简并引物是什么?设计的原则或原理是什么?

sylas2022-10-04 11:39:542条回答

简并引物是什么?设计的原则或原理是什么?
请用通俗易懂的话来解释一下!明天要答辩了,但对这方面不清楚,

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↙═┳↙┳═↙ 共回答了18个问题 | 采纳率94.4%
中文名称:
简并引物
英文名称:
degenerate primer
定义:
获得序列未完全清楚的核酸的一种引物设计方案,特点是所设计的引物序列某位置的核苷酸可以分别是两个或两个以上不同的碱基,结果所合成的引物是该位置上不同序列的混合物.
应用学科:
生物化学与分子生物学(一级学科);方法与技术(二级学科)
1年前
lilycrying 共回答了15个问题 | 采纳率
简并引物通俗的讲是不完全相同的引物序列的混合物。使用简并引物是为了增强引物的通用性,即不同DNA序列的目的基因都可以用这种引物进行PCR扩增。其定义是为了获得序列未完全清楚的核酸的一种引物设计方案,特点是所设计的引物序列某位置的核苷酸可以分别是两个或两个以上不同的碱基,结果所合成的引物是该位置上不同序列的混合物。设计原则是把代表编码单个氨基酸所有不同碱基可能性的不同序列等比例混合。反之,如果为了增...
1年前

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基因在植物不同器官的表达,如何设计实验?我的下一步就是做这个
驿路随笔1年前2
huanggy0067 共回答了20个问题 | 采纳率80%
到Genbank上去比对,找相识基因,最好是找同一生物种的,还可以翻译出来,比对蛋白质序列,分析可能具有的功能,下一步能做的方向很多,建议找篇研究某个基因的毕业论文来看,上面会有详尽的方法,多看文献,自然就有研究思路了
简并引物 特异引物 还有16s的引物有什么不同 用它们PCR出来的产物 看条带能看出来吗
wq05511年前1
阮建邦 共回答了20个问题 | 采纳率95%
1、简并引物 :序列未完全清楚的核酸的一种引物设计方案,比如TGGC(x)AAT,则设计引物时(X)位置可分别用ATCG四条引物
特异引物 :这个不用说吧,就是序列清楚后自己根据上下要设计的普通引物
16s的引物:常被用于鉴定,一般引物可在文献、网站上找到.16S rRNA所对应的 16S rDNA基因在细菌基因组中具有高度保守性;对于同一种细菌其16S rDNA基因组的同源性应大于70 %.对16S rDNA而言,如果出现3个碱基以上的差异就可以断定细菌不属于同一种属;
2、PCR出来的产物看条带比较的是大小,16S rDNA挺多用的是150bp左右的,但简并引物和特异引物则看具体情况了,如果设计的引物区间差异大,是可以分开的
简并引物的pcr扩增我照文献报道的虾的一个基因的保守区的简并引物及其pcr的条件,试着扩增蟹的这种基因,死活扩不出条带.
简并引物的pcr扩增
我照文献报道的虾的一个基因的保守区的简并引物及其pcr的条件,试着扩增蟹的这种基因,死活扩不出条带.
于是我用虾的cdna做模板试下也没扩出带来?这是什么原因啊?
优化了条件也不行,真奇怪.
一样的物种一样的引物一样的条件都不行,难怪扩不出别的物种了.
谁帮我分析下原因啊?
为什么 文献报道的内存 不可重复?
这是我最搞不懂的地方。
FlightingOn1年前1
slkdgshn 共回答了21个问题 | 采纳率95.2%
我也遇到过类似的问题,根据同源性设的引物来PCR,结果出来的是非特异条带,要不就是没有.
还是得优化条件 比如引物和模板的比例
RT-PCR模板选择问题.我是准备设计简并引物扩增一个鱼类的未知基因的保守区.一些文献上是提取脑部总RNA,然后反转录得
RT-PCR模板选择问题.
我是准备设计简并引物扩增一个鱼类的未知基因的保守区.一些文献上是提取脑部总RNA,然后反转录得到第一链CDNA,然后用这CDNA做模板扩增保守区.但是我老师的想法是直接提取DNA,然后用DNA做模板来扩增保守区.请问有经验的同学老师,那种方法好点?各自的有缺点是什么?请不吝赐教.
似水流云21年前1
jingshuai 共回答了11个问题 | 采纳率100%
你用直接提取的dna做模板pcr出来的是他的基因组序列 包括了内含子的 但是用总RNA反转录出来的cdna pcr出来的只有外显子 是经过了转录后剪切的
主要是看你要用来干什么 如果是要过表达最好是用总RNA 反转出来的cdna做模板
简并引物中的简并度是什么意思
爱不给爱1年前1
海边椰树_Jane 共回答了13个问题 | 采纳率84.6%
就是简并碱基的乘积 比如aaggtt(a/c/g)tt(t/a)ggt(g/c)括号里面的是简并碱基 乘积是3*2*2=12简并度就是12呗 呵呵 ok?