基因座。本次研究结果对黑麦的基因组特性及其农艺性状调控基因有了新的认识,获得了对进一步研究黑麦驯化遗传基础可能有用的染色体区域和基因座。威宁黑麦基因组组装对于破解黑麦基因组生物学,深化比较谷类基因组学研究,加速黑麦及相关谷类作物的遗传改良具有重要价值。 A high-quality genome assembly highlights rye genomic characteristics and agronomically important genes https://mp.weixin.qq.com/s/xl2NsMrbn59nrbfSdD-kCg