- max笔记
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基因的Transcript Variant 和 isoform的区别如下:
transcript variant是从结果来看的,一个基因产生了不同的mRNA;splice variant是从过程讲的,强调内含子剪切的方式不一样。
variant指的是转录本的亚型,而isform指的是蛋白水平的。有的时候虽然variant很多但是对应的蛋白可能是重复的。
有很多过程可以影响isoform的形成,如可变剪切,即不一定所有的外显子都用来形成成熟的mRNA,而且有时候什么内含子,外显子也不是绝对的。另外有RNA editing这个过程,会使得形成mRNA时某个特定的位置的碱基发生变化,也就是变成不是原来基因想要编码的东西。
有个例子就是一个叫XBP-1的转录因子,它调控细胞的unfolded protein response,激活方式就是上游蛋白剪切其mRNA然后生成有活性的mRNA,所以这种variant的生成竟然也是调控的一种方法。
- Chen
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基因的Transcript Variant 和 isoform的区别如下:
transcript variant是从结果来看的,一个基因产生了不同的mRNA;splice variant是从过程讲的,强调内含子剪切的方式不一样。
variant指的是转录本的亚型,而isform指的是蛋白水平的。有的时候虽然variant很多但是对应的蛋白可能是重复的。
有很多过程可以影响isoform的形成,如可变剪切,即不一定所有的外显子都用来形成成熟的mRNA,而且有时候什么内含子,外显子也不是绝对的。另外有RNA editing这个过程,会使得形成mRNA时某个特定的位置的碱基发生变化,也就是变成不是原来基因想要编码的东西。
有个例子就是一个叫XBP-1的转录因子,它调控细胞的unfolded protein response,激活方式就是上游蛋白剪切其mRNA然后生成有活性的mRNA,所以这种variant的生成竟然也是调控的一种方法
- cloud123
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描述阶段不同
Transcript Variant 即为转录本,同一基因会有不同的transcript variant是因为转录时选择性剪切(alternative splicing)形成的不同mRNA。
isoform即由来自一个基因的mRNA前体因选择性剪接而产生多种mRNA, 并翻译出的不同蛋白质(同源异构体)。
- 贝贝
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基因的Transcript Variant 和 isoform的区别如下: transcript variant是从结果来看的,一个基因产生了不同的mRNA;splice variant是从过程讲的,强调内含子剪切的方式不一样。 variant指的是转录本的亚型,而isform指的是蛋白水平的。有的时候...
- 可可
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Isoforms refers to different versions of protein from the same gene in this setting,
and transcript variants refers to different versions of mRNA transcript from the same gene.
- 苏萦
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Just like a moth drawn to a flame