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如何分离出MKV文件中的字幕和视频?

2023-07-30 09:26:55
TAG: kv mk 文件
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FinCloud
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http://tieba.b***.com/f?kz=158589640 这帖子内容先仔细阅读
进入DOS提示符方法为:开始-运行-输入CMD后回车

提取字幕方法举例: 1.MKV文件在D盘MOVIES目录下MKVTOOLNIX文件夹中,字幕ID为3(双音轨则为4)
DOS操作顺序就是
d: 回车
cd d:moviesmkvtoolnix 回车
mkvextract tracks 1.mkv 3:1.ass 回车

这样提取出来的就是名为1的ASS格式字幕文件。。然后任意你修改内容啊字体啊字号啊颜色什么的,但是要注意别把时间轴和标注改掉了。。。

然后用我给你的帖子里的软件把ASS字幕文件和原片压回到一起,或者就直接不压挂在外面~~~

同理,也可以单独提取音轨和画面~~

http://zhidao.b***.com/question/87839154.html 这个是同类问题

如果你是不想要字幕,KMP和MPC可以选择关闭字幕,不用专程把字幕文件分离

------------------------------------------------------
一样的道理
画面ID为1 音轨ID为2 则命令变更为(同上例)
d: 回车
cd d:moviesmkvtoolnix 回车
mkvextract tracks 1.mkv 1:1.rmvb 回车
mkvextract tracks 1.mkv 2:1.mp3 回车
------------------------------------------------------
如果你只是不想要字幕的话,可以选择关闭
也可以打开mkvmerge GUI,把MKV文件拖到窗口空白处,把第三个勾取消掉,(也就是留下标注有video和audio的两项)然后按Start muxing
苏州马小云

mkvtoolnix

用这个,百度搜索很多的。下载后,运行他,打开 mkv 文件,会列出其中的音频,视频,如果内嵌字幕,将其取消,然后选择一个输出文件夹,开始“合并”。

mkvtoolnix

安装文件夹内的 MKVextractGUI.exe 是用来专门单独分离 MKV 中的视频,音频以及内嵌字幕。而 MMG.exe 打开 MKV 后,也可选择你需要的内容,视频,音频以及内嵌字幕的其中一个或几个,重新合并到新的 MKV 文件。

下载个汉化版,一看就明白,自己用用就知道。

wpBeta

MKVextractGUI现在好像比较好用 百度一下

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二、sort流程 Deepsort的前身是sort算法,sort算法的核心是卡尔曼滤波算法和匈牙利算法。 卡尔曼滤波算法作用:该算法的主要作用就是当前的一系列运动变量去预测下一时刻的运动变量,但是第一次的检测结果用来初始化卡尔曼滤波的运动变量。 匈牙利算法的作用:简单来讲就是解决分配问题,就是把一群检测框和卡尔曼预测的框做分配,让卡尔曼预测的框找到和自己最匹配的检测框,达到追踪的效果。 sort工作流程如下图所示: Detections是通过目标检测到的框框。Tracks是轨迹信息。 整个算法的工作流程如下: (1)将第一帧检测到的结果创建其对应的Tracks。将卡尔曼滤波的运动变量初始化,通过卡尔曼滤波预测其对应的框框。 (2)将该帧目标检测的框框和上一帧通过Tracks预测的框框一一进行IOU匹配,再通过IOU匹配的结果计算其代价矩阵(cost matrix,其计算方式是1-IOU)。 (3)将(2)中得到的所有的代价矩阵作为匈牙利算法的输入,得到线性的匹配的结果,这时候我们得到的结果有三种,第一种是Tracks失配(Unmatched Tracks),我们直接将失配的Tracks删除;第二种是Detections失配(Unmatched Detections),我们将这样的Detections初始化为一个新的Tracks(new Tracks);第三种是检测框和预测的框框配对成功,这说明我们前一帧和后一帧追踪成功,将其对应的Detections通过卡尔曼滤波更新其对应的Tracks变量。 (4)反复循环(2)-(3)步骤,直到视频帧结束。 三、Deepsort算法流程 由于sort算法还是比较粗糙的追踪算法,当物体发生遮挡的时候,特别容易丢失自己的ID。而Deepsort算法在sort算法的基础上增加了级联匹配(Matching Cascade)和新轨迹的确认(confirmed)。Tracks分为确认态(confirmed),和不确认态(unconfirmed),新产生的Tracks是不确认态的;不确认态的Tracks必须要和Detections连续匹配一定的次数(默认是3)才可以转化成确认态。确认态的Tracks必须和Detections连续失配一定次数(默认30次),才会被删除。 Deepsort算法的工作流程如下图所示: 整个算法的工作流程如下: (1)将第一帧次检测到的结果创建其对应的Tracks。将卡尔曼滤波的运动变量初始化,通过卡尔曼滤波预测其对应的框框。这时候的Tracks一定是unconfirmed的。 (2)将该帧目标检测的框框和第上一帧通过Tracks预测的框框一一进行IOU匹配,再通过IOU匹配的结果计算其代价矩阵(cost matrix,其计算方式是1-IOU)。 (3)将(2)中得到的所有的代价矩阵作为匈牙利算法的输入,得到线性的匹配的结果,这时候我们得到的结果有三种,第一种是Tracks失配(Unmatched Tracks),我们直接将失配的Tracks(因为这个Tracks是不确定态了,如果是确定态的话则要连续达到一定的次数(默认30次)才可以删除)删除;第二种是Detections失配(Unmatched Detections),我们将这样的Detections初始化为一个新的Tracks(new Tracks);第三种是检测框和预测的框框配对成功,这说明我们前一帧和后一帧追踪成功,将其对应的Detections通过卡尔曼滤波更新其对应的Tracks变量。 (4)反复循环(2)-(3)步骤,直到出现确认态(confirmed)的Tracks或者视频帧结束。 (5)通过卡尔曼滤波预测其确认态的Tracks和不确认态的Tracks对应的框框。将确认态的Tracks的框框和是Detections进行级联匹配(之前每次只要Tracks匹配上都会保存Detections其的外观特征和运动信息,默认保存前100帧,利用外观特征和运动信息和Detections进行级联匹配,这么做是因为确认态(confirmed)的Tracks和Detections匹配的可能性更大)。 (6)进行级联匹配后有三种可能的结果。第一种,Tracks匹配,这样的Tracks通过卡尔曼滤波更新其对应的Tracks变量。第二第三种是Detections和Tracks失配,这时将之前的不确认状态的Tracks和失配的Tracks一起和Unmatched Detections一一进行IOU匹配,再通过IOU匹配的结果计算其代价矩阵(cost matrix,其计算方式是1-IOU)。 (7)将(6)中得到的所有的代价矩阵作为匈牙利算法的输入,得到线性的匹配的结果,这时候我们得到的结果有三种,第一种是Tracks失配(Unmatched Tracks),我们直接将失配的Tracks(因为这个Tracks是不确定态了,如果是确定态的话则要连续达到一定的次数(默认30次)才可以删除)删除;第二种是Detections失配(Unmatched Detections),我们将这样的Detections初始化为一个新的Tracks(new Tracks);第三种是检测框和预测的框框配对成功,这说明我们前一帧和后一帧追踪成功,将其对应的Detections通过卡尔曼滤波更新其对应的Tracks变量。 (8)反复循环(5)-(7)步骤,直到视频帧结束。
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Love Me Tender 06. 听雨 07. 乘着爱自由的飞 08. The Water is Wide 09. 别这样我会哭 10. Last Night 11. 不愿说再见(Don"t wanna say good-bye) 1997年 白纸White Paper(福茂) TRACKS 01. 在每一秒里都想见到你 02. 不要开灯 03. 爱在思念蔓延时 04. 认真 05. 放逐思念 06. 白纸 07. 给我你的手 08. Dream Again 09. 想家 10. 四月还会下雪 1998年 我用生命爱你I Want to Spend My Life Time Loving You(新力)TRACKS 01. 我用生命爱你 1998年 公转自转 Revolution(新力) TRACKS 01. 公转自转 02. 梦想被冷冻 03. 爱你等于爱自己 04. One of these days 05. 我的情歌 06. 信任 07. 不管怎样 08. 2000年 09. 你以为我是谁 10. Please come back to me 2000年 永远的第一天 Forever"s First Day(新力) TRACKS 01. Introduction (序曲) 02. 永远的第一天 03. 爱在思念蔓延时 04. 龙的传人 05. 不要害怕 06. 狂想世界 07. 伤口是爱的笔记 08. 欢喜城 09. 忘了时间忘了我 10. 这就是爱 11. 你可以告诉我(你还爱谁) 2001年 王力宏创世纪影音全纪录 LeeHom Music Century(新力) TRACKS 01. Take Your Time 02. 爱我的歌 03. 每天爱你廿四小时(粤语) 04. 每天爱你廿四小时 05. Take Your Time 06. 公转自转 07. 爱你等于爱自己 08. 信任 09. 不可能错过你 10. 流泪手心 11. Julia 12. 永远的第一天 13. 龙的传人 14. 不要害怕 2001年 唯一 The One and Only(新力) TRACKS 01. 唯一 02. 爱的就是你 03. 谢绝推销你的爱 04. 安全感 05. 戒不了你 06. 不必问别人 07. 白狐狸 08. 变坏 09. If You Knew 10. 我要 11. 爱的就是你 (浪漫版 2002年 95-02 新歌+精选《王力宏的音乐进化论>95-02Evolution(新力) TRACKS DISK A A01. W-H-Y A02. Julia A03. 公转自转 A04. 唯一 A05. 不要害怕 A06. 不可能错过你 A07. 爱你等于爱自己 A08. 如果你听见我的歌 A09. Take Your Time A10. 爱的就是你 A11. Light Of My Life A12. 我用生命爱你 A13. LAST NIGHT DISK B B01. 两个人不等于我们 B02. 每一秒里都想见到你 B03. 流泪手心 B04. 白纸 B05. 永远的第一天 B06. 情敌贝多芬 B07. 好想你 B08. 雪人 B09. NATURE B10. China White B11. Happiness×3 Loneliness×3 B12. Like A Gunshot B13. 龙的传人 2003年 唯一(单曲) Last Night(新力) TRACKS 01. 唯一(中文版) 02. Last Night 03. 唯一(日文版) 2003年 唯一(专辑) The Only One(新力) TRACKS 01. 唯一 02. Last Night 03. Like A Gunshot 04. 流泪手心 05. Light Of My Life 06. China White 07. 不要害怕 08. 爱的就是你 09. Mary Says 10. Julia 11. 公转自转 12. 爱你等于爱自己 13. 不可能错过你 14. As Long As I Love You 15. 唯一(日文版) 2003年 爱的奇迹 miracle of love(新力) TRACKS 01. 爱的奇迹 征集歌词 02. 流泪手心(Japanese Version) 03. 二个人不等于我们(中文版) 2004年 不可思议 Unbelievable(新力) TRACKS 01. Ya Birthday 02. 你不在 03. Love Love Love 04. 女朋友 05. 此刻你心里想起谁 06. 不可思议电台 07. 你和我 08. 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2023-07-30 06:26:363

---Look at these tracks. It _____ be a wolf.” ---Don’t be so sure. I think it _____ be a fox. .

A 考查情态动词。Must可表示肯定推测,意为“一定”;could“可能”,表示的可能性没有can大,但比may大。句意“看那些脚印。它一定是一匹狼。”“不要那么肯定。我认为是一只狐狸。”故选A。
2023-07-30 06:27:091

请问the other side of the tracks是什么意思?

另一方面
2023-07-30 06:27:172

我在西藏自驾旅游,求推荐一个APP,是能记录行驶过得路线,可以看到每天的行程公里记录和走过的轨迹!

六只脚,就可以!
2023-07-30 06:27:284

Camtasia Studio使用方法

Camtasia Studio:http://www.laixiaxia.com/tools/3315.html Camtasia Studio 中内置的录制工具 Camtasia Recorder 可以灵活的录制屏幕:录制全屏区域或自定义屏幕区域,支持声音和摄像头同步,录制后的视频可直接输出为常规视频文件或导入到 Camtasia Studio 中剪辑输出。  Camtasia Studio 具有强大的视频播放和视频编辑功能,可以说有强大的后期处理能力,可在录制屏幕后,基于时间轴对视频片段进行各类剪辑操作、如添加各类标注、媒体库、Zoom-n-Pan、画中画、字幕特效、转场效果、旁白、标题剪辑等,当然也可以导入现有视频进行编辑操作,包括 AVI、MP4、MPG、MPEG、WMV、MOV、SWF 等文件格式。
2023-07-30 06:27:573

Love Outrolude Bonus Tracks翻译是什么意思??

爱outrolude奖金轨道
2023-07-30 06:28:512

文献阅读笔记:CUT&Tag

题目: CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells 许多染色质特征在调控基因表达中起着重要作用。要完全理解基因调控,需要在小样本细胞中以高分辨率绘制特定染色质特征。在这里,我们描述了Cleavage Under Targets and Tagmentation (CUT&Tag),它是一种酶栓系(enzyme-tethering)策略,提供了高效的高分辨率测序文库来分析不同的染色质成分。在CUT&Tag中,染色质蛋白被一种特异性抗体原位结合,然后将蛋白A - Tn5转座酶融合蛋白栓在一起。转座子酶的激活有效地产生具有高分辨率和极低背景的片段文库。从活细胞到测序文库的所有步骤都可以在实验台上的单个管或高通量管道中的微孔中完成,并且整个过程可以在一天内完成。我们通过分析组蛋白修饰、RNA聚合酶II和转录因子在低细胞数量和单细胞上的应用,证明了CUT&Tag的用途。 大规模平行测序的出现和每个碱基成本的大幅降低推动了基因组学革命,然而,由于用于绘制染色质片段的方法存在局限性,表观基因组分析的前景一直滞后。染色质免疫沉淀测序技术(ChIP-seq)及其衍生方法具有信号低、背景高和交联导致的表位掩蔽等缺点,且需要大量的细胞。ChIP的替代方法包括对非固定细胞的酶拴系方法,如DamID7、ChEC-seq和CUT&RUN,将感兴趣的蛋白质定位在原位,然后进行全基因组分析。例如,CUT&RUN基于ChIC策略,通过连续结合特定抗体来map染色质蛋白,然后将Protein A/微球菌核酸酶(pA-MNase)融合蛋白固定在可渗透细胞(不交联)。通过添加钙激活MNase,将片段释放到上清液中,进行DNA提取、文库制备和paired-end测序。CUT&RUN提供了与ChIP-seq相比背景信号低得多的特定染色质组分的碱基对分辨率,大大降低了全基因组分析的成本。 虽然CUT&RUN只需要100-1000个细胞就可以产生高质量的数据,但它必须随后进行DNA末端修饰和adapters连接来准备测序文库,这增加了整个过程的时间、成本和工作量。此外,通过CUT&RUN方法将MNase切割后的片段释放到上清液中并不适合应用于单细胞平台。 (意思是CUT&RUN虽然很牛,但是做单细胞还是不行的) 在这里,我们克服了ChIP-seq和CUT&RUN的局限性,使用了由超活性Tn5转座酶-蛋白A (pA-Tn5)融合蛋白负载的测序adapters组成的转座体。在原位“栓系”后,激活pA-Tn5导致因子靶向标记,生成用于PCR富集和DNA测序的片段。从活细胞开始,CUT&Tag可以在一天内在实验台上或高通量方法中提供扩增的测序文库。我们证明,使用低细胞数甚至单个细胞,多种染色质成分可以在非常低的背景下被描绘出来。这种简单、低成本的方法将使表观遗传研究在生物研究的各个领域更加强大。 通过tagmentation实现染色质分析(图1a),我们用一种针对H3K27me3的抗体孵育完整的渗透的人类K562细胞,H3K27me3是一种丰富的组蛋白修饰,它标记沉默染色质区域。我们用抗兔的二抗孵育细胞,以增加染色质位点上的抗体结合局部浓度,然后用预载有测序adapters的过量pA-Tn5融合蛋白孵育细胞,在核里将酶系在抗体结合位点。转座体与暴露的DNA有内在的亲和性,因此我们在严格的条件下清洗细胞以去除未拴住的pA-Tn5。然后,我们通过添加Mg++激活转座体,整合含h3k27me3核小体spanning位点的adapters。最后,从纯化的DNA中富集片段文库,并将其汇集到Illumina HiSeq的flow cell上进行多重配paired-end测序。整个方案在一个管中操作所有步骤(图1b),其中渗透的细胞首先与抗体混合,然后固定在Concanavalin A包被的磁珠上,允许在所有连续的洗涤和试剂孵育步骤中对细胞进行处理。为了在实验之间进行标准化,我们使用来自于大肠杆菌转座子酶蛋白生产过程中提取的少量示踪基因组DNA来进行样本read counts的标准化,以代替CUT&RUN9中推荐的异体spike-in DNA。 在大约800万reads的人类基因组组装中,显示了H3K27me3标记的大染色质区域的清晰图谱(图2a)。我们还获得了H3K4me1和H3K4me2组蛋白修饰的图谱,标记了活跃的染色质位点。相比之下,用非特异性IgG抗体孵育细胞,产生非常稀疏的背景信号(图2a)。为了评估CUT&Tag的信噪比,我们将其与CUT&RUN和ChIP-seq生成的分析结果进行了比较,检测K562细胞中的H3K27me3(相同的兔单克隆抗体)。为了直接比较这三种技术,我们将每个数据集的读取深度设置为800万reads。三种方法的landscape都是相似的,但是在ChIP-seq数据集中背景噪声占主导地位(图2a),因此 ChIP-seq需要更多的reads来区分染色质特征和背景 。相比之下,CUT&RUN和CUT&Tag的背景噪声都非常低。正如预期的那样,在H1胚胎干细胞(H1 ES)不同的人类细胞类型中的同一染色质区域,观察到非常不同的profiles(图2b)。为了更定量地比较每种方法中的信号和噪声水平,我们为每种方法生成了H3K4me1修饰基因组位点的热图。对每个数据集进行800万reads进行比较,我们发现在所有位点中,组蛋白修饰的CUT&Tag比CUT&RUN显示出更高的信号(图2c)。两种方法都有较低的背景周围的站点。相比之下,ChIP-seq信号的动态范围非常狭窄,只有CUT&Tag信号范围的1/20左右,而且大多数位点的信号都非常弱。为了定量比较,我们使用在H3K4me1 ChIP-seq数据集上显示的定义的前10,000个峰附近,计算CUT&Tag、CUT&RUN和ChIP-seq数据集的平均read counts(图2g)。我们发现,CUT&Tag分析在这些位点上提供了更多的信号积累,这意味着CUT&Tag在区分染色质特征时最有效,所需的reads最少。 基因和调控元件的转录状态可以从组蛋白修饰模式进行推断,但基因表达可以通过分析染色质结合的RNA聚合酶II (RNAPII)直接读出。 我们使用了RNAPII的磷酸化抗体(S2/5p),用以区分参与的聚合酶。Landscapes显示RNAPII CUT&Tag在许多基因上的富集(图2a),启动子热图显示这种富集主要位于活性基因的5 "端(图2d)。 为了在不依赖于注释的情况下验证RNAPII CUT&Tag的结果,我们选择了通过碱基对分辨率PRO-seq技术获得的转录run-on数据,该技术使用一种与染色质分析无关的方法直接mapping RNAPII。PRO-seq定位了被激活的RNAPII 5 "末端的位置,并用于识别转录起始位点下游暂停的RNAPII。使用MACS2 call peak(RNAPII S2/5p CUT&Tag),并分析通过PRO-seq run-on人类K562细胞(SRA GSM1480327)的数据集。当使用RNAPII CUT&Tag 的MACS2评分排序时,PRO-seq的occupancy和RNAPII- ser2 /5p CUT&Tag的occupancy之间有密切的对应关系(图2e)。 通过CUT&Tag分析的H3K4me1修饰的重复非常相似,证明了该方法的可重复性(图3a)。当我们比较H3K27me3 CUT&Tag重复时,我们得到了相似的重现性。在先前的CUT&RUN分析实验中,我们发现与活性启动子和增强子相关的H3K4me2组蛋白修饰landscapes与ATAC-seq谱相似。因此,我们使用H3K4me2抗体进行CUT&Tag。我们发现H3K4me2在强的ATAC-seq峰时occupancies很高(图2f),read counts也很多(图2h),这意味着H3K4me2图谱能以更高的灵敏度捕获基因组中最占主导的染色质位点。 为了量化H3K4me2 CUT&Tag相对于H3K4me2 CUT&RUN、H3K4me2 ChIP-seq和ATACseq的敏感性,我们对每个方法进行了采样,并使用MACS2默认参数call peak。然后,我们评估在每一个peak里的reads比例。我们发现,CUT&RUN和CUT&Tag都比ChIP-seq或ATAC-seq有更多的reads,表明它们具有极低的信噪比(图3b)。此外,CUT&Tag在低测序深度时的峰分布更为迅速,其中~ 200万reads相当于CUT&RUN的100万reads(或ChIP-seq的2000万reads),证明了CUT&Tag的超高效率。在所有的方法中,只有CUT&Tag在峰内达到0.6的分数。因此,通过两种组蛋白修饰(H3K4me2和H3K27me3),我们将染色质landscape分为活性区和沉默区,即使测序深度相对较低。 为了确定我们是否可以使用CUT&Tag来绘制转录因子结合的图谱,我们测试了pA-Tn5在转录因子上的栓系是否可以与基因组中可接近的DNA位点区分开来。我们在CUT&Tag反应中使用了NPAT核因子的抗体,NPAT核因子是复制依赖组蛋白基因的转录辅激活因子。NPAT只结合了1号染色体和6号染色体组蛋白clusters中的约80个可接近位点,因此我们可以比较真正的结合位点和可接近位点。在NPAT CUT&Tag图谱中,约99%的read counts在组蛋白基因启动子处积累(图4a)。通过对已发表的ATAC-seq数据对应位点进行评分,我们发现较少数量的counts分布在K562基因组的可接近位点(图4b)。这可能是由于一些未栓系的pATn5与暴露的DNA原位结合造成的,但通过read覆盖的巨大差异,很容易区分抗体栓系位点与可接近位点(图4c)。事实上,通过标准算法进行call peak,NPAT CUT&Tag ~ 9000位点的数据生成一个列表,其中包括组蛋白基因启动子和10%的ATAC-defined可接近位点。虽然这只是定义的~ 54000可接近位点的一小部分,调整阈值和严格的NPAT peak calling可以提高峰检测。 为了测试CUT&Tag是否易于分析更丰富的转录因子结合位点,我们分析了CCCTC结合因子(CTCF)DNA结合蛋白。在这些实验中,我们通过改变缓冲液的严格程度来评估染色质中转录因子的置换情况。在低盐和中盐浓度条件下,我们观察到CUT&RUN和ChIPseq检测的CTCF位点的read计数(图5a),但有额外的小峰。这些额外的峰表明,未“栓系”pA-Tn5有助于这些实验的coverage。为了确定真正的CTCF结合位点是否可以通过read深度与可接近特征区分开,我们比较了高置信度CTCF位点(由peak-calling定义)的CUT&Tag read counts CUT&RUN data)到可接近位点的CUT&Tag read counts(由ATAC-seq数据peak-calling定义)。我们发现,这两种read counts分布重叠,但可接近位点的read counts低于CTCF位点(图5b)。仅基于reads深度,我们鉴别出约5600个CTCF结合位点,错误发现率为1%。比较这两类的motif富集,发现高信号motif对应CTCF motif(E-value = 2.1 × 10u221269),低信号motif不对应。 我们通过绘制以CTCF结合位点为中心的reads末端来评估CUT&Tag的分辨率。这表明CUT&Tag保护的“footprint”在CTCF motif跨越80 bp(图5c)。而从Tn5整合保护的片段大于CUT&RUN中MNase保护的约45 bp,这表明tethered转座酶产生了高分辨率的因子结合位点图。在300-500mM盐浓度的情况下,不同的盐浓度洗涤也能得到相似的footprints结果,在一定程度上降低了信噪比(图5c)。高分辨率的CUT&Tag提供了单个位点的结构细节。例如,在代表性位点对CTCF、H3K4me1、H3K4me2、H3K4me3和ATAC映射的叠加,揭示了可接近的DNA、CTCF结合和修饰的邻近核小体之间的关系(图5d)。 ChIP需要大量的细胞材料,限制了它在实验和临床样品中的应用。然而,我们和其他人之前已经证明,像CUT&RUN这样的tethered分析策略具有足够的敏感性,因此分析小细胞数通常是可行的。CUT&Tag的信号改进表明,这种方法可以在有限的样本下更有效地工作。我们首先用CUT&Tag在大约1500倍范围的材料中测试了H3K27me3修饰,从100,000个细胞到60个细胞。我们从所有实验中观察到非常相似的高质量染色质谱(补充图1b),表明在少量材料的情况下仍然保持高数据质量。 CUT&Tag的优点是,从抗体结合到adapters整合的整个反应都发生在完整的细胞内。转座子酶和染色质片段仍然结合在一起,因此片段化的DNA被保留在每个细胞核内。 我们开发了一种简单的策略来生成单个细胞的染色质谱,我们称之为 单细胞CUT&Tag(scCUT&Tag) (图6a)。我们对大量K562细胞群体进行H3K27me3修饰的scCUT&Tag分析,但在步骤之间温和离心,而不是ConcanavalinA 磁珠。整合后,我们使用Takara ICELL8纳米分装系统将单个细胞分离到5184孔的纳米孔芯片里,通过对芯片成像识别包含一个或仅包含一个细胞的纳米孔。然后,我们使用两个indexed引物对每个通过的纳米孔进行文库PCR富集,最后将芯片上的所有富集文库集中到一起进行Illumina深度测序,达到高冗余,以评估每个细胞的采样和覆盖。每个孔的文库由两个索引的独特组合来区分。 单个细胞染色质图谱的聚集与大量样本中产生的图谱非常匹配(图6b),具有较高的相关性(Pearson "s r = 0.89)。每个细胞通过全基因组的reads数量进行排序,每个细胞的唯一片段都显示在tracks中。值得注意的是,单个细胞中的大多数reads都位于分析中定义的H3K27me3区域内,这表明单细胞染色质分析的高恢复率(图6b)。H3K27me3 scCUT&Tag的第二个重复证明了单细胞分析的重现性。类似地,H3K4me2修饰的单细胞图谱概括了可接近和活性染色质的基因组landscapes(图6c)。在单个细胞中,相当大一部分reads属于定义的活性和沉默染色质特征(图6d, e)。 染色质特征的广度——从H3K4me2的大约5个核小体到H3K27me3区域的数百个核小体——即使在单个细胞稀疏采样的情况下,也有助于检测染色质特征。为了评估单个细胞的染色质特征是否可以用来区分细胞类型,我们进行了H3K27me3的scCUT&Tag分析(H1细胞)。我们再次发现,很大一部分reads位于分析定义的域内(图6e),bulk数据和聚集的单细胞数据之间具有很高的相关性(Pearson"s r = 0.85)。通过比较包含HoxB结构域的2Mb区域,可以发现H1细胞中单细胞轨迹中明显的组蛋白甲基化,而K562细胞中该区域缺失(图6f)。这些全基因组模式足以高效地区分H1细胞和K562细胞。因此,染色质图谱提供了一种区分单个细胞类型的方法。 通过CUT&Tag分析染色质可以有效地揭示基因组中的调控信息。与RNA-seq仅测量基因表达不同,染色质分析在识别沉默区方面具有独特的优势,这是细胞在发育过程中的确定“cell fates”的关键方面。虽然像ATAC-seq这样的方法可以绘制出可接近位点和因子结合位点,但结合在这些位点上的特定染色质蛋白必须从motif或染色质谱数据推断出来。虽然基于ChIP的方法已广泛应用于细胞系模型,但由于交联和染色质片段化的影响,ChIP-seq对染色质的分析受到限制,因为每个实验都需要优化。同样,最近的另一种交联染色质分析方法ChIL-seq比CUT&Tag需要更多的步骤,需要3-4天来完成所有步骤。相比之下, CUT&Tag过程,像CUT&RUN一样,是一种不固定的原位方法 ,并且很容易以标准化的方法实现。这与CUT&Tag的成本效益相结合,使得它适用于可以在核心设施中实现的高通量。可以想象,用户仅提供他们的细胞和抗体的混合物,并在短短几天内收到处理的深度测序文件。由于高通量CUT&Tag的第一步是在4°C条件下进行抗体孵育,样本可以在设备中积累一夜,然后一起装载到一个96孔板上进行自动化处理,就像我们之前在AutoCUT&RUN中演示的那样。由于试剂的高效使用和更好的信噪比,CUT&Tag比AutoCUT&RUN需要每个样本更少的reads,这已经比商业化外显子组测序便宜得多。虽然这种pipeline的简单和低成本很吸引人,自动染色质分析的主要优点是最小化批次效应并处理影响,从而最大限度地再现。这些方面对于临床分析和色谱靶向药物的检测是至关重要的。 我们已经证明,CUT&Tag使用ICELL8纳米分装系统提供了高质量的单细胞图谱,该系统可以在加入试剂和PCR之前进行成像。同样,CUT&Tag也应该适用于10×Genomics系统,他们最近公布了单细胞ATAC-seq方法。由于adapters是添加在bulk里的,所以CUT&Tag对高通量单细胞平台的适应性是有可能的。在CUT&Tag数据集中,低水平的非靶向可接近DNA位点和高水平的CTCF结合位点的不同分布表明,通过对这两种预期的潜在分布建模,可以在不使用其他数据的情况下区分真实结合位点和可接近DNA位点。 这种策略的一个优点是,真实结合位点和可接近特征之间的统计差异允许在同一实验中描述两个染色质特征,其中可接近DNA位点和目标因子的结合位点可以被同时注释。 在未来,我们预计adapters的条形码将允许多个表位同时在单个细胞中进行大量的分析,最大限度地发挥单细胞表观基因组分析在发育和疾病研究中的作用。 最后,放一张ChIP-seq,CUT&RUN和CUT&Tag三种方法的比较图:
2023-07-30 06:28:581

Extra Train Station Tracks 求助大神,这个mod怎么使用

这么多mod,加上后期发展越来越大,这吃配置啊。。。。这得需要什么配置才行啊。
2023-07-30 06:29:051

什么叫中文式英语?

用汉语思维说出的英语,比如 Long time no see 好久不见就是一句中国式英语
2023-07-30 06:27:411

LaTeX官网下载免费吗

latex是免费软件,latex是一个免费易于使用的高度功能和强大的LaTeX的编辑器,latex软件官方版编辑器下载到电脑集成了所需的开发工具、许多LaTeX文档。原来使用vim写latex太不方便了,现在换了texmaker,对于业余latex人士设计的软件太实用了。
2023-07-30 06:27:431

ISDN网和因特网还有ATM网有什么区别啊?

ISDN是 窄带综合业务网因特网 哪个没发说 你可以这么叫它 所有网络的集合ATM 那是一种复用技术 说白了是一种传输技术 不是什么网
2023-07-30 06:27:442

荷荷巴是什么?

  荷荷巴(Jojoba)(又名霍霍巴)是一种墨西哥原生的植物,颜怡荷荷巴油是品质最好的黄金荷荷巴油。虽然目前全球都有栽种,但是还是以美墨交界处的沙漠地形最适合它的生长,品质也最优良。其中这种有一人多高的灌木植物所结的种子中的油,具有良好的渗透性,还具有耐高温的特质。自古就拿来作为各种保养与治疗的使用,事实上,jojoba的原文中就有“神奇的灌木”的意喻。
2023-07-30 06:27:451

惊喜英文是什么意思?

"惊喜"的英文是 "surprise"。它用来描述一种突然而令人兴奋或震惊的事件、行动或情况。"Surprise" 可以是名词或动词,具有积极的情感色彩,给人一种令人愉悦和惊讶的感觉。当我们给别人带来意外的喜悦或经历到意想不到的事情时,我们可以说发生了一次 "surprise"。作为名词,"surprise" 指的是突然的、令人惊喜的事件或行为。例如:- "He gave me a surprise birthday party."- "The children"s faces lit up with surprise when they saw the presents."作为动词,"surprise" 表示使某人感到惊讶或震惊。例如:- "She surprised me with a special gift."- "The news surprised everyone in the room.""Surprise" 还可以用作形容词 "surprising",表示令人惊讶的或意外的。例如:- "It was a surprising turn of events."- "The results of the experiment were quite surprising."在日常生活中,我们常常希望给予他人惊喜,以增添欢乐和温馨的氛围。惊喜可以体现在生日庆祝、纪念日、礼物、派对、旅行安排等各种场合。这种意外的喜悦能够增强人际关系、营造友好氛围,并给人们带来愉快的回忆。总之,"surprise" 是表示惊喜的英文词汇,用来描述突然而令人兴奋或震惊的事件、行动或情况。它可以作为名词或动词,给人一种愉悦和惊讶的感觉。惊喜在人们的日常生活中起着重要的作用,增添欢乐和美好的体验。
2023-07-30 06:27:511

什么是ISDN方式?

常见的因特网接入方式主要有三种:拨号接入方式、ISDN方式和DDN方式。1、电话拨号直接进入这种方式就是通常所说的用MODEM拔号上网方式,是我们最熟知和应用最广泛的。主机通过调制解调器和电话线路与ISP(Internet服务商)网络服务器的调制解调器相连,实现主机与Internet网络服务器的联接。2、ISDN方式ISDN是“IntegratedServicesDigitalNetwork”的缩写,意思是综合业务数字网,俗称“一线通”。它是以综合数字电话网(IDN)为基础发展而成的,能提供端到端的数字连接。它是一个全数字的网络,也就是说,不论原始信号是文字、数据、话音还是图像,只要可以转换成数字信号,都能在ISDN网络中进行传输。ISDN采用的标准用户/网络接口主要有两种,目前我国的ISDN线路一般为“2B+D”模式。“2B+D”指的是2个基本数字信道(B信道),1个控制数字信道(D信道),每个B信道就像是一根“管道”,以每信道64Kbps的速率传送语音或数据资料(或将两个信道捆绑在一起以128Kbps的速率使用);D信道主要用于传输控制信号。一个“2B+D”连接可以提供高达144Kbps的传输速率,其中纯数据速率可达128Kbps。3、DDN方式DDN是“DigitalDataNetwork”的缩写,意思是数字数据网,即平时所说的专线上网方式。数字数据网是一种利用光纤、数字微波或卫星等数字传输通道和数字交*复用设备组成的数字数据传输网,它可以为用户提供各种速率的高质量数字专用电路和其他新业务,以满足用户多媒体通信和组建中高速计算机通信网的需要。主要有六个部分组成:光纤或数字微波通信系统;智能节点或集线器设备;网络管理系统;数据电路终端设备;用户环路;用户端计算机或终端设备。
2023-07-30 06:27:521

如何把Latex自动转为Word

随着越来越多的兄弟姐妹喜爱上latex,我们终于逐渐摆脱了Word排版的苦闷,但是用Latex写的论文给导师修改又产生了很多麻烦。PDF上直接加Note可读性很差。最好还是能尽量保持公式、图形、Reference的完整性,然后直接转成Word,然后导师在Word上用审阅模式修改,我们自己在Latex对应修改。这样导师就不用面对丑陋的Latex源码了。简单的说,我们可以这样做:1)我们用Latex书写论文2)我们转成Word给导师3)导师使用Word的审阅功能,修改论文4)我们对照修改的地方直接修改Latex5)最后生成修改后的PDF。这样我们方便,导师也方便。具体方式如下:以Ubuntu的Linux系统如下:1、安装Latexsudo apt-get install texlive2、安装latex2htmlsudo apt-get install latex2html3、把论文从Latex转换为htmllatex2html -split +0 input.tex(input.tex是我们的论文tex文件)4、这时在当前目录下多出一个input目录,大家可以弄到Windows里。(相信大家都有一个Linux的远程机器)5、这个目录就是所有的html文件,找到index.html,右键用Word打开。6、在word里另存为.doc或者docx文件。7、把word文档发给导师,等那些让人心惊肉跳的红字和note吧。。。大功告成,这样比AcrobatPro转为word文档在格式上更加安全。所有公式、图片、表格、算法都会被变为图片或者相应格式,在word里显示没有任何问题。(注意:使用这种办法,要求你的tex可以在latex编译出dvi没有问题,也就是说使用eps图片的没有问题,但是使用pdf,jpg图片格式的,由于使用pdflatex命令编译出PDF。这个方法就不行了,需要手动改一下html文件)。(EPS图片问题,我一般使用ImageMagic去批处理的转jpg,pdf到eps,然后在tex文件里引用eps图片,这样就规避了无论用pdflatex或者latex都可以编译出正确的pdf和dvi,那么Latex2html就没有任何问题了)哪个兄弟提供一台机器做服务器,我可以把环境都搭建好,这样兄弟们就不用装来装去了。
2023-07-30 06:27:524

荷荷巴籽油究竟是什么?

荷荷巴籽油是一种植物油,它是从荷荷巴树的种子中提取出来的。这种植物油通常呈黄色、清澈、无味或微淡的香气,具有许多美容和保健的用途。荷荷巴籽油富含多种营养成分,包括维生素E、B族维生素、蛋白质以及不饱和脂肪酸等。这些成分对皮肤和头发都有很好的滋润和保护作用,可以使皮肤更加光滑柔软,头发更加亮泽顺滑。荷荷巴籽油非常适合作为化妆品的基础配方。它含有丰富的天然成分,能够与其他化妆品成分相容,并且不会对皮肤产生刺激或过敏反应。因此,在许多化妆品中都可以看到荷荷巴籽油的身影。荷荷巴籽油还具有一定的保健作用。它可以帮助调节身体内部环境,增强人体免疫力和代谢能力,促进身体健康。荷荷巴籽油是一种非常优秀的植物油,在美容和保健领域都有广泛的应用。如果你想要拥有更加健康、光滑和美丽的皮肤和头发,不妨尝试一下这种天然的营养保养品。如果你想选择一款好用的荷荷巴籽油产品,可以考虑花梦花精华油,这是一款备受消费者喜爱和推崇的优质产品。
2023-07-30 06:27:552

enthernet、isdn、atm、novell各是什么?

enthernet 以太网 为了便于多媒体信息在网罗上传输isdn 综合数字业务网atm 异步传输模式novell 是一种网络操作系统
2023-07-30 06:28:002

isdn是指什么

isdn实际上提供的是一种窄带交换业务,尚不能满足对更高带宽数据通信的要求,如高清晰图像数据传输等。是指用户线上的传输速率在2Mbit/s以上的ISDN。它是在ISDN基础上发展起来的,可以支持各种不同类型、不同速率的业务,不但包括连续型业务,还包括突发型宽带业务。更多关于isdn是指什么,进入:https://m.abcgonglue.com/ask/8d89f11616112601.html?zd查看更多内容
2023-07-30 06:27:341

“阿房宫”正确的读音应该是什么,为什么?

e(一声) pang(二声) gong (一声)
2023-07-30 06:27:3414

Windows键在哪

键盘左下角第二个
2023-07-30 06:27:328

爆笑中国式英语

法官喳喳吱吱时候,是在纠问式审判,现在是听判式,法官很少“喳吱”了。 以前《毛泽东选集》是中国人的红宝书。 爆笑(29):浮老哥是蛤蟆 Frog,n
2023-07-30 06:27:314

ISDN是什么

IntegratedServicesDigitalNetwork,ISDN,综合业务数字网,是一个数字电话网络国际标准,是一种典型的电路交换网络系统。
2023-07-30 06:27:272

护肤品里常见的霍霍巴籽油有什么功效?

霍霍巴籽油的分子排列和人的油脂非常类似,所以敏感皮肤也可以使用,富含维生素D、矿物质、维生素、蛋白质、胶原蛋白。我最近在用的安露莎丽蓓思朵卸妆乳里就有霍霍巴籽油,再加上角鲨烷和洋甘菊提取物,所以卸完妆皮肤不会发红或者干燥紧绷。
2023-07-30 06:27:272

“对方”用英语怎么说?

对方:[ duì fāng ] 1.counterpart 2.other person involved 3.opposite side 4.other side 5.receiving party 其它相关解释: 例句与用法: 1.面对我们摆出来的证据,对方只得作出让步. After being confronted with our evidence,the other side had to back down. 2.出示确凿的证据之后,对方不得不作出让步. After being shown conclusive evidence,the other side had to back down. 3.他们站在那,互相怒视着对方. They stood there,glaring at each other. 4.孩子们在游泳池里互相把对方按入水中. The children ducked each other in the swimming pool. 5.我没有理睬对方的嘲笑. I ignored the taunts of the opposition.
2023-07-30 06:27:231

括号里面一个点用latex怎么打

(cdot)
2023-07-30 06:27:222