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kegg pathway 途径上基因的颜色怎么加的

花青素 学名:OPC 花青素是一种水溶性色素,可以随着细胞液的酸碱改变颜色。细胞液呈酸性则偏红,细胞液呈碱性则偏蓝。花青素(anthocyanins)是构成花瓣和果实颜色的主要色素之一。经由苯基丙酸类合成路径(phenylpropanoid pathway)和类黄酮生合成途径(flavonoids biosynthetic pathway)生成。影响花青素呈色的因子包括花青素的构造、pH値、共色作用(copigmentation)等。果皮呈色受内在、外在因子和栽培技术的影响。光可增加花青素含量;高温会使花青素降解。花青素为植物二级代谢产物,在生理上扮演重要的角色。花瓣和果实的颜色可吸引动物进行授粉和种子传播 (Stintzing and Carle, 2004)。常见于花、果实的组织中及茎叶的表皮细胞与下表皮层。部分果实以颜色深浅决定果实市场价格。花青素属于酚类化合物中的类黄酮类(flavonoids)。基本结构包含二个苯环,并由一3碳的单位连结(C6-C3-C6)。花青素经由苯基丙酸路径和类黄酮生合成途径生成,由许多酵素调控催化。以天竺葵色素(pelargonidin)、矢车菊素(cyanidin)、花翠素(delphinidin)、芍药花苷配基(peonidin)、矮牵牛苷配基 (petunidin)及锦葵色素(malvidin)六种非配醣体(aglycone)为主。花青素因所带羟基数(-OH)、甲基化(methylation)、醣基化(glycosylation)数目、醣种类和连接位置等因素而呈现不同颜色 (范和邱, 1998)。颜色的表现因生化环境条件的改变,如受花青素浓度、共色作用、液胞中pH値的影响 (Clifford, 2000)。本文目的为了解影响花青素生合成的因子,以作为田间栽培管理的参考。 橙色和黄色是胡萝卜素的作用。1910年在胡萝卜中发现了β-胡萝卜素,以后共发现另外2种胡萝卜素异构体,分别是:α、β、γ三种异构体。1958年β-胡萝卜素获得专利(US2849495,1958年8月26日,专利权人:Hoffmann La Roche),目前主要从海洋中提取,也可人工合成。 自然界有超过300种不同的花青素。他们来源于不同种水果和蔬菜如紫甘薯、越橘、酸果蔓、蓝莓、葡萄、接骨木红、黑加仑、紫胡罗卜和红甘蓝、颜色从红到蓝。这些花青素主要包含飞燕草素(Delchindin)、矢车菊素(Cyanidin)、 牵牛花色素(Petunidin)、芍药花色素(Peonidin). 花青素颜色随PH值发生变化,从当PH值为3时的覆盆子红到当PH值为5时的深蓝莓红。在大多数应用中,这些色素具有良好的光、热和PH稳定性,并且能够承受巴氏和UHT热处理。花青素广泛地应用在饮料、糖果、果冻和果酱中。紫甘薯花青素在不同PH值下的颜色变化见右下图:紫甘薯花青素在不同PH值下的颜色变化 近年来对作为多酚的花青素对健康可能带来的好处的关注越来越集中。将来花青素的这种特性在功能食品和保健食品中有可能得到日益应用。目前市场上有比较成熟的花青素产品,这些花青素主要是越橘花青素、蓝莓花青素、蔓越橘花青素、接骨木花青素、黑莓花青素和黑豆皮花青素等,含量均为25%或40%。国内西安天一生物技术有限公司的 薛西峰先生做了详细的提取工艺研究,并于2001年开始大规模生产25%的花青素成品。[编辑本段]花青素的作用 花青素类色素广泛存在于紫甘薯、葡萄、血橙、红球甘蓝、蓝莓、茄子皮、樱桃、红橙、红莓、草莓、桑葚、山楂皮、紫苏、 黑(红)米、牵牛花等植物的组织中。 花青素为人体带来多种益处。从根本上讲,花青素是一种强有力的抗氧化剂,它能够保护人体免受一种叫做自由基的有害物质的损伤。花青素还能够增强血管弹性,改善循环系统和增进皮肤的光滑度,抑制炎症和过敏,改善关节的柔韧性。下面列出花青素的部分功效: 1.有助于预防多种与自由基有关的疾病,包括癌症、心脏病、过早衰老和关节炎; 2.通过防止应激反应和吸烟引起的血小板凝集来减少心脏病和中风的发生; 3.增强免疫系统能力来抵御致癌物质; 4.降低感冒的次数和缩短持续时间; 5.具有抗突变的功能从而减少致癌因子的形成; 6.具有抗炎功效,因而可以预防包括关节炎和肿胀在内的炎症; 7.缓解花粉病和其它过敏症; 8.增强动脉、静脉和毛细血管弹性; 9.保护动脉血管内壁; 10.保持血细胞正常的柔韧性从而帮助血红细胞通过细小的毛细血管,因此增强了全身的血液循环、为身体各个部分的器官和系统带来直接的益处,并增强细胞活力; 11.松弛血管从而促进血流和防上高血压(降血压功效); 13.防止肾脏释放出的血管紧张素转化酶所造成的血压升高(另一个降血压功效); 14.作为保护脑细胞的一道屏障,防止淀粉样β蛋白的形成、谷氨酸盐的毒性和自由基的攻击,从而预防阿尔茨海默氏病; 15.通过对弹性蛋白酶和胶原蛋白酶的抑制使皮肤变得光滑而富有弹性,从内部和外部同时防止由于过度日晒所导致的皮肤损伤等等。 (此文原文有误导之处,经过国外网站资料考证 关于花青素是否能够保护人体免受一种叫做自由基损害目前还不明确,而且理论上的125岁 并不是光自由基一方面就可以做到的 还有很多外在因素,并且花青素有被中和的可能,请大家客观对待,以免受某些保健食品的引用片面影响。特编辑此文) 16花青素还具有抗辐射的作用,花青素颜色因PH值不同会发生变化,大部分花青素具有良好的光、热、PH值稳定性,对于白领或是长期处于日晒、电辐射环境中的人群,花青素的功效可是不可或缺的。 [编辑本段]花青素的研究应用 现代人发现,尽管抗生素和维生素的研究已经非常深入,但也解决不了诸如心脑血管疾病、糖尿病、癌症等现代疾病以及亚健康状况,更不能解决人的延年益寿、抗衰老的问题。科学研究:如果一旦解决了自由基的侵害问题,那么人体细胞就可以真正自由成长,人的平均寿命一定会达到125岁。所以人的寿命长短直接取决于人们抗氧化抗自由基能力的强弱,而花青素的发现为全世界的人找到了抗氧化抗衰老的最简单有效的办法。 花青素的发现和应用使人类从20世纪的抗生素、维生素时代,进入到21世纪的花青素时代! 随着科技的发展,人们对食品添加剂的安全性越来越重视,合成色素的使用种类和数量已经大幅度下降,因此,开发和应用天然色素已成为世界食用色素发展的总趋势。 花青素是一类广泛存在于植物中的水溶性色素,属于类黄酮化合物。在植物中常见的有6种,即天竺葵色素(P g)、矢车菊色素(Cy)、飞燕草色素(Dp)、芍药色素(Pn)、牵牛花色素(Pt)和锦葵色素(Mv)。自然条件下游离的花青素极少见,常与一个或多个葡萄糖、鼠李糖、半乳糖、木糖、阿拉伯糖等通过糖苷键形成花色苷,花色苷中的糖苷基和羟基还可以与一个或几个分子的香豆酸、阿魏酸、咖啡酸、对羟基苯甲酸等芳香酸和脂肪酸通过酯键形成酰基化的花色苷。已知天然存在的花色苷有250多种,存在于27个科、73个属的植物中。 已开发的花青素葡萄皮色素是开发最早且最丰富的花青素类色素,由葡萄科果实的果皮或葡萄酒酒厂的废料-- 葡萄渣,以水或乙醇萃取,后经精制、真空浓缩而得,主要成分有锦葵色素-3-葡糖啶、丁香啶、二甲翠雀素、甲基花青素、翠雀素等,广泛用在饮料、冷饮、蛋糕、果酱等的生产上,用量0.002%~0.3%。 玫瑰茄色素(玫瑰茄红),由锦葵科木槿属一年生草本植物玫瑰茄的花萼提取精制而来,100g干花萼可制得 1.5g总花色苷,主要成分有飞燕草素-3-接骨木二糖苷、矢车菊素-3-接骨木二糖苷和少量的飞燕草素-3-葡糖苷、矢车菊素-3-葡糖苷,玫瑰茄红是食用红色(至紫色)色素,适用于pH值在4以下,不需高温加热的食品,如糖浆、冷点、冰糕、果冻等,用量在0.1%~0.5%。 高粱红色素是取自紫黑色或红棕色高粱种子的外果皮,主要成分是芹菜素和槲皮黄苷。高粱红对光、热稳定,在酸性和碱性条件下均可呈红棕色,染色力强,是食用红棕色色素,因其性质稳定,故应用广泛。 另外国际上已开发应用的花青素类色素花生衣红色素、落葵红、黑加仑红、天然苋菜红、紫玉米色素、桑葚红色素、红米红(黑米红)、紫苏色素、红球甘蓝色素、蓝锭果红等。花青素类色素在酸性环境中呈现红色,色泽亮丽,并且对光、热、氧稳定性好(葡萄皮色素除外),是日用品调色的最佳天然色素之一。而国内除红球甘蓝色素、紫苏色素、蓝锭果红、紫玉米色素未得到批准之外,其他的都得到了广泛的应用。 应用研究和存在的问题花青素同其他天然色素一样无毒无副作用,安全性能高,着色色调自然,更接近天然物质的颜色,且具有保健功能。但是与合成色素相比较,花青素类色素也存在一些缺陷,花青素对pH值、温度、光照、金属离子十分敏感,稳定性差,如色调会随pH的变化而发生明显变化,在酸性环境中显红色,中性时显紫色,碱性时显蓝色。 花青素分子中存在高度分子共轭体系,具酸性与碱性基因,易溶于水、甲醇、乙醇、稀碱与稀酸等极性溶剂中,溶剂中通常用含有少量盐酸或甲酸的甲醇做溶剂提取,其中的酸能防止非酰基化的花色苷的降解,然而在蒸发浓缩时这些酸会导致色素的降解,在一些植物中,少量的酸会使酰基化的花色苷部分或全部的水解,在对从葡萄中提取花青素的多种方法进行了比较试验证明,当溶剂中的HCI达到0.12mol/L时就能使酰基化的花色苷部分水解。简单的提取纯化工艺很难达到含量≥24%的标准,而欧洲国家利用他们自己拥有的提取纯化技术,可使提取物的花青素含量≥36%。 近年来对花色苷类色素的抗氧化性及生理功能有较多的研究报道,并研究了它们的抗氧化性与化学结构之间的关系,然而,花色苷在活体组织中的抗氧化功能却很少得到证实,因此更有待于我们进行深入研究以下问题:人体吸收花色素苷的相关机制以及花色素苷的转化产物对人体所起的作用,药物动力学,物种形式或组织结构的分布情况。 未来有潜力的花青素类色素花青素类色素广泛存在于葡萄、血橙、红球甘蓝、蓝莓、茄子皮、樱桃、红橙、红莓、草莓、桑葚、山楂皮、紫苏、紫甘薯、黑(红)米、牵牛花等植物的组织中。20世纪80年代,日本就从红球甘蓝的叶子中提取分离出4种花青素,并将其作为食品着色剂(红至红紫色),广泛用于糖果、果汁、汽水、冰淇淋、话梅的生产上。紫苏色素主要成分是紫苏素、紫苏宁,是存在于紫苏科中具有紫色叶的品种的天然红色素,日本在1993年就规定其为食品添加剂,并用于口香糖、果汁饮料等,认为其具有预防过敏、防龉齿、消炎等作用。紫苏是我国传统药用植物,是我国卫生部卫防字(1987)57号文公布的第二部分33个药食两用的品种之一。近年来从紫甘薯中提取花青素成为国际上热门研究项目,因为紫甘薯产量高,容易栽培,是经济地获取花青素的理想途经,尤其是高花青素紫甘薯品种的育成,为规模化生产花青素提供了优质原料! 紫甘薯 随着研究的不断深入,通过人工酰基化以提高花青素稳定性的工作也取得很大进展。另外,植物组织培养技术也可以用于花青素类色素的其他生产。花青素因其亮丽的色泽、抗氧化和其他保健功能,必将 投入工业化生产,以丰富人们的工作和生活 谢谢!

octadecanoid pathway的中文意思?

正十八烷(十八碳烷)链/键吧

signaling pathway是什么意思

signaling pathway 信号通路;信号途径;信号转导通路例句筛选1.Major components in the ethylene signaling pathway in plants have beenidentified and characterized.主要组成部分的乙烯信号转导途径在植物中已确定和特点。2.Gene involved human insulin signaling pathway is an important target for anti diabetes drugs.人类胰岛素信号通路基因是糖尿病药物的重要靶标。

Kennedy pathway是什么意思

Kennedy pathway甘乃迪途径

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pathway impact信号通路的影响的意思

这里的through是什么词性?还是pathway through是一个整体?

The term bus refers to an electrical pathway ,through which(定从)bits (主语从句)are transmitted between the various computer components.through在这里是介词,介词加which引导的定语从句

NF-κB Pathway是什么意思?

NF-κB信号传导在生物学角度是这样解释的。这里给大家解释一下:Nuclear factor kappa beta (NF-kB) is a nearly ubiquitous pathway responsible for mediating DNA transcription, and thereby cell function. The pathway is activated by a variety of stimuli, including cellular stress, cytokines, free radicals, UV radiation, oxidized LDL, and bacterial/viral infection.Activated NF-kB translocates to the nucleus, where it binds to specific sequences of DNA called response elements. This DNA/NF-kB complex then recruits RNA polymerase and other coactivators, which transcribe downstream DNA into mRNA for protein synthesis.Incorrect regulation of NF-κB has been linked to cancer, inflammatory and autoimmune diseases, septic shock, viral infection, and improper immune development.(附上图解)

生物蛋白质分子的作用的聚类主要是为了什么目的,,,,pathway图是用来干什么的?

蛋白质相互作用网络是计算机科学技术的一个新研究领域。蛋白质功能预测是蛋白质相互作用网络富有挑战性的问题之一。它的研究不仅可以直接阐明生命体在生理或病理条件下的变化机制,而且对生物制药,农业生物科技等应用领域同样具有直接的指导作用。 本文在深入分析现有蛋白质相互作用网络的聚类算法和蛋白质功能预测方法的基础上,对适合蛋白质相互作用网络的聚类算法和蛋白质功能预测问题进行了研究,提出一种新的聚类算法,并将聚类结果结合蚁群算法双序列比对来进行蛋白质功能预测,并进行了相应的实验分析,取得了较好的结果。论文主要工作包括: 总结出当前蛋白质功能预测所面临的挑战和困难。本文从蛋白质序列,结构与相互作用入手,研究了蛋白质相互作用及其网络统计参数和网络拓扑结构,并系统分析了蛋白质功能预测研究现状。 以往,蛋白质相互作用网络中结点之间的距离度量是需要通过基于网络的最短路径距离来重新定义,其计算代价高,这使得已有的基于欧几何距离的聚类算法不能直接运用到这种环境中。因此,通过蛋白质相互作用网络的特征提出了一种新的聚类算法。算法使用网络中的边和结点信息来缩减搜索空间,避免了一些不必要的距离计算。实验结果表明,算法对于真实的蛋白质相互作用网络中的结点聚类是高效的。 提出了利用蚁群算法双序列比对从蛋白质相互作用网络中预测孤立蛋白质与聚类中心蛋白质的相互作用,进而预测孤立蛋白质的功能。实验结果表明,该方法蛋白质功能预测中的应用是可行和有效的,对蛋白质序列进行测试并与基于局部比较的滑动窗口序列比对算法相比,可以得到较为满意的结果。

有没有大神熟悉pathway tools

是一个路径工具软件路径工具是一个综合性的符号系统生物学软件 系统是相关联的BioCyc数据库收集。路径工具支持生物信息学和系统生物学 几个使用案例:生物体特定的数据库开发(也被称为模式生物数据库),集成了许多 生物信息学数据类型,从基因组到通路。代谢重构和建模。科学计算可视化、网络出版,和传播那些 生物体特定的数据库,包括:完整的代谢网络和代谢途径的自动显示基因组浏览器显示操纵子调节子,和全转录调控网络视觉分析的基因表达和代谢组学数据集,如绘画 组学数据上的全面的代谢网络图,完整的监管网络, 和全。计算推理包括 代谢途径预测、代谢途径预测孔填料, 预测操纵子,可用于基因组。比较基因组与途径分析生物网络分析:指定路线搜索之间的代谢产物发现死的代谢产物识别瓶颈(潜在的药物靶点)在代谢网络路径工具有四个组成部分PathoLogic:创建一个新的通路/基因组数据库(PGDB)含有预测代谢途径 有机体,给定一个GenBank登录输入。Pathway/Genome导航:支持查询、可视化、分析pgdbs。 BioCyc网站导航能力BioCyc.org。MetaFlux:支持代谢通量模型的发展。通路/基因组编辑:对于pgdbs提供交互式编辑能力。请看路径工具概述对软件的功能,更详细的文档 。路径工具的开发Peter D.卡普和同事在 的生物信息学研究组 在SRI国际公司。路径工具的可用性路径工具是免费提供给用于研究的学者,并可用于fee to Commercial Institutions.

有ko号,怎么查pathway,kegg

如果您知道自己关注通路的ID,可以直接在第一步的基础上直接搜索,也可以获得特定物种的通路信息,例如上面的human的Pentosephosphate pathway,ID为hsa00030,我们就可以直接用这个ID进行搜索,具体操作为在步骤1的第二幅图中填入ID号,选择物种has,点击Go即可!

a pathway to这里的to是介词吗?后面是跟do还是doing

这个问题需要根据具体语境来判断。一般来说,“to”可以是介词,也可以是不定式符号的一部分。如果“to”是介词,后面通常跟名词或动名词作宾语,例如:A pathway to success.(通向成功的路径。)A pathway to learning.(学习的途径。)如果“to”是不定式符号的一部分,后面通常跟动词不定式,例如:A pathway to do something.(做某事的途径。)A pathway to achieve something.(实现某事的途径。)需要根据具体语境来判断后面应该是跟do还是doing。如果需要表达一个动作的完成,通常使用动词不定式,即跟do;如果需要表达一个动作的进行,通常使用动名词,即跟doing。

英国留学pathway什么意思

如果要去英国留学 我建议一定要学好英语;但除了提高考试成绩之外,教授就曾表示过 一定更要花时间注意提高自己的英语语言应用能力 使自己可以自如流畅的与同学和教授在课堂上进行交流 语言成绩只要达到学校要求的就够了,不需要再浪费时间和金钱去重复参加考试 因为语言考试分数高 并不意味着英语应用能力强!所以英语口语能力要学好 学标准口音还是要找欧美教师 喔 对了,我目前上的ABC天卞英语的助教才和我提过 就是想学会英语应该是不费力地;绝对有个适合的研习环境及练习口语对象,这取决于外教资质,东南亚口音重 一定要找欧美籍,发音纯正非常重要 持续逐日口语交流,1&1针对性教学就有.好.的学习成果..课程结束后同样要复习听取课堂录音档 更可以加深印象~不过实在没有练习对象的话,最好能上可可或沪江取得课后材料阅读 多用耳听、眼观、嘴动、脑想 短时间口语就加强起来 学习成效是绝对最佳的 UCAS 就是Universities and Colleges Admissions Service 的缩写,是英国 申请大学的讥构。有点像我们的教育局高考志愿部门,只负责大学申请等等的工作。SVV 学生访问签证 Student Visitor VisaESVV没听说过,一般就是SVV和GSV普通学生签证两种,区别是SVV时间较短属于短期访问学者签证,最长一年,不能打工,一般读语言预科就给这种。之后进阶成GSV签证,属于完全的学生身份或者成人学生身份,可以打工,还可以根据需要延长停留时间。你可以去使馆主页看签证类型。NsF就是 NATIONAL sUALIFICATION FRAMEWORK 国家资证书框架。1-是不同等级,1和就是GCSE你暂时可以理解为我们的高中,是A LEVEL,,是其他高等教育比如预科或者类似我国的成人教育或者大专什么的,是本科,是硕士,是博士和类似的学术学位。B1B 这个缩写不知道你说的是什么里的。。不过很多情况下说签证.B1商务签,B旅游签。还有你下面说的CEFR里似乎也有B1 B,属于分数级别。CEFR 是新时兴的欧洲语言共同建议标准,是语言考试,类似雅思托福。CEFR里的B1 B就是相当于:B1初级雅思.-.分,B是中级标准,等于雅思-分。之间联系么。。基本上你不需要知道这么多东西,你如果是高中生,你去英国先读预科,办SVV或者GSV签证,去了英国先读1-年预科或者A LEVEL,然后通过UCAS申请大学,大学会要你的学期成绩和语言成绩,一般都是雅思分左右,CEFR用的不多。然后你达到了成绩,你就递交成绩单,取得无条件录取通知书,或者直接拿有条件的通知书和已达到条件的证明,换或者续签证,然后去新的大学。不要太纠结于这些词语。。

pathway offer是什么

是一种专门针对留学生的桥梁课程录取通知书。Pathway课程主要是针对语言课程上没有达到直录标准的学生,可以适当的降低录取门槛,通过桥梁课程的方式来升学硕士。桥梁课程一般是由语言课程+专业课程+升学辅导三部分构成。其中专业课是有一定的学分可以转入正式课程的。

怎么在pathway中显示上调基因和下调基因

怎么在pathway中显示上调基因和下调基因如果你的样品是高等生物的话,基于已知的知识库结合你定量实验分析TF的话,有很多软件能够判断其上下调的特异性调节情况的。低等生物或者植物的话可能更多地结合序列预测等信息就比较麻烦点了。光有bingdingsite信息只能帮助判断能否regulate,但是不能确定向那个方向regulate。这个没别的办法,只有做实验才能确定到底是上调还是下调。现有关于protein-DNAinteraction的public数据库基本没有direction信息。商业数据库像MetaCore和IPA还是好用很多。如果有特定的TF要看,可以去GEO看看有没有这个TFmutant或者knock-out的数据。如果有的话,至少能多点信息帮助判断,不过要注意物种或条件差异。

signaling pathway是什么意思

signaling pathway信号转导通路网络释义1. 信号通路2. 信号通道例句:1.Signaling pathway with extensive consequences 有广泛影响的信号通路2.The importance of the ephrina3/ epha4 signaling pathway was furtheremphasized by the control studies. 对照性研究将进一步增强ephrina3/epha4信号通路的重要性。

metabolic pathways 是什么纸

metabolic pathways不是什么纸,意思是:代谢途径。重点词汇:pathway英['pɑ:θweu026a]释义:n.路,道;途径,路径;神经通路。[复数:pathways]短语:Clinical pathway临床路径;临床途径;又称临床程序;路径。例句:用作名词(n)The pathway was rough and covered with little stones.这条路高低不平,铺满了小石头。Pipe is a communication conduit or pathway with two ends.管道是一通讯管道或者是有两端的通路。

pathway way path 这三个单词有什么区别?

你好,很高兴回答你的问题区别如下path:乡间小路,林间小径(范围小)pathway:路,道;途径,路径(范围大)way道路,途径,路线, 方式方法(除了路本身,还有引申义)

pathways的意思是什么

pathways的意思是:n.小路;小径(pathway的复数)。pathways的意思是:n.小路;小径(pathway的复数)。pathways的例句是Whatotherefferentpathwaysareinoledintheomitingresponse?呕吐反射中还涉及到什么别的传出通路。一、网络释义点此查看pathways的详细内容 分支...MasterofMusic(MMus)音乐硕士Pathways分支TheMMusoffersthefollowingspecialistpathways:音乐硕士有5个研究分支方向...二、例句Whatotherefferentpathwaysareinoledintheomitingresponse?呕吐反射中还涉及到什么别的传出通路?Byembolizingthevein,bloodflowisredirectedtootherhealthypathways.通过栓塞了静脉,血流被引导进入其它健康的通路中。Manyofthecellularbiosyntheticpathwayswerefirstelucidated.首次阐明了许多细胞内生物合成的途径。Gapjunctionsserveaspathwaysofintercellularcommunication.间隙连接是细胞间交流的途径。pathways的相关临近词pathway、pathwaymetabolic、pathwayclassical、pathwayproperdin、pathwayglycerate、pathwayamphibolic、Pathwaymanagement、pathwayglycolytic、pathwaydependence、pathwayalternative、pathwayglucuronate点此查看更多关于pathways的详细信息

pathways的意思pathways的意思是什么

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pathways的翻译是什么

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请教:如何查找一类蛋白的所在的pathway信息呢?

到cell signaling或epitomics公司的网站输入该蛋白一般如果是常见的都会有它的信号通路信息。如果不常见可能要查阅文献了。希望能帮到你!

请教,David或KEGG 如何对一组基因做pathway分析

David或KEGG 如何对一组基因做pathway分析花青素是一种水溶性色素,可以随着细胞液的酸碱改变颜色。细胞液呈酸性则偏红,细胞液呈碱性则偏蓝。花青素(anthocyanins)是构成花瓣和果实颜色的主要色素之一。经由苯基丙酸类合成路径(phenylpropanoid pathway)和类黄酮生合成途径(flavonoids biosynthetic pathway)生成。影响花青素呈色的因子包括花青素的构造、pH値、共色作用(copigmentation)等。果皮呈色受内在、外在因子和栽培技术的影响。光可增加花青素含量;高温会使花青素降解。花青素为植物二级代谢产物,在生理上扮演重要的角色。花瓣和果实的颜色可吸引动物进行授粉和种子传播 (Stintzing and Carle, 2004)。常见于花、果实的组织中及茎叶的表皮细胞与下表皮层。部分果实以颜色深浅决定果实市场价格。花青素属于酚类化合物中的类黄酮类(flavonoids)。基本结构包含二个苯环,并由一3碳的单位连结(C6-C3-C6)。花青素经由苯基丙酸路径和类黄酮生合成途径生成,由许多酵素调控催化。以天竺葵色素(pelargonidin)、矢车菊素(cyanidin)、花翠素(delphinidin)、芍药花苷配基(peonidin)、矮牵牛苷配基 (petunidin)及锦葵色素(malvidin)六种非配醣体(aglycone)为主。花青素因所带羟基数(-OH)、甲基化(methylation)、醣基化(glycosylation)数目、醣种类和连接位置等因素而呈现不同颜色 (范和邱, 1998)。颜色的表现因生化环境条件的改变,如受花青素浓度、共色作用、液胞中pH値的影响 (Clifford, 2000)。本文目的为了解影响花青素生合成的因子,以作为田间栽培管理的参考。橙色和黄色是胡萝卜素的作用。1910年在胡萝卜中发现了β-胡萝卜素,以后共发现另外2种胡萝卜素异构体,分别是:α、β、γ三种异构体。1958年β-胡萝卜素获得专利(US2849495,1958年8月26日,专利权人:Hoffmann La Roche),目前主要从海洋中提取,也可人工合成。自然界有超过300种不同的花青素。他们来源于不同种水果和蔬菜如紫甘薯、越橘、酸果蔓、蓝莓、葡萄、接骨木红、黑加仑、紫胡罗卜和红甘蓝、颜色从红到蓝。这些花青素主要包含飞燕草素(Delchindin)、矢车菊素(Cyanidin)、 牵牛花色素(Petunidin)、芍药花色素(Peonidin).花青素颜色随PH值发生变化,从当PH值为3时的覆盆子红到当PH值为5时的深蓝莓红。在大多数应用中,这些色素具有良好的光、热和PH稳定性,并且能够承受巴氏和UHT热处理。花青素广泛地应用在饮料、糖果、果冻和果酱中。紫甘薯花青素在不同PH值下的颜色变化见右下图:紫甘薯花青素在不同PH值下的颜色变化近年来对作为多酚的花青素对健康可能带来的好处的关注越来越集中。将来花青素的这种特性在功能食品和保健食品中有可能得到日益应用。目前市场上有比较成熟的花青素产品,这些花青素主要是越橘花青素、蓝莓花青素、蔓越橘花青素、接骨木花青素、黑莓花青素和黑豆皮花青素等,含量均为25%或40%。国内西安天一生物技术有限公司的 薛西峰先生做了详细的提取工艺研究,并于2001年开始大规模生产25%的花青素成品。

EMP途径(Embden-Meyerhof-Parnas pathway)

【答案】:又称糖酵解途径(glycolysis)或己糖二磷酸途径(bexose diphosphate pathway),是绝大多数生物所共有的一条主流代谢途径。它以一分子葡萄糖为底物,约经10步反应而产生2分子丙酮酸,2分子NADH+H+和2分子ATP的过程。

东北大学pathway项目下offer快吗

应该还可以。Pathway项目基本上属于宽进严出的项目。Pathway项目是美国东北大学针对国际学生开设的语言桥梁课程项目,针对的学生包括本科和研究生两个阶段。在完成了pathway项目的学习之后,同学们可以进入东北大学的常规本科、研究生项目进行学习。部分英语能力较为薄弱的同学,选择先就读pathway项目,进行适应性学习后,再转入普通项目。在国内相当多的宣传中,也称pathway项目为“双录取项目”。和其他大学的语言桥梁项目比较起来,东北大学的pathway项目是难得的良心项目,可以在毕业后直接入学东北,又可以转学前往其他美国前一百位的大学。而且Pathway项目非常符合我们在国内常说的“宽进严出”的标准

EPIC逃脱者2、Pathway免费领取教程

EPIC平台下周即将送出两款免费游戏,分别是逃脱者2、和Patnway,可能很多玩家还不清楚,下面一起来看看“EPIC逃脱者2、Pathway免费领取教程”吧。EPIC逃脱者2、Pathway免费领取教程随着《方舟:生存进化》的免费领取开启,连续送出多款优质大作的Epic典藏活动宣告正式结束,并回归到此前的传统游戏赠送模式。因此下周Epic商城免费游戏也已揭晓,为战略回合制游戏《Pathway》和沙盒策略游戏《逃脱者2》。领取时间为6月18日晚11点到6月25日晚11点。《Pathway》是一款回合制策略游戏,让玩家沉浸在 20 世纪早期的通俗冒险故事背景中,体验易上手、快节奏,且趣味无穷的组队战斗体验。疾跑寻找掩体、侧翼包抄敌人,并利用团队的特殊能力来扭转战局,让你转败为胜!诡计、偷盗、打架以及逃脱!当你在《逃脱者2》中回到当一名囚犯的生活时,现在也该通过多玩家模式从世界上最艰苦的监狱中逃脱出来了。探索截至目前最大的监狱,该监狱建有多层地板、屋顶、通风口和地下隧道。你的监狱逃脱危险举动将带你从寒冷的城堡冻原,乘坐火车疾驰的穿过沙漠,直至最后边界!

GO和Pathway富集分析的背景基因集

功能(GO)或者通路(Pathway)富集分析时,都会涉及到 Background; 做分析时,分析工具会提供一些数据供使用者选择或者使用自定义的gene list。 例如,在RNAseq或Microarray;有时候工具提供的 Background时物种所有的基因,现在也没有同一的标准用来自己构建Background。 # Background 构造方法: # 两个概念+例子 Background frequency:Background 基因集包含注释到某个GO term的基因数目。 sample frequency:需要分析的gene 集包含注释到某个GO term的基因数目。 一个例子,现有S. cerevisiae(现注释有6442个基因)的10个基因需要做富集分析,如果这个10基因有5个基因注释到了GO term-DNA修复(S. cerevisiae有100个基因注释到DNA修复 );那么现在DNA修复的样本频率(sample frequency)是5/10;背景频率(background frequency)就是100/6442。 例子中,10个基因是确定的;使用全基因组注释的基因是6442;若是检测中只检测到5000个基因,那么Background gene集选用5000,背景频率也会变化(100 个DNA修复相关的基因都被检测到了),在统计检验时P值大小也会变化。除此之外,100 个DNA修复相关的基因也可能不会全部都在检测结果中。 GO term或Pathway 是否在实验结果的差异基因集中富集常使用的统计学检验基于超几何、卡方或二项式分布。基于基因组中基因注释到某个GO term的概率不变,查看差异基因集有多少基因可以注释到同一个GO term, 从而得到P值。 # Background 构造方法讨论 参考:

如何看go数据库中查出来的pathway,是否与肿瘤相关

你把肿瘤吃了就可以了

general pathway什么意思

意思是:一般途径

美国东北大学桥梁课程 pathway 到底可靠吗

1、美国东北大学桥梁课程 pathway 可靠。2、桥梁课程 pathway和双录取差不多,没有什么本质区别,就是先学习语言,合格后再升读本校的相应专业。3、美国不少学校都有类似的桥梁课程 pathway,这既为学校保证了生源的数量和质量,也为学校的培训项目提供培训生源和盈利机会。4、报读桥梁课程 pathway可以先把语言学好,相对来说更容易适应学校的学习和生活。只要是经济条件允许则是不错的选择。

如何在KEGG数据库中查找关注pathway

1.打开KEGG数据库首页,链接如下:http://www.genome.jp/kegg/,如下所示:点击“KEGG PATHWAY”字样链接,可见如下界面:一直往下看,会发现KEGG数据针对pathway做了分类,主要包含Metabolism、Genetic Information Processing、Environmental Information Processing、Cellular Process、Organismal Systems、Human Diseases、Drug Development七个方向,并针对每个方向还有更为细致的分类,例如Metabolism包含Carbohydratemetabolism、Energy metabolism、Lipid metabolism等,各位看官可以根据您的研究方向或感兴趣通路选择具体的pathway进行查看。 2.假如我们关注Carbohydrate metabolism下的Pentose phosphate pathway,点击后获得如下界面:其中最上面的Reference pathway表示我们目前查看的通路是所有物种通用的pathway,下面的一段文字是对这个pathway的介绍,再下面网络图显示此pathway具体信息。其中带有Pentosephosphate pathway字样的方框点击开可发现对这个通路的其他信息介绍,同时可看到这个通路的ID(map00030),这个用map开头+数字组成的ID表示所有物种通用的通路ID,如果是某一特定物种的ID,会以该物种的3个字母简写名字+数字组成,例如hsa00030。在网络图中方框表示的是参与反应的酶,例如1.1.1.47,这是酶的ECnumber,国际酶学委员会赋予的编号。小圆圈表示化学反应中的化合物,例如beta-D-Glucose(C00221)。箭头代表的是反应方向,虚线表示此反应可以通过中间产物或其中途径发生联系。大椭圆表示与此通路相关的另一个pathway。如果您想要只关注human的Pentose phosphate pathway,就可以在Reference pathway处进行选择,之后点击Go即可。这个时候您会发现在第一行显示与不选择物种时有一定区别,会标记为human信息,同时点击网络图中的带有Pentose phosphate pathway的方框,里面会有human的这个通路的信息,包含了human该通路的pathway ID(hsa00030)和介绍。网络图本身也有变化,部分方框为浅绿色,其他不变。其中浅绿色方框为人类含有的酶,例如3.1.1.17,把鼠标放在上面会有相关信息显示。白色方框的酶在人类中不含有,把鼠标放在上面不会有任何信息显示。浅绿色方框可以点击开查看详细信息,例如点击3.1.1.17,获得如下界面,Entry为该酶在KEGG数据库中的ID,Gene name为此酶的简化名,Difinition为此酶的通用名字EC number,KO是在KEGG数据库中该酶的同源序列号,Pathway中罗列出了该酶参与的通路,除此之外,还显示很多其他信息,例如编码该酶的三级结构(Structure)、基因序列(NT seq)和氨基酸序列(AA seq)等信息。注意哦,上图的右上角,有一个Help字样,如果您对此页面中信息不清楚,可以点击Help,页面里对每项都有相应的详细介绍。如果您知道自己关注通路的ID,可以直接在第一步的基础上直接搜索,也可以获得特定物种的通路信息,例如上面的human的Pentosephosphate pathway,ID为hsa00030,我们就可以直接用这个ID进行搜索,具体操作为在步骤1的第二幅图中填入ID号,选择物种has,点击Go即可,页面如下:在出现的页面中,点击hsa00030这个通路即可。

信号通路(signaling pathway)

【答案】:信号通路(signaling pathway):细胞接受外界信号,通过一整套特定的机制,将胞外信号转导为胞内信号,最终调节特定基因的表达,引起细胞的应答反应,这种反应系列称之为细胞信号通路。细胞识别是通过各种不同的信号通路实现的。

生物中的pathway是什么意思呢,是一些相关的基因或相关的蛋白质吗

原材料被a基因编码的蛋白质1转化为产物A,再被b基因编码的蛋白质2转化为产物B…以此类推这个过程叫做pathway,中断任何一环都无法继续

path与pathway有什么不同?分别怎样使用?

区别不大,后者专指路径,一般不用于其它意义.另,后者是比PATH更正式的路,比如踩出来的路一般不用 pathway.

什么是新西兰Pathway学生签证

“Pathway学生签证”将会允许国际学生在新西兰一些特定的教育机构就读三个具有时间连贯性的、不同的课程项目(例如预科、本科、研究生文凭),并会在同一张签证页上体现。在一所教育机构学习或者在具有合作关系的不同教育机构学习都可以获得该类学生签证,有效期最长可达5年!

澳洲留学读master的pathway课程

请问你在哪个学校就读呢?

美国俄勒冈州立大学PATHWAY是一个什么样的学习阶段?

pathway是桥梁的意思。“桥梁课程”面向两类学生,一是语言成绩未达到要求的学生,二是希望强化英语学习的学生。“桥梁课程”一般是小班教学,学生通过半年到一年的学习,能很快适应学习环境,提高语言表达能力,同时通过修读一些学术课程,减轻正式课程的负担。学生完成全部学业和实习,可获得该校与直录生同等的国家承认本科或硕士学历。

生物中的pathway是什么意思呢,是一些相关的基因或相关的蛋白质吗?谢谢

传递途径

Pathway新手入门指南

Pathway已经在EPIC平台开启了免费领取,很多新手玩家可能不知道这款游戏该怎么玩,下面一起来看看“克里夫ak”分享的Pathway新手入门指南吧。Pathway新手入门指南 玩法技巧分享作为一个slg战旗类游戏,pathway的难度可以说偏低,偏休闲。虽然说一开始上手有点不明所以,毕竟加入了汽油和大地图走位的概念,但是熟悉了游戏的方式之后还是非常有趣。如果能有闲情雅致看剧情的话,也是挺有意思的。汽油非常的稀有,所以尽量不要在走过的格子上走回头路浪费汽油。最重要的点位就是帐篷,可以回满血和甲。其次就是友军招募点,可以增加一个队友。因为一开始只有2人参战,最多可以招募到4人小队。当小队人满之后再招募,就出现选项可以踢掉其中一个。打架点位不推荐绕远路去踩,毕竟走两步就打一次架,不差那一场。问号点位有可能给各种奖励,也有可能打架,还可能给新友军,顺路可以踩一下,但是绕远专门为了踩它就算了。因为每次大地图都是随机刷新的,所以出来地图之后,在脑子里要有一个大概的行走方向,不要浪费步数来回走。基本就是沿着有帐篷和友军招募点的路线来走。战棋的战斗难点在于每次进入地图敌人位置的随机性以及我方队员的可视范围。整体上感觉有点类似xcom。通过掩体和墙,以及各种风筝走位,如何做到尽量无伤,我就不说了,相信大家都会有自己的心得。初步看来敌方的ai偏低,经常做不出最优选择。不知道是不是难度调得太低的缘故。一个四人小队要做到轻松过关,基本的配置应该有一个回血的,一个裁缝,然后最好有一个狙击手。AOE前期是比较稀有,初步看来除了电磁枪可以打一条线以外(很难触发),也只有手榴弹了。手榴弹是消耗品,但是绝对是攻坚利器,个人猜想可以通过反复刷关积累的方式来使手榴弹不再稀有。特殊技能放一次要很久才能放第二次,所以不能常规使用。由于血和甲谁用都一样,所以最好的恢复方式是战后恢复,战斗中迅速吃掉敌人避免战斗拉长造成的意外损失是重点,奶妈其实没啥用;露天地图狙击类武器比较有优势(超远距离,我目前已经弄出一个15射程的神狙···),密闭地图(陵墓)霰弹比较有优势(敌人经常为了找你掩体会聚成一团,喷子一发爽),突击比较均衡。

path pathway 的区别

pathn.小路,路;路线,路程;〈比喻〉(人生的)道路;(思想,行为,生活的)途径We followed the path along the clifftops...我们沿着悬崖顶上的小路走。pathwayn.路,道;途径,路径Richard was coming up the pathway.理查德正沿着小路走过来。

什么是GO富集分析,常说的GO功能分析、功能分析、Pathway分析是什么意思?

GeneOntology可分为分子功能(MolecularFunction),生物过程(biologicalprocess)和细胞组成(cellularcomponent)三个部分。蛋白质或者基因可以通过ID对应或者序列注释的方法找到与之对应的GO号,而GO号可对于到Term,即功能类别或者细胞定位。功能富集分析:功能富集需要有一个参考数据集,通过该项分析可以找出在统计上显著富集的GOTerm。该功能或者定位有可能与研究的目前有关。GO功能分类是在某一功能层次上统计蛋白或者基因的数目或组成,往往是在GO的第二层次。此外也有研究都挑选一些Term,而后统计直接对应到该Term的基因或蛋白数。结果一般以柱状图或者饼图表示。1.GO分析根据挑选出的差异基因,计算这些差异基因同GO分类中某(几)个特定的分支的超几何分布关系,GO分析会对每个有差异基因存在的GO返回一个p-value,小的p值表示差异基因在该GO中出现了富集。GO分析对实验结果有提示的作用,通过差异基因的GO分析,可以找到富集差异基因的GO分类条目,寻找不同样品的差异基因可能和哪些基因功能的改变有关。2.Pathway分析根据挑选出的差异基因,计算这些差异基因同Pathway的超几何分布关系,Pathway分析会对每个有差异基因存在的pathway返回一个p-value,小的p值表示差异基因在该pathway中出现了富集。Pathway分析对实验结果有提示的作用,通过差异基因的Pathway分析,可以找到富集差异基因的Pathway条目,寻找不同样品的差异基因可能和哪些细胞通路的改变有关。与GO分析不同,pathway分析的结果更显得间接,这是因为,pathway是蛋白质之间的相互作用,pathway的变化可以由参与这条pathway途径的蛋白的表达量或者蛋白的活性改变而引起。而通过芯片结果得到的是编码这些蛋白质的mRNA表达量的变化。从mRNA到蛋白表达还要经过microRNA调控,翻译调控,翻译后修饰(如糖基化,磷酸化),蛋白运输等一系列的调控过程,mRNA表达量和蛋白表达量之间往往不具有线性关系,因此mRNA的改变不一定意味着蛋白表达量的改变。同时也应注意到,在某些pathway中,如EGF/EGFR通路,细胞可以在维持蛋白量不变的情况下,通过蛋白磷酸化程度的改变(调节蛋白的活性)来调节这条通路。所以芯片数据pathway分析的结果需要有后期蛋白质功能实验的支持,如Westernblot/ELISA,IHC(免疫组化),overexpression(过表达),RNAi(RNA干扰),knockout(基因敲除),transgene(转基因)等。3.基因网络分析目的:根据文献,数据库和已知的pathway寻找基因编码的蛋白之间的相互关系(不超过1000个基因)。

wood-ljungdahl-pathway是什么意思

The Wood–Ljungdahl pathway is a set of biochemical reactions used by some bacteria and archaea calledacetogens. It is also known as the reductive acetyl-coenzyme A (Acetyl-CoA) pathway.[1] This pathway enables these organisms to use hydrogen as an electron donor, and carbon dioxide as an electron acceptor and as a building block for biosynthesis.In this pathway carbon dioxide is reduced to carbon monoxide and formic acid or directly into a formyl group, the formyl group is reduced to a methyl group and then combined with the carbon monoxide and Coenzyme A to produce acetyl-CoA. Two specific enzymes participate on the carbon monoxide side of the pathway: CO Dehydrogenase andacetyl-CoA synthase. The former catalyzes the reduction of the CO2 and the latter combines the resulting CO with a methyl group to give acetyl-CoA.[1][2]The pathway occurs in bacteria and archaea, e.g. methanogens[3] and in acetate-producing bacteria such asClostridium. Unlike the Reverse Krebs cycle and the Calvin cycle, this process is not cyclic. A recent study of the genomes of a set of bacteria and archaea suggests that the last universal common ancestor (LUCA) of all cells was using the Wood–Ljungdahl pathway in a hydrothermal setting.[4]

rustic pathways为什么那么贵

Rustic Pathways 是美国高端教育游学品牌。既然是品牌,自然价格就贵了。Rustic Pathways is the leader in providing superior quality international community service, education, and adventure programs for students around the world.

Pathways的5个Level你了解多少?

6月20日,来自Y中区Betterman Toastmasters的Lily Liang给头马小伙伴们介绍了Pathways的5个level。Lily把Pathways学习比喻成攻读大学课程,生动形象地展示了每个level的学习内容。 Pathways是头马现行的教育系统,跟大学的课程设置有类似之处。 会员在选路径前需要做一个小测试,通过测试,会员对自己目前擅长的部分,缺失的部分,希望提高的部分,和喜欢的部分有个大概的认知。 Pathways的学习路径就相当于大学的专业,level相当于年级,project相当于大学的课程,分必修课和选修课。 Pathways共有59个项目,完成一条路径至少需要完成14个projects,其中10个必修项目,4个选修项目。 Level 1包含3个必选项目,分别是ice breaker, evaluation and feedback, researching and presenting 。头马官网中写到“Every toastmasters journey starts with a single speech",这个“speech”就是指ice breaker项目。该项目的目标是通过做一个4-6分钟的演讲让俱乐部认识你,并了解你需要的演讲技巧。 完成ice breaker项目后就进入evaluation and feedback项目的学习。 Toastmasters跟英语角最大的区别就在于evaluation环节 。Evaluation对演讲者来说是相当重要的,因此,Pathways把evaluation and feedback作为独立的项目来完成,以更精进的方式让会员学习如何进行评估和反馈。在这个项目中,会员不但接受别人的反馈,同时也要学习如何给予反馈。 Researching and presenting项目可对应旧系统的CC指导手册(Competent Communication)中的CC7 research your topic。 在研究与呈现方面,新教育系统给会员提供更细致全面的指导 。 新教育系统是如何帮助会员了解自己的风格的呢? Pathways主要是通过让会员做演讲和在系统做问卷调查的方式了解自己的领导风格和沟通风格 。值得一提的是,导师在学习当中起到重要的作用,因此,介绍头马导师制度就成了Pathways学习的必修项目。 Level 3包含一个必修项目和两个选修项目 。比如,effective coaching的必修课就是reaching consensus,而选修课的内容则是从13个项目中选择两个来完成。值得一提的是,Pathways的项目大部分是通过做演讲来完成的,但也有部分是通过做功能性角色来完成的。 Level 4需要完成一个必修项目和一个选修项目 。比如,effective coaching路径的必修项目是improvement through positive coaching,共有8个项目可供选修,包括create a podcast, building a social media presence, managing a difficult audience等。 Level 5包含两个必修项目和一个选修项目 。比如,effective coaching的必修项目是high performance leadership和reflect on your path,选修项目包括lessons learned, moderate a panel discussion, ethical leadership等。 有关Pathways的更多学习内容,可关注R中区头马学院NMO系列课程。

HMP途径(bexose monophosphate pathWay)

【答案】:又称已糖一磷酸途径、已糖一磷酸支路(shunt)、戊糖磷酸途径(pentose phosphate pathway)、磷酸葡萄糖酸途径(phosphogluconatepathway)或WD途径(Warburg-Diekens pathway)。其特点是葡萄糖不经EMP途径和TCA循环而得到彻底氧化,并能产生大量NADH+H+形式的还原力以及多种重要中间代谢产物。